25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2025 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2025  putative carboxypeptidase  100 
 
 		 373 aa  771    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0051  putative carboxypeptidase  67.16 
 
 		 365 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4190  putative metalloproteinase (zinc carboxypeptidase-related protein)  57.49 
 
 		 343 aa  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4289  hypothetical protein  56.89 
 
 		 340 aa  381  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0840  zinc carboxypeptidase-related protein  56.13 
 
 		 344 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.387339  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4525  zinc carboxypeptidase-related protein  56.13 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.988976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1285  hypothetical protein  55.06 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3437  hypothetical protein  53.91 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4624  peptidase M14 carboxypeptidase A  54.29 
 
 		 344 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.144195 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3538  hypothetical protein  50.89 
 
 		 355 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2903  hypothetical protein  45.37 
 
 		 337 aa  311  9e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  44.96 
 
 		 365 aa  306  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0368  zinc-binding domain-containing protein  47.71 
 
 		 363 aa  280  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.499164  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1742  zinc carboxypeptidase-related protein  46.47 
 
 		 342 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.212306  hitchhiker  0.00119795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2472  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring)  48.07 
 
 		 341 aa  269  7e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2643  zinc carboxypeptidase-related protein  46.47 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2718  zinc carboxypeptidase-related protein  46.47 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.792819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2354  zinc carboxypeptidase-related protein  46.43 
 
 		 341 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2604  zinc carboxypeptidase-related protein  47.81 
 
 		 342 aa  265  8e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0774  zinc carboxypeptidase-related protein  48.92 
 
 		 340 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2282  zinc carboxypeptidase-related protein  48.07 
 
 		 346 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.548754  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1975  Zinc carboxypeptidase-related protein  46.87 
 
 		 342 aa  261  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3019  zinc carboxypeptidase-related protein  49.04 
 
 		 340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.266904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.82 
 
 		 500 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.76 
 
 		 453 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>