More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4342 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A4537  glutamate racemase  99.62 
 
 
260 aa  524  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00762513  hitchhiker  4.62365e-11 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4342  glutamate racemase  100 
 
 
260 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  5.13683e-07  normal  0.657896 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4463  glutamate racemase  99.23 
 
 
260 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  1.70429e-05  hitchhiker  5.95997e-12 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4373  glutamate racemase  99.23 
 
 
260 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  5.18556e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4460  glutamate racemase  99.23 
 
 
260 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00398465  hitchhiker  0.000459053 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4049  glutamate racemase  91.54 
 
 
262 aa  471  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  9.85082e-05  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03801  hypothetical protein  91.15 
 
 
285 aa  468  1e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000631879  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5431  glutamate racemase  91.15 
 
 
262 aa  468  1e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000134929  normal  0.011427 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03852  glutamate racemase  91.15 
 
 
285 aa  468  1e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000349509  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4414  glutamate racemase  91.15 
 
 
262 aa  468  1e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  3.86576e-06  hitchhiker  0.00203904 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4019  glutamate racemase  91.15 
 
 
285 aa  468  1e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  5.48786e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4508  glutamate racemase  90.77 
 
 
285 aa  464  1e-130  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.39162e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4201  glutamate racemase  90.77 
 
 
285 aa  464  1e-130  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.37876e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4453  glutamate racemase  90.77 
 
 
262 aa  465  1e-130  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  1.14143e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4019  glutamate racemase  89.23 
 
 
283 aa  448  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  3.94018e-08  decreased coverage  0.00413197 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4769  glutamate racemase  75.77 
 
 
287 aa  414  1e-115  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  5.10238e-07  normal  0.0239463 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0199  glutamate racemase  76.36 
 
 
285 aa  416  1e-115  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000337886  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0193  glutamate racemase  76.36 
 
 
285 aa  413  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00438881  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0133  glutamate racemase  74.81 
 
 
290 aa  405  1e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00475482  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0143  glutamate racemase  75.29 
 
 
287 aa  399  1e-110  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.47214e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4072  glutamate racemase  74.9 
 
 
287 aa  398  1e-110  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  3.83263e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3782  glutamate racemase  73.26 
 
 
295 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  1.54676e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0124  glutamate racemase  74.17 
 
 
240 aa  364  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  2.84892e-07  normal  0.0743553 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1453  glutamate racemase  47.84 
 
 
267 aa  250  2e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.010969  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002158  glutamate racemase  52.94 
 
 
267 aa  244  9e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  4.702e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0629  glutamate racemase  45.38 
 
 
268 aa  237  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0165  glutamate racemase  51.35 
 
 
268 aa  234  1e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.22262e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0194  glutamate racemase  53.45 
 
 
266 aa  233  2e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.0481e-05  normal  0.0134241 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0179  glutamate racemase  48.67 
 
 
272 aa  233  2e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  3.77093e-09  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0174  glutamate racemase  48.29 
 
 
272 aa  232  4e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000222817  normal  0.0305567 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0180  glutamate racemase  46.97 
 
 
273 aa  230  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.77762e-05  normal  0.815538 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0207  glutamate racemase  48.67 
 
 
302 aa  228  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2884  glutamate racemase  47.89 
 
 
265 aa  228  8e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00254237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4709  glutamate racemase  47.31 
 
 
266 aa  227  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.83223e-06  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00256  glutamate racemase  49.03 
 
 
268 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3509  glutamate racemase  46.01 
 
 
268 aa  226  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00151792  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0153  glutamate racemase  42.59 
 
 
274 aa  224  7e-58  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  hitchhiker  0.000846216  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2339  glutamate racemase  55.09 
 
 
265 aa  224  8e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.77868e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4177  glutamate racemase  45.15 
 
 
274 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  4.86061e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0181  glutamate racemase  50.23 
 
 
274 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  2.4601e-06  hitchhiker  0.0092557 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0177  glutamate racemase  50.23 
 
 
274 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000496539  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0232  glutamate racemase  45.19 
 
 
277 aa  215  5e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  5.08837e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4337  glutamate racemase  50.23 
 
 
282 aa  214  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  3.57145e-08  hitchhiker  1.47212e-06 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4075  glutamate racemase  49.77 
 
 
274 aa  214  1e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000696712  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0126  glutamate racemase  44.66 
 
 
259 aa  209  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.53552e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0139  glutamate racemase  49.77 
 
 
266 aa  200  2e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.84264e-07  normal  0.0718658 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3824  glutamate racemase  49.77 
 
 
264 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0482316  normal  0.0601496 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1338  glutamate racemase  44.23 
 
 
267 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.537109  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1207  glutamate racemase  46.4 
 
 
268 aa  182  4e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1799  glutamate racemase  42.91 
 
 
277 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.627391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1613  glutamate racemase  46.33 
 
 
272 aa  178  6e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.572761  normal  0.655413 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0781  glutamate racemase  44.21 
 
 
291 aa  178  6e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.264959 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1326  glutamate racemase  43.24 
 
 
287 aa  176  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219508  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5384  glutamate racemase  43.88 
 
 
265 aa  175  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.572623 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0827  glutamate racemase  42.47 
 
 
271 aa  175  6e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0389659  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2251  glutamate racemase  44.49 
 
 
290 aa  175  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0194593  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2226  glutamate racemase  49.54 
 
 
281 aa  174  1e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3847  glutamate racemase  42.31 
 
 
305 aa  172  6e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.671121  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1780  glutamate racemase  40.32 
 
 
264 aa  171  8e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0357  glutamate racemase  44 
 
 
312 aa  171  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.264447  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3000  glutamate racemase  41.67 
 
 
270 aa  170  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1269  glutamate racemase  40.3 
 
 
274 aa  169  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1996  glutamate racemase  42.27 
 
 
278 aa  168  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0055  glutamate racemase  41.28 
 
 
272 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0124044  normal  0.0422358 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3217  glutamate racemase  45.24 
 
 
291 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3541  glutamate racemase  45.24 
 
 
286 aa  166  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.476153 
 
 
-
 
NC_004310  BR1195  glutamate racemase  39.26 
 
 
277 aa  164  1e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1157  glutamate racemase  39.26 
 
 
277 aa  163  2e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.553374  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3412  glutamate racemase  45.66 
 
 
286 aa  162  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  39.04 
 
 
271 aa  161  8e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0396  glutamate racemase  41.44 
 
 
279 aa  161  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.971705 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1768  glutamate racemase  43.09 
 
 
266 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3694  glutamate racemase  44.09 
 
 
264 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1916  glutamate racemase  38.17 
 
 
269 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2160  glutamate racemase  39 
 
 
267 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0454609  normal  0.382904 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1516  glutamate racemase  40.19 
 
 
271 aa  152  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1949  glutamate racemase  41.67 
 
 
266 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.513252  normal  0.377399 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  39.53 
 
 
268 aa  152  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  41.52 
 
 
275 aa  152  6e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  40.16 
 
 
265 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1606  glutamate racemase  44.95 
 
 
265 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1645  glutamate racemase  44 
 
 
265 aa  150  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  39.76 
 
 
265 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  38.6 
 
 
268 aa  149  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  40.16 
 
 
265 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  43.38 
 
 
263 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  40.24 
 
 
263 aa  148  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  41.94 
 
 
263 aa  147  2e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  39.55 
 
 
292 aa  145  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  41.59 
 
 
254 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  41.94 
 
 
265 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1317  glutamate racemase  44.09 
 
 
271 aa  142  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  40.73 
 
 
265 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  40.19 
 
 
282 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  40.37 
 
 
271 aa  139  5e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  36.52 
 
 
295 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  39.91 
 
 
288 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1295  glutamate racemase  40.28 
 
 
276 aa  136  3e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  33.6 
 
 
270 aa  136  3e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  3.06047e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  39.31 
 
 
265 aa  136  3e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.106056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>