More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2683 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2683  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 272 aa  559  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000101037  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2861  pyrroline-5-carboxylate reductase  69.49 
 
 		 272 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0351901  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3354  pyrroline-5-carboxylate reductase  64.34 
 
 		 272 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1337  pyrroline-5-carboxylate reductase  68.01 
 
 		 272 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00148395  hitchhiker  0.00000622504 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1331  pyrroline-5-carboxylate reductase  66.91 
 
 		 272 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987807 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3184  pyrroline-5-carboxylate reductase  68.01 
 
 		 272 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000288321  normal  0.0381756 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  68.01 
 
 		 272 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000943261  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3026  pyrroline-5-carboxylate reductase  68.01 
 
 		 272 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000130483  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2688  pyrroline-5-carboxylate reductase  66.54 
 
 		 272 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.452831  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1231  pyrroline-5-carboxylate reductase  66.18 
 
 		 272 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000109487  normal  0.438718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1263  pyrroline-5-carboxylate reductase  64.71 
 
 		 272 aa  371  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00228679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1193  pyrroline-5-carboxylate reductase  64.71 
 
 		 272 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0154607  normal  0.507121 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1192  pyrroline-5-carboxylate reductase  64.34 
 
 		 272 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000775485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1126  pyrroline-5-carboxylate reductase  69.12 
 
 		 272 aa  364  1e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000450771  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1136  pyrroline-5-carboxylate reductase  63.97 
 
 		 272 aa  358  4e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273851  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2478  pyrroline-5-carboxylate reductase  61.76 
 
 		 271 aa  326  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0810404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002455  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.57 
 
 		 272 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03579  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.21 
 
 		 272 aa  286  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0542  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.47 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0647728  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3719  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.82 
 
 		 273 aa  265  7e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0012  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.06 
 
 		 272 aa  262  4.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.18 
 
 		 274 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.439498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03299  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.86 
 
 		 273 aa  253  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.25 
 
 		 273 aa  251  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3608  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.25 
 
 		 273 aa  249  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3451  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.89 
 
 		 273 aa  246  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00381464  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0759  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.15 
 
 		 273 aa  246  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1285  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.75 
 
 		 271 aa  245  6e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0829  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.52 
 
 		 273 aa  245  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.814705  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0831  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.15 
 
 		 273 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0139  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.15 
 
 		 273 aa  242  6e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280777 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.02 
 
 		 285 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.7 
 
 		 275 aa  221  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0774  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.32 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3664  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.89 
 
 		 273 aa  219  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.95 
 
 		 274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.6 
 
 		 275 aa  212  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.29 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.37 
 
 		 272 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.18 
 
 		 274 aa  209  5e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.18 
 
 		 274 aa  208  8e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.74 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.47 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.98 
 
 		 276 aa  205  6e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.35 
 
 		 273 aa  205  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.29 
 
 		 273 aa  204  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.89 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.58 
 
 		 282 aa  202  7e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.85 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.16 
 
 		 274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.97 
 
 		 272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.85 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.74 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.59 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.63 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 		 273 aa  193  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.89 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.19 
 
 		 277 aa  192  7e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.83 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.71 
 
 		 285 aa  189  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  37.13 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.03 
 
 		 271 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.43 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3016  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.16 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0761  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.3 
 
 		 292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.26 
 
 		 271 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.87 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.87 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0469003 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  36.17 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 		 270 aa  175  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01991  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.02 
 
 		 286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.13 
 
 		 282 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.06 
 
 		 272 aa  172  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.5 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.87 
 
 		 270 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.27 
 
 		 279 aa  169  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.87 
 
 		 270 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.87 
 
 		 270 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  38.87 
 
 		 262 aa  168  9e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.45 
 
 		 269 aa  168  9e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2500  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.04 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000695337  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.58 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.15 
 
 		 272 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.41 
 
 		 278 aa  165  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.08 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.98 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.43 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.07 
 
 		 280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  37.36 
 
 		 262 aa  161  9e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.13 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>