102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0018 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0018  YidE/YbjL duplication  100 
 
 
529 aa  1054  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0175151  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4089  hypothetical protein  31.88 
 
 
553 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4034  hypothetical protein  31.69 
 
 
553 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4138  hypothetical protein  31.88 
 
 
553 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4017  hypothetical protein  31.88 
 
 
553 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.837569  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0018  hypothetical protein  32.84 
 
 
553 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5115  hypothetical protein  32.84 
 
 
561 aa  281  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.44003 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4048  hypothetical protein  32.84 
 
 
553 aa  281  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.926821  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3896  hypothetical protein  32.84 
 
 
553 aa  281  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03512  hypothetical protein  32.84 
 
 
553 aa  281  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4191  hypothetical protein  32.84 
 
 
553 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03568  hypothetical protein  32.84 
 
 
553 aa  281  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0019  YidE/YbjL duplication  32.84 
 
 
553 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4196  hypothetical protein  31.88 
 
 
553 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4236  hypothetical protein  32.84 
 
 
553 aa  280  4e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2351  YidE/YbjL duplication  33.15 
 
 
531 aa  278  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  7.18232e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0870  YidE/YbjL duplication  31.7 
 
 
534 aa  270  3e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0015  hypothetical protein  31.31 
 
 
553 aa  262  9e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0050  hypothetical protein  31.16 
 
 
552 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.259185 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0036  hypothetical protein  30.69 
 
 
552 aa  255  1e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0042  hypothetical protein  30.5 
 
 
552 aa  248  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3793  hypothetical protein  29.36 
 
 
552 aa  246  7e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212534  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4141  hypothetical protein  29.36 
 
 
552 aa  245  1e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0013  hypothetical protein  29.36 
 
 
552 aa  245  1e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1470  hypothetical protein  30.15 
 
 
552 aa  240  4e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0186692  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2550  TrkA-C:YidE/YbjL duplication  31.63 
 
 
546 aa  235  2e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.72993e-06  hitchhiker  6.9423e-13 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0856  YidE/YbjL duplication  33.58 
 
 
537 aa  230  5e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.682157  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1568  YidE/YbjL duplication  30.47 
 
 
559 aa  227  3e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0607  YidE/YbjL duplication  31.46 
 
 
541 aa  226  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.617712  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1016  Trk family potassium uptake protein  30.8 
 
 
546 aa  226  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0663746  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3636  YidE/YbjL duplication  30.67 
 
 
546 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  3.80153e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1965  YidE/YbjL duplication  28.65 
 
 
549 aa  223  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103303  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2711  YidE/YbjL duplication  28.65 
 
 
549 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129476  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1848  YidE/YbjL duplication  31.93 
 
 
545 aa  214  2e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1411  hypothetical protein  29.89 
 
 
561 aa  211  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.540338 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0891  YidE/YbjL duplication  28.6 
 
 
533 aa  197  5e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2318  YidE/YbjL like transporter  30.45 
 
 
544 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0562  hypothetical protein  28.65 
 
 
558 aa  193  6e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1280  YidE/YbjL duplication  31.09 
 
 
531 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0037  YidE/YbjL duplication  30.9 
 
 
531 aa  185  2e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1552  YidE/YbjL duplication  30.25 
 
 
544 aa  183  7e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1476  YidE/YbjL duplication  28.33 
 
 
530 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0715  hypothetical protein  26.99 
 
 
558 aa  174  4e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2029  hypothetical protein  27.02 
 
 
560 aa  171  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0129834  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1553  YidE/YbjL duplication  27.94 
 
 
529 aa  168  3e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046185 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02636  hypothetical protein  25.05 
 
 
560 aa  165  1e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2485  hypothetical protein  26.4 
 
 
561 aa  158  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00858  hypothetical protein  26.4 
 
 
561 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0950  hypothetical protein  26.4 
 
 
561 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0874  hypothetical protein  26.4 
 
 
561 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938397  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2749  hypothetical protein  26.4 
 
 
561 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537739 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0919  hypothetical protein  26.4 
 
 
561 aa  158  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1001  hypothetical protein  26.4 
 
 
561 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588292  normal  0.272604 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00852  hypothetical protein  26.4 
 
 
561 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2795  YidE/YbjL duplication  26.4 
 
 
561 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0943  hypothetical protein  26.39 
 
 
561 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1004  hypothetical protein  26.39 
 
 
561 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492051  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1023  hypothetical protein  26.39 
 
 
561 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0907  hypothetical protein  26.39 
 
 
561 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1362  hypothetical protein  26.16 
 
 
561 aa  157  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1559  hypothetical protein  26.16 
 
 
562 aa  157  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2649  hypothetical protein  26.16 
 
 
562 aa  157  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1639  hypothetical protein  26.16 
 
 
562 aa  157  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258561 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2734  hypothetical protein  26.16 
 
 
562 aa  157  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0975  hypothetical protein  26.39 
 
 
561 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2293  hypothetical protein  24.41 
 
 
562 aa  155  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1686  hypothetical protein  25.72 
 
 
562 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0560693  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1952  hypothetical protein  25.54 
 
 
562 aa  154  3e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00456321  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003763  TrkA Potassium channel-family protein  25.65 
 
 
511 aa  152  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  4.4665e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1586  YidE/YbjL duplication  24.64 
 
 
563 aa  151  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4141  YidE/YbjL duplication  27.27 
 
 
530 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2393  hypothetical protein  25.62 
 
 
562 aa  150  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2143  hypothetical protein  27.09 
 
 
562 aa  148  2e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3956  YidE/YbjL duplication  27.1 
 
 
530 aa  146  8e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0788  YidE/YbjL duplication  26.82 
 
 
560 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.442707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1851  YidE/YbjL duplication  25.09 
 
 
561 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0417927  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2470  YidE/YbjL duplication  26.82 
 
 
522 aa  141  4e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  4.763e-05  hitchhiker  0.00816269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2707  YidE/YbjL duplication  25.46 
 
 
564 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1985  YidE/YbjL duplication  23.15 
 
 
561 aa  136  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0595755 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3893  aspartate/alanine exchanger family protein  26.21 
 
 
560 aa  134  4e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17890  YidE/YbjL duplication  23.44 
 
 
521 aa  130  7e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.286246  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0482  YidE/YbjL duplication  25.28 
 
 
527 aa  129  9e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03065  hypothetical protein  23.73 
 
 
575 aa  128  2e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3841  YidE/YbjL duplication  23.48 
 
 
565 aa  127  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2952  YidE/YbjL duplication  25.04 
 
 
579 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4738  YidE/YbjL duplication  23.65 
 
 
581 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3938  YidE/YbjL duplication  24.12 
 
 
559 aa  120  8e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3045  YidE/YbjL duplication  24.64 
 
 
560 aa  117  4e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3839  YidE/YbjL duplication  23.76 
 
 
562 aa  115  2e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3482  YidE/YbjL duplication  25.54 
 
 
563 aa  112  1e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1198  probable membrane permease  23.37 
 
 
625 aa  112  2e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0096  YidE/YbjL duplication  24.73 
 
 
561 aa  110  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0519277  normal  0.835648 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3892  aspartate/alanine exchanger family protein  24.32 
 
 
560 aa  110  7e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4847  putative transporter  24.28 
 
 
567 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0674099  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01390  predicted permease  26.99 
 
 
522 aa  103  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0300  YidE/YbjL duplication  32.6 
 
 
384 aa  100  9e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3913  YidE/YbjL domain-containing protein  22.83 
 
 
589 aa  95.9  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0230126  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2708  YidE/YbjL duplication  24.73 
 
 
561 aa  89.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0789  YidE/YbjL duplication  23.77 
 
 
560 aa  87.4  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0281  YidE/YbjL duplication  21.96 
 
 
549 aa  75.9  2e-12  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00426862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>