35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0143 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0143  sterol-binding domain-containing protein  100 
 
 		 150 aa  308  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.110171  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0137  sterol-binding domain-containing protein  96 
 
 		 150 aa  297  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3015  Sterol-binding domain-containing protein  47.4 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.19531  normal  0.172017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0558  sterol-binding domain-containing protein  47.06 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6978  hypothetical protein  42.76 
 
 		 212 aa  122  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.664684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4826  sterol-binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3434  hypothetical protein  32.87 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1303  hypothetical protein  24.31 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1531  sterol-binding domain-containing protein  31.73 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00600993  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2198  Sterol-binding domain protein  32.08 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.7 
 
 		 913 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1572  sterol-binding domain-containing protein  29.7 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246813  hitchhiker  0.000825534 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  35.51 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  35.51 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3466  hypothetical protein  31.37 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40860  hypothetical protein  31.37 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  35.51 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  30.77 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  30.77 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  35.78 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2532  sterol-binding domain-containing protein  29.41 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0766724  normal  0.1396 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27580  Sterol-binding protein  33.82 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1911  sterol-binding domain-containing protein  26.53 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3924  sterol-binding domain protein  26.53 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0884325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3213  sterol-binding domain-containing protein  26.53 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.533818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2997  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.34 
 
 		 442 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3116  sterol-binding  27.84 
 
 		 105 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2725  SCP-2 sterol transfer family protein  26.47 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  27.55 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2458  sterol-binding  27.84 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.0363969 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1939  sterol-binding  27.72 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530915  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3405  hypothetical protein  27.55 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.952914  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0781  sterol-binding domain protein  35.53 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0276166  normal  0.045948 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2459  sterol-binding protein  29.52 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.676777  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 710 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>