More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0426 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 80 aa  164  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 80 aa  164  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  98.75 
 
 		 80 aa  163  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  81.25 
 
 		 78 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  81.01 
 
 		 77 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  79.75 
 
 		 77 aa  124  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  79.75 
 
 		 77 aa  124  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  79.75 
 
 		 77 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  79.75 
 
 		 77 aa  124  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  78.48 
 
 		 77 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  78.48 
 
 		 77 aa  122  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  78.48 
 
 		 77 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  78.48 
 
 		 77 aa  122  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  78.48 
 
 		 77 aa  122  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  78.48 
 
 		 77 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  84.62 
 
 		 78 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  74.67 
 
 		 79 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  73.68 
 
 		 81 aa  111  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  73.33 
 
 		 79 aa  110  8.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  67.14 
 
 		 75 aa  103  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  65.71 
 
 		 76 aa  102  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  65.71 
 
 		 76 aa  102  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  74.24 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  72.73 
 
 		 78 aa  98.6  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  72.73 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  69.23 
 
 		 74 aa  96.7  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  56.76 
 
 		 94 aa  94  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  59.72 
 
 		 75 aa  93.6  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  63.08 
 
 		 75 aa  93.6  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1166  30S ribosomal protein S18  62.86 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329961  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1402  30S ribosomal protein S18  62.86 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2250  30S ribosomal protein S18  62.86 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.231321  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2414  30S ribosomal protein S18  62.86 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0004  30S ribosomal protein S18  62.86 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0418254  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2181  30S ribosomal protein S18  62.86 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1893  30S ribosomal protein S18  62.86 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910904  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6207  30S ribosomal protein S18  62.86 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1402  30S ribosomal protein S18  62.86 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.494221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  60.53 
 
 		 80 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  60.53 
 
 		 80 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2289  30S ribosomal protein S18  62.86 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.189033  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1809  30S ribosomal protein S18  62.86 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356271  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1872  30S ribosomal protein S18  62.86 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582114  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1781  30S ribosomal protein S18  62.86 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.708911  normal  0.881884 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0643  30S ribosomal protein S18  62.69 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5172  30S ribosomal protein S18  62.86 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1895  30S ribosomal protein S18  62.86 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00156223  hitchhiker  0.0000000574659 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4964  30S ribosomal protein S18  66.18 
 
 		 86 aa  92  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 75 aa  91.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  67.19 
 
 		 75 aa  91.7  3e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1949  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 		 94 aa  91.3  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.879875  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  59.42 
 
 		 74 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1667  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 92 aa  91.3  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088074  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  54.79 
 
 		 84 aa  91.3  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  57.97 
 
 		 97 aa  91.3  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3481  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 		 98 aa  91.3  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.26859  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 75 aa  91.3  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0759  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 75 aa  90.9  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  hitchhiker  0.000000223269 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3584  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 75 aa  90.9  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  60 
 
 		 74 aa  90.9  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2454  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427357  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  57.97 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4210  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 75 aa  90.9  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.882361  hitchhiker  0.000251035 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  66.13 
 
 		 106 aa  90.9  6e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0740  ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 87 aa  90.5  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0452122  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 75 aa  90.5  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  60.29 
 
 		 70 aa  90.5  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 75 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 75 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 75 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 75 aa  90.5  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 75 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 75 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 75 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 75 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  68.33 
 
 		 76 aa  90.1  8e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  62.5 
 
 		 76 aa  90.1  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 112 aa  90.1  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3590  30S ribosomal protein S18  58.57 
 
 		 75 aa  89.4  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.307968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  64.62 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3433  30S ribosomal protein S18  58.57 
 
 		 75 aa  89.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00939921  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2008  30S ribosomal protein S18  50.63 
 
 		 83 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.922346  normal  0.649382 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3791  ribosomal protein S18  58.57 
 
 		 75 aa  89  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00509801  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  55.13 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4811  30S ribosomal protein S18  58.57 
 
 		 75 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0274683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4446  30S ribosomal protein S18  58.57 
 
 		 75 aa  89  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4672  30S ribosomal protein S18  58.57 
 
 		 75 aa  89  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998059 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1218  SSU ribosomal protein S18P  57.89 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0796  30S ribosomal protein S18  58.57 
 
 		 75 aa  89  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000510602  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4735  30S ribosomal protein S18  58.57 
 
 		 75 aa  89  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260572  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  65.57 
 
 		 75 aa  89.4  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4753  30S ribosomal protein S18  58.57 
 
 		 75 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0729519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4661  30S ribosomal protein S18  58.57 
 
 		 75 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  58.57 
 
 		 75 aa  89.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00745  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 76 aa  89  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613411  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1436  30S ribosomal protein S18  58.57 
 
 		 75 aa  89  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00709518  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4763  30S ribosomal protein S18  58.57 
 
 		 75 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5717  30S ribosomal protein S18  58.57 
 
 		 75 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.375297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0776  30S ribosomal protein S18  58.57 
 
 		 75 aa  89  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000892175  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4671  30S ribosomal protein S18  58.57 
 
 		 75 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00669693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>