269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0073 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  100 
 
 
144 aa  304  2e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  70.08 
 
 
150 aa  205  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  69.53 
 
 
142 aa  204  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  70.08 
 
 
150 aa  204  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  70.08 
 
 
146 aa  204  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  69.53 
 
 
154 aa  202  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  68.75 
 
 
154 aa  201  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  68.46 
 
 
154 aa  201  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  69.29 
 
 
150 aa  199  1e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  69.29 
 
 
142 aa  198  2e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  67.19 
 
 
142 aa  198  2e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  62.2 
 
 
141 aa  175  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  61.83 
 
 
142 aa  174  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  63.78 
 
 
144 aa  172  1e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  59.23 
 
 
143 aa  170  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  59.2 
 
 
140 aa  165  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  54.07 
 
 
149 aa  152  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  50.76 
 
 
150 aa  140  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  47.73 
 
 
150 aa  135  3e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  42.15 
 
 
146 aa  120  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  36.15 
 
 
139 aa  96.7  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  39.42 
 
 
161 aa  89  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  37.27 
 
 
161 aa  84.3  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 
161 aa  82.8  1e-15  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 
134 aa  80.9  5e-15  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  36.28 
 
 
156 aa  79.3  1e-14  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 
156 aa  77.4  5e-14  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 
149 aa  77.4  7e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  1.87556e-06  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  28 
 
 
137 aa  75.9  2e-13  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
136 aa  75.9  2e-13  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
139 aa  73.9  6e-13  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03599  conserved hypothetical protein  35 
 
 
294 aa  70.9  5e-12  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 
132 aa  71.2  5e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
146 aa  68.9  2e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04590  conserved hypothetical protein  29.71 
 
 
291 aa  68.9  2e-11  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
146 aa  68.9  2e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
132 aa  68.2  4e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 
143 aa  67.8  5e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 
143 aa  67.8  5e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 
143 aa  67.8  5e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
153 aa  66.2  1e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  30.22 
 
 
145 aa  66.2  1e-10  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 
167 aa  66.6  1e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  33.33 
 
 
134 aa  66.2  2e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
142 aa  65.9  2e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
153 aa  65.5  3e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 
139 aa  65.5  3e-10  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
153 aa  64.7  4e-10  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  27.27 
 
 
130 aa  64.3  6e-10  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 
132 aa  63.9  6e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
145 aa  63.9  8e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 
136 aa  63.5  1e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  33.93 
 
 
136 aa  62.4  2e-09  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  3.96165e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 
148 aa  62.4  2e-09  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 
139 aa  62.8  2e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  26.45 
 
 
130 aa  62.4  2e-09  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
156 aa  62.8  2e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 
140 aa  61.2  4e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2484  hypothetical protein  24.59 
 
 
146 aa  61.2  5e-09  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.838963  normal  0.0924158 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  28.67 
 
 
147 aa  61.2  5e-09  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  26.23 
 
 
134 aa  61.2  5e-09  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  29.46 
 
 
147 aa  60.8  6e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
131 aa  60.8  6e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
140 aa  60.5  7e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
164 aa  60.1  1e-08  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  2.26869e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 
143 aa  60.1  1e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
140 aa  59.7  1e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  28.67 
 
 
147 aa  60.1  1e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
133 aa  58.9  2e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  32.06 
 
 
153 aa  59.3  2e-08  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
144 aa  58.5  3e-08  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
137 aa  58.2  4e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  31.01 
 
 
159 aa  58.2  4e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  29.52 
 
 
147 aa  57.8  4e-08  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.02626e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  27.27 
 
 
145 aa  58.2  4e-08  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  31.01 
 
 
143 aa  57.8  5e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  31.01 
 
 
143 aa  57.8  5e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  31.01 
 
 
143 aa  57.8  5e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  31.01 
 
 
143 aa  57.8  5e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  3.80649e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 
149 aa  57.8  5e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 
145 aa  57.8  5e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  31.01 
 
 
143 aa  57.8  5e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  31.01 
 
 
143 aa  57.8  5e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 
143 aa  57.4  6e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
136 aa  57.4  7e-08  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 
135 aa  57.4  7e-08  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.07 
 
 
149 aa  57.4  7e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 
147 aa  57  8e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  7.91205e-06  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 
145 aa  56.2  1e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  43.28 
 
 
213 aa  56.2  1e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 
143 aa  56.6  1e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  28.68 
 
 
134 aa  56.6  1e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 
153 aa  56.2  1e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 
145 aa  56.2  1e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 
145 aa  56.2  1e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  26.15 
 
 
203 aa  55.8  2e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
155 aa  55.8  2e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  1.53197e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 
145 aa  55.5  2e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  26.62 
 
 
149 aa  55.8  2e-07  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  27.82 
 
 
141 aa  55.5  2e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>