More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1985 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2477  alcohol dehydrogenase, iron-containing  94.1 
 
 		 356 aa  702    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2183  iron-containing alcohol dehydrogenase  85.39 
 
 		 356 aa  655    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000901085  normal  0.0100031 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2477  iron-containing alcohol dehydrogenase  99.72 
 
 		 356 aa  741    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000271565  decreased coverage  0.000108776 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2133  iron-containing alcohol dehydrogenase  85.39 
 
 		 356 aa  649    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000021113  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2362  iron-containing alcohol dehydrogenase  99.16 
 
 		 356 aa  738    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000229628  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1985  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 356 aa  742    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000240423  unclonable  0.00000000000340211 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  87.64 
 
 		 356 aa  666    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000304818  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1852  iron-containing alcohol dehydrogenase  94.94 
 
 		 356 aa  709    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318302  hitchhiker  0.00000012761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2126  iron-containing alcohol dehydrogenase  94.94 
 
 		 356 aa  708    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  unclonable  0.0000187018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1760  iron-containing alcohol dehydrogenase  84.83 
 
 		 356 aa  647    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0108166  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2423  iron-containing alcohol dehydrogenase  84.27 
 
 		 356 aa  643    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.195896  decreased coverage  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1907  iron-containing alcohol dehydrogenase  94.1 
 
 		 356 aa  704    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000681421  unclonable  0.0000000000909138 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1640  alcohol dehydrogenase, iron-containing  83.99 
 
 		 356 aa  640    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000263255  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2374  iron-containing alcohol dehydrogenase  99.44 
 
 		 356 aa  739    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000461423  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2140  Iron-containing alcohol dehydrogenase  68.35 
 
 		 357 aa  538  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.741299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3202  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.56 
 
 		 353 aa  490  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0804  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.25 
 
 		 358 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10583  ethanolamine utilization protein-like protein  53.37 
 
 		 614 aa  396  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2803  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.22 
 
 		 365 aa  378  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1890  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.38 
 
 		 358 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.94 
 
 		 357 aa  323  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.703448 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2213  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.39 
 
 		 359 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.17 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.23 
 
 		 387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.2 
 
 		 388 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.2 
 
 		 388 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.2 
 
 		 388 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.63 
 
 		 388 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 		 384 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.37 
 
 		 383 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.49 
 
 		 389 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.83 
 
 		 382 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.69 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1217  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.62 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3674  ethanolamine utilization protein EutG  26.62 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 		 382 aa  99.8  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02344  predicted alcohol dehydrogenase in ethanolamine utilization  26.28 
 
 		 395 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2582  ethanolamine utilization protein EutG  26.28 
 
 		 395 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02306  hypothetical protein  26.28 
 
 		 395 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1224  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.28 
 
 		 395 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2279  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.88 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2599  ethanolamine utilization protein EutG  26.28 
 
 		 395 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2730  ethanolamine utilization protein EutG  26.62 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  26.74 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.1 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.98 
 
 		 383 aa  97.8  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.12 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  25.53 
 
 		 399 aa  96.3  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.59 
 
 		 382 aa  95.9  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.38 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  27.27 
 
 		 369 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 		 384 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2389  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.84 
 
 		 382 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00204044  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  30.2 
 
 		 385 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.92 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.67 
 
 		 385 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2695  ethanolamine utilization protein EutG  26.78 
 
 		 395 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2654  ethanolamine utilization protein EutG  26.78 
 
 		 395 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0517138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2721  ethanolamine utilization protein EutG  26.78 
 
 		 395 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2819  ethanolamine utilization protein EutG  25.94 
 
 		 395 aa  93.6  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2606  ethanolamine utilization protein EutG  26.78 
 
 		 395 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1734  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.15 
 
 		 373 aa  93.6  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2828  ethanolamine utilization protein EutG  26.78 
 
 		 395 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 		 387 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3325  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.32 
 
 		 380 aa  92.4  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.961495  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.09 
 
 		 376 aa  92.8  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0647  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.12 
 
 		 378 aa  92.8  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.92 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2180  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.85 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 		 382 aa  92.4  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.74 
 
 		 395 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.41 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1128  alcohol dehydrogenase, iron-containing  25.3 
 
 		 376 aa  91.3  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1164  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.96 
 
 		 379 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  29.7 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  30.2 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  29.7 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.05 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  29.7 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4103  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.47 
 
 		 371 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1632  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.36 
 
 		 383 aa  90.9  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.23 
 
 		 390 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.26 
 
 		 385 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.5 
 
 		 382 aa  90.1  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 		 388 aa  90.1  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.09 
 
 		 389 aa  90.1  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.09 
 
 		 389 aa  90.1  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3982  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.56 
 
 		 368 aa  90.1  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3465  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 		 377 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117346  normal  0.139258 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 		 388 aa  89.7  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  28.23 
 
 		 394 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1369  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 		 368 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1513  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.81 
 
 		 376 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.496166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0588  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.31 
 
 		 368 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0567  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.67 
 
 		 383 aa  88.6  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  26.74 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  25.57 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  27.63 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>