More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0059 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0057  two component transcriptional regulator  100 
 
 
231 aa  473  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0059  response regulator receiver  100 
 
 
231 aa  473  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2490  DNA-binding response regulator KdeP  100 
 
 
231 aa  473  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2154  response regulator receiver  61.23 
 
 
231 aa  290  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0828561  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2116  two component transcriptional regulator  61.23 
 
 
231 aa  290  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.291778  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1214  DNA-binding response regulator KdpE  42.98 
 
 
237 aa  201  1e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000130813  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2842  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.81 
 
 
235 aa  186  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1681  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.09 
 
 
247 aa  182  5e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 
231 aa  181  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 
233 aa  181  8e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1587  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 
231 aa  174  1e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  39.56 
 
 
230 aa  173  3e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 
231 aa  172  3e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 
231 aa  172  4e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3780  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 
233 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 
231 aa  172  6e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 
241 aa  170  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3787  transposase  42.54 
 
 
229 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 
232 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0742  two component transcriptional regulator  41.56 
 
 
245 aa  170  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  41.7 
 
 
228 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 
232 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 
230 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 
232 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 
232 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  37.67 
 
 
230 aa  168  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 
232 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 
232 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 
232 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.41 
 
 
225 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0555  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.41 
 
 
225 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 
225 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  38.22 
 
 
230 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.41 
 
 
225 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.41 
 
 
225 aa  166  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  40 
 
 
240 aa  166  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0787  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.41 
 
 
225 aa  166  3e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1206  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 
225 aa  166  3e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  40.97 
 
 
225 aa  166  3e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  39.57 
 
 
232 aa  166  3e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.745879 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  40.97 
 
 
225 aa  166  3e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  38.5 
 
 
231 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0810  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.05 
 
 
225 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 
232 aa  165  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0750  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.05 
 
 
225 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.358042  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.53 
 
 
232 aa  165  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0860  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.05 
 
 
225 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.97 
 
 
225 aa  165  6e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 
231 aa  165  7e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0824  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.05 
 
 
225 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0770111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  38.7 
 
 
230 aa  164  1e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 
231 aa  164  1e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.21 
 
 
226 aa  164  1e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0465  DNA-binding response regulator  41.59 
 
 
230 aa  163  2e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.21608e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  38.5 
 
 
231 aa  163  2e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5840  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 
230 aa  163  2e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.99298  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  38.77 
 
 
226 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2990  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 
230 aa  163  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0386  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 
229 aa  162  4e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0763  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.61 
 
 
225 aa  162  5e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4230  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 
226 aa  161  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4296  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 
226 aa  161  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0135013  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4608  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 
226 aa  161  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  38.77 
 
 
232 aa  161  8e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  38.77 
 
 
234 aa  161  8e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  38.77 
 
 
234 aa  161  8e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  38.77 
 
 
234 aa  161  8e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  38.77 
 
 
234 aa  161  8e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  38.77 
 
 
232 aa  161  8e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  38.77 
 
 
234 aa  161  8e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  38.22 
 
 
234 aa  161  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 
230 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 
228 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1214  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.48 
 
 
226 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2931  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.05 
 
 
229 aa  159  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  38.5 
 
 
231 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  35.53 
 
 
230 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 
235 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6752  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.38 
 
 
230 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1126  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.05 
 
 
226 aa  159  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.296902  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 
235 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 
228 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.95 
 
 
227 aa  159  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  35.53 
 
 
230 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 
228 aa  157  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  38.2 
 
 
230 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2822  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.36 
 
 
230 aa  156  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0828  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.77 
 
 
232 aa  156  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.159677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0299  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 
231 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 
232 aa  156  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 
235 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1461  response regulator receiver  42.15 
 
 
233 aa  156  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000661728  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 
236 aa  155  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2094  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 
231 aa  155  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  36.73 
 
 
224 aa  155  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.67 
 
 
231 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  4.20296e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1514  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.28 
 
 
229 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0313038  normal  0.23375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3248  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 
224 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3235  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 
228 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.40462  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3778  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 
232 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0820994  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>