More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0485 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  100 
 
 		 471 aa  973    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  42.6 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  43.84 
 
 		 452 aa  360  3e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8230  glycosyl transferase group 1  44.07 
 
 		 414 aa  349  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  43.14 
 
 		 421 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  43.66 
 
 		 416 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  43.35 
 
 		 421 aa  335  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  42.09 
 
 		 440 aa  333  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0573  putative glycosyl transferase  44.85 
 
 		 425 aa  329  6e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.478763  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0391  glycosyl transferase group 1  44.25 
 
 		 457 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.380998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  42.38 
 
 		 467 aa  323  5e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  41.36 
 
 		 452 aa  323  6e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  41.67 
 
 		 432 aa  322  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2006  glycosyl transferase, group 1  42.42 
 
 		 431 aa  319  6e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  41.88 
 
 		 458 aa  319  7.999999999999999e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  43.2 
 
 		 408 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  43.2 
 
 		 408 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  43.2 
 
 		 408 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  42.2 
 
 		 411 aa  307  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  41.71 
 
 		 411 aa  299  8e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2799  glycosyl transferase, group 1  41.42 
 
 		 421 aa  295  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0489  glycosyl transferase group 1  38.54 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.610235  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  31.8 
 
 		 351 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 		 369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 		 446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 		 394 aa  114  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.06 
 
 		 388 aa  114  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 		 382 aa  110  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 		 353 aa  109  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 377 aa  109  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.68 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 		 392 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  33.19 
 
 		 386 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  31.38 
 
 		 374 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.46 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  35.93 
 
 		 434 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 		 419 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  27.99 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 		 377 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 		 397 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 		 382 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  34.73 
 
 		 435 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 		 413 aa  99.8  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 		 360 aa  99.8  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.54 
 
 		 405 aa  99.8  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  22.25 
 
 		 536 aa  99.8  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 		 346 aa  99.8  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 		 415 aa  99.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 		 374 aa  99.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 		 366 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  22.07 
 
 		 421 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 368 aa  99  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 		 535 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 379 aa  97.8  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 		 348 aa  97.8  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 424 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 392 aa  97.1  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  22.76 
 
 		 404 aa  96.7  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 		 414 aa  96.7  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 		 380 aa  96.3  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  37.69 
 
 		 374 aa  96.3  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 374 aa  95.9  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 		 373 aa  95.9  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 		 384 aa  95.5  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  34.27 
 
 		 371 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  23.24 
 
 		 434 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 366 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 		 437 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 366 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 373 aa  94.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 407 aa  94.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0799  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  23.2 
 
 		 405 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.14 
 
 		 369 aa  94  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 371 aa  94  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  29.55 
 
 		 381 aa  94  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  25.4 
 
 		 427 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 		 419 aa  94  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 		 422 aa  93.2  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 		 425 aa  93.2  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 		 414 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0042  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 		 366 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 		 423 aa  92.8  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 		 366 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 372 aa  93.2  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  27.8 
 
 		 375 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 		 361 aa  92.8  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 		 369 aa  92.8  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2942  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 373 aa  92.8  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  27.39 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 		 396 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>