50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2874 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2874  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  507  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3904  nucleotidyltransferase-like protein  56.54 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1054  hypothetical protein  43.12 
 
 		 280 aa  176  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2984  hypothetical protein  38.03 
 
 		 298 aa  139  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0053  nucleotidyltransferase-like protein  38.14 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6191  hypothetical protein  36.65 
 
 		 241 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1517  hypothetical protein  34.81 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000966752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2518  Nucleotidyltransferase, predicted  31.06 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0207586  hitchhiker  0.00121784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2873  hypothetical protein  30.71 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3903  hypothetical protein  31.29 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1055  hypothetical protein  25.53 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4228  hypothetical protein  27.61 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0574  hypothetical protein  30.08 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1072  hypothetical protein  29.58 
 
 		 264 aa  62  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.042495  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0481  Nucleotidyltransferase, predicted  29.39 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3163  Nucleotidyltransferase, predicted  32.76 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0225  hypothetical protein  31.54 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0390  hypothetical protein  27.65 
 
 		 326 aa  55.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.525134  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1947  hypothetical protein  38.83 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03910  predicted nucleotidyltransferase  25.31 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.125701  normal  0.806026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1192  nucleotidyltransferase-like protein  37.35 
 
 		 262 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0169  hypothetical protein  28.66 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60660  putative nucleotidyltransferase  34.31 
 
 		 270 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2418  nucleotidyltransferase-like  31.95 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0545252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4672  nucleotidyltransferase-like  32.3 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.934446  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3830  nucleotidyltransferase-like protein  31.95 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.317709  normal  0.499468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0679  nucleotidyltransferase-like protein  32.93 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3691  nucleotidyltransferase-like protein  32.3 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5431  nucleotidyltransferase-like protein  31.95 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4261  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170436  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0028  uncharacterized protein, YcgL-like protein  27.39 
 
 		 336 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3586  nucleotidyltransferase-like protein  29.76 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.545722 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4570  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3808  hypothetical protein  28.19 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2055  hypothetical protein  24.57 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.754241  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0488  Nucleotidyltransferase, predicted  33.33 
 
 		 263 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2786  YcgL  35.71 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.436612 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3841  hypothetical protein  31 
 
 		 273 aa  45.8  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1902  hypothetical protein  39.26 
 
 		 273 aa  45.4  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0411  hypothetical protein  27.66 
 
 		 260 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0363  hypothetical protein  28.92 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1895  hypothetical protein  32.93 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.455689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0397  hypothetical protein  28.92 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4907  hypothetical protein  26.6 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0459  hypothetical protein  29.27 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0331  hypothetical protein  28.92 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0348  hypothetical protein  28.92 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0343  hypothetical protein  29.27 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0463  hypothetical protein  28.05 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0405  hypothetical protein  29.55 
 
 		 263 aa  42.7  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>