More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1322 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  100 
 
 
183 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  99.45 
 
 
183 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  6.18987e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  98.36 
 
 
183 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  98.36 
 
 
183 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  84.7 
 
 
183 aa  323  7e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.21845e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  84.15 
 
 
183 aa  323  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  84.15 
 
 
183 aa  322  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  83.61 
 
 
183 aa  317  4e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3371  cytochrome B561  82.51 
 
 
183 aa  298  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1216  cytochrome b561  67.58 
 
 
183 aa  246  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  5.59854e-06  normal  0.299312 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2129  cytochrome B561  70.88 
 
 
198 aa  244  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  4.82046e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1316  cytochrome B561  67.04 
 
 
183 aa  243  1e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171547  normal  0.725201 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2876  cytochrome B561  60.44 
 
 
185 aa  218  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.379711  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  58.79 
 
 
184 aa  214  8e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.37011e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  53.3 
 
 
183 aa  207  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  56.9 
 
 
179 aa  200  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.87144e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  55.75 
 
 
179 aa  198  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  53.93 
 
 
181 aa  196  2e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  53.67 
 
 
183 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  48.59 
 
 
186 aa  190  8e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  50.84 
 
 
183 aa  189  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  50.56 
 
 
189 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  50 
 
 
189 aa  188  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  52.54 
 
 
183 aa  187  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  49.71 
 
 
196 aa  186  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  45.86 
 
 
184 aa  185  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  50.85 
 
 
183 aa  184  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  50.85 
 
 
183 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1042  cytochrome B561  57.65 
 
 
175 aa  183  1e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03240  cytochrome b561  51.12 
 
 
184 aa  182  2e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03827  putative cytochrome b561  52.38 
 
 
189 aa  182  2e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  50.28 
 
 
188 aa  181  5e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  50.28 
 
 
188 aa  181  5e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  50.28 
 
 
188 aa  181  5e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  50.28 
 
 
188 aa  181  5e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  50.28 
 
 
188 aa  181  5e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  50.28 
 
 
188 aa  181  5e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  50.28 
 
 
188 aa  181  5e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  50.28 
 
 
188 aa  181  5e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  46.63 
 
 
184 aa  177  6e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  48.59 
 
 
213 aa  176  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  49.43 
 
 
182 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  45.51 
 
 
184 aa  174  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  46.07 
 
 
184 aa  172  2e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2223  cytochrome b561 family protein  46.07 
 
 
184 aa  172  2e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0039455  hitchhiker  0.00454282 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  46.07 
 
 
184 aa  172  2e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  50 
 
 
183 aa  172  2e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  45.56 
 
 
190 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1313  cytochrome B561  51.41 
 
 
184 aa  170  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169075  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2822  cytochrome B561  47.51 
 
 
184 aa  167  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79842  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1269  hypothetical protein  46.67 
 
 
190 aa  165  3e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  47.22 
 
 
189 aa  165  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  46.67 
 
 
192 aa  164  7e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  46.67 
 
 
190 aa  164  7e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1254  hypothetical protein  46.11 
 
 
192 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.73358 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  46.37 
 
 
182 aa  158  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  43.5 
 
 
192 aa  157  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  46.59 
 
 
184 aa  156  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0949  cytochrome b561  45.05 
 
 
181 aa  128  5e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  3.03039e-05  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  41.57 
 
 
179 aa  125  4e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  38.12 
 
 
188 aa  120  1e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  35.03 
 
 
193 aa  113  2e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  34.46 
 
 
195 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  33.9 
 
 
193 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  34.46 
 
 
181 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  38.73 
 
 
189 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  34.05 
 
 
188 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02672  cytochrome b561, putative  33.51 
 
 
188 aa  101  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  34.16 
 
 
191 aa  100  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  31.07 
 
 
186 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  35.58 
 
 
181 aa  98.6  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  33.73 
 
 
182 aa  97.1  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  29.94 
 
 
186 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  34.76 
 
 
196 aa  95.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  37.64 
 
 
188 aa  94.7  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  32.97 
 
 
222 aa  94.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  37.5 
 
 
176 aa  94.7  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  30.94 
 
 
186 aa  94.4  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  32.79 
 
 
197 aa  94  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  34.62 
 
 
199 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  36.36 
 
 
176 aa  92.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  34.39 
 
 
187 aa  92.4  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  33.89 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.75 
 
 
184 aa  92.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  35.71 
 
 
188 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  33.14 
 
 
178 aa  91.7  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  33.71 
 
 
185 aa  90.1  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  33.14 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  34.71 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  35.33 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  36.07 
 
 
190 aa  89.4  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  34.1 
 
 
187 aa  89  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4003  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  32.62 
 
 
185 aa  89  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288533  normal  0.223807 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  33.71 
 
 
188 aa  88.2  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  34.12 
 
 
188 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  32.37 
 
 
182 aa  88.6  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  31.03 
 
 
186 aa  88.2  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  32.37 
 
 
182 aa  88.2  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  31.03 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  31.43 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>