More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1424 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 423 aa  869    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  64.69 
 
 		 423 aa  568  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  63.85 
 
 		 432 aa  568  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  64.93 
 
 		 422 aa  565  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  64.45 
 
 		 422 aa  561  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  63.03 
 
 		 422 aa  558  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  63.03 
 
 		 422 aa  556  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  63.01 
 
 		 424 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  63.01 
 
 		 424 aa  553  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  62.77 
 
 		 424 aa  552  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  63.01 
 
 		 424 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  63.01 
 
 		 424 aa  553  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  63.01 
 
 		 424 aa  554  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  64.22 
 
 		 423 aa  553  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  63.01 
 
 		 424 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  62.77 
 
 		 424 aa  552  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  62.29 
 
 		 424 aa  551  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  63.01 
 
 		 424 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  62.53 
 
 		 424 aa  548  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  62.17 
 
 		 424 aa  551  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  60.76 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  61.14 
 
 		 424 aa  542  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  63.33 
 
 		 425 aa  544  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  61.37 
 
 		 426 aa  542  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  61.61 
 
 		 424 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  61.24 
 
 		 420 aa  536  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  62.29 
 
 		 424 aa  535  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  61.61 
 
 		 422 aa  537  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  59.48 
 
 		 427 aa  534  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  59.34 
 
 		 427 aa  533  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  59.95 
 
 		 422 aa  528  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  59.67 
 
 		 427 aa  528  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  59.72 
 
 		 425 aa  528  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  61.43 
 
 		 424 aa  528  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  60.67 
 
 		 421 aa  521  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  57.82 
 
 		 427 aa  521  1e-146  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 423 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  58.29 
 
 		 425 aa  513  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  58.16 
 
 		 427 aa  513  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  56.4 
 
 		 423 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  60.9 
 
 		 423 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  58.63 
 
 		 426 aa  506  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  58.27 
 
 		 422 aa  498  1e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  56.5 
 
 		 425 aa  495  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  57.62 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 425 aa  498  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  57.21 
 
 		 423 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  55.45 
 
 		 423 aa  492  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  57.08 
 
 		 423 aa  493  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  58.16 
 
 		 423 aa  488  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 422 aa  485  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 424 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 428 aa  476  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  54.31 
 
 		 430 aa  476  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  54.35 
 
 		 425 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  54.65 
 
 		 425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  53.61 
 
 		 433 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  52.91 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  53.15 
 
 		 433 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  53.15 
 
 		 433 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  53.32 
 
 		 421 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 427 aa  458  9.999999999999999e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  53.32 
 
 		 421 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  53.38 
 
 		 433 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 425 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  53.15 
 
 		 433 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  52.91 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 424 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3978  seryl-tRNA synthetase  54.46 
 
 		 463 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0426777  normal  0.873279 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 431 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 433 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 433 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 433 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 427 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 433 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 433 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 433 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 431 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 433 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  52.34 
 
 		 433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  52.07 
 
 		 438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 424 aa  451  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1765  seryl-tRNA synthetase  53.32 
 
 		 431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1618  seryl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 427 aa  451  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.697706 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 429 aa  449  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1768  seryl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 430 aa  448  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865452  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0180  seryl-tRNA synthetase  50.88 
 
 		 456 aa  450  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420284  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 427 aa  449  1e-125  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3853  seryl-tRNA synthetase  53.29 
 
 		 435 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 435 aa  449  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 428 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 428 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  53.66 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  51.5 
 
 		 434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>