44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0774 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0774  zinc carboxypeptidase-related protein  100 
 
 		 340 aa  703    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3019  zinc carboxypeptidase-related protein  73.75 
 
 		 340 aa  511  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.266904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1742  zinc carboxypeptidase-related protein  65.77 
 
 		 342 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.212306  hitchhiker  0.00119795 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2718  zinc carboxypeptidase-related protein  66.07 
 
 		 342 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.792819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2643  zinc carboxypeptidase-related protein  66.07 
 
 		 342 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2604  zinc carboxypeptidase-related protein  65.77 
 
 		 342 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1975  Zinc carboxypeptidase-related protein  65.07 
 
 		 342 aa  450  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2354  zinc carboxypeptidase-related protein  65.87 
 
 		 341 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2282  zinc carboxypeptidase-related protein  65.12 
 
 		 346 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.548754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2472  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring)  65.27 
 
 		 341 aa  443  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2903  hypothetical protein  47.87 
 
 		 337 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  43.66 
 
 		 365 aa  295  7e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3538  hypothetical protein  47.54 
 
 		 355 aa  293  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4624  peptidase M14 carboxypeptidase A  43.98 
 
 		 344 aa  289  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.144195 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0051  putative carboxypeptidase  44.8 
 
 		 365 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0840  zinc carboxypeptidase-related protein  42.86 
 
 		 344 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.387339  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4525  zinc carboxypeptidase-related protein  42.86 
 
 		 344 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.988976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4289  hypothetical protein  43.03 
 
 		 340 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4190  putative metalloproteinase (zinc carboxypeptidase-related protein)  43.73 
 
 		 343 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2025  putative carboxypeptidase  48.92 
 
 		 373 aa  266  5e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3437  hypothetical protein  41.82 
 
 		 365 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1285  hypothetical protein  41.52 
 
 		 356 aa  262  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0368  zinc-binding domain-containing protein  40.12 
 
 		 363 aa  242  7e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.499164  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  25 
 
 		 821 aa  53.5  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1751  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.42 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.94 
 
 		 889 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  29.41 
 
 		 306 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5494  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.5 
 
 		 218 aa  46.2  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136631  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1873  hypothetical protein  31.52 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1549  hypothetical protein  23.24 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.270462  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.88 
 
 		 606 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.88 
 
 		 606 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2975  hypothetical protein  32.38 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  27.27 
 
 		 305 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1347  hypothetical protein  25.78 
 
 		 306 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  24.22 
 
 		 309 aa  43.9  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1433  zinc carboxypeptidase-related protein  28.68 
 
 		 320 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.54 
 
 		 1074 aa  43.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.88 
 
 		 618 aa  43.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1892  hypothetical protein  19.03 
 
 		 364 aa  43.1  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.88 
 
 		 506 aa  42.7  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2374  hypothetical protein  26.77 
 
 		 309 aa  42.4  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.25 
 
 		 599 aa  42.4  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06119  zinc carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08790)  29.21 
 
 		 586 aa  42.4  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.044822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>