More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0059 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  100 
 
 
378 aa  760  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  68.7 
 
 
377 aa  523  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  66.84 
 
 
377 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  66.84 
 
 
377 aa  511  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46051e-06 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  65.6 
 
 
378 aa  506  1e-142  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  67.13 
 
 
362 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  64.29 
 
 
377 aa  500  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  1.59575e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  67.4 
 
 
362 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  66.85 
 
 
362 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  1.29234e-05 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  65.75 
 
 
361 aa  486  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  67.13 
 
 
362 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5395e-07 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  63.23 
 
 
377 aa  481  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  67.44 
 
 
344 aa  473  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4022  peptidase M23B  63.93 
 
 
377 aa  459  1e-128  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3699  peptidase M23B  62.4 
 
 
379 aa  456  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  42.41 
 
 
411 aa  299  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00544  peptidase, M23/M37 family protein  43.1 
 
 
387 aa  281  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  46.06 
 
 
363 aa  266  5e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  35.45 
 
 
427 aa  235  1e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  37.04 
 
 
433 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  37.23 
 
 
456 aa  232  7e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  34.47 
 
 
427 aa  231  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  36.99 
 
 
456 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  34.47 
 
 
419 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  36.99 
 
 
456 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  36.95 
 
 
433 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  34.96 
 
 
427 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  34.96 
 
 
427 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  34.47 
 
 
419 aa  229  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  34.47 
 
 
427 aa  230  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  34.47 
 
 
427 aa  230  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  34.47 
 
 
427 aa  230  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  34.47 
 
 
419 aa  229  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  35.24 
 
 
427 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  34.47 
 
 
419 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  34.47 
 
 
419 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  35.56 
 
 
424 aa  229  7e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  34.63 
 
 
405 aa  229  9e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  34.72 
 
 
427 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  37.04 
 
 
444 aa  226  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  35.44 
 
 
381 aa  222  8e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4030  hypothetical protein  34.96 
 
 
427 aa  221  2e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  34.36 
 
 
413 aa  221  2e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  34.54 
 
 
374 aa  220  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  34.08 
 
 
369 aa  219  9e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  36.29 
 
 
382 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  33.01 
 
 
428 aa  217  3e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  35.48 
 
 
382 aa  217  3e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  33.33 
 
 
434 aa  215  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  33.67 
 
 
416 aa  214  2e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  34.56 
 
 
417 aa  213  4e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  33.51 
 
 
398 aa  213  6e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  36.83 
 
 
375 aa  212  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  33.42 
 
 
428 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  36.72 
 
 
424 aa  209  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  31.37 
 
 
440 aa  209  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  32.94 
 
 
438 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  33.18 
 
 
438 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  32.7 
 
 
438 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  32.08 
 
 
441 aa  205  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  30.06 
 
 
382 aa  194  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  32.91 
 
 
420 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  29.51 
 
 
366 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  35.17 
 
 
405 aa  190  3e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  33.9 
 
 
379 aa  189  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  31.58 
 
 
381 aa  188  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  29.51 
 
 
387 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  28.93 
 
 
412 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  27.92 
 
 
426 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0538  hypothetical protein  30.23 
 
 
380 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  30.23 
 
 
380 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  30.08 
 
 
436 aa  162  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  30.5 
 
 
436 aa  161  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1443  hypothetical protein  29.28 
 
 
410 aa  159  5e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  30 
 
 
411 aa  156  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  28.76 
 
 
388 aa  147  2e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  28.75 
 
 
398 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.18753e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  44.88 
 
 
477 aa  142  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  28.61 
 
 
397 aa  142  1e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0175  M23 family peptidase  31.96 
 
 
405 aa  138  2e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  41.1 
 
 
481 aa  136  7e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5868  hypothetical protein  53.15 
 
 
117 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.617711  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  28.21 
 
 
379 aa  135  1e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  26.43 
 
 
391 aa  135  1e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  45.97 
 
 
432 aa  133  4e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  27.39 
 
 
397 aa  134  4e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3510  peptidase M23B  27.82 
 
 
397 aa  133  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  27.53 
 
 
396 aa  130  4e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.44038e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  28.36 
 
 
394 aa  130  4e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  27.25 
 
 
404 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  5.21707e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  27.2 
 
 
376 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.73675e-08  hitchhiker  4.27958e-09 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  33.68 
 
 
430 aa  123  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  4.6431e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  29.97 
 
 
374 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.67566e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  28.41 
 
 
374 aa  119  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  26.91 
 
 
379 aa  114  4e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  35 
 
 
452 aa  112  1e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.78681e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  29.26 
 
 
377 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  32.46 
 
 
375 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  2.19165e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  29.37 
 
 
372 aa  110  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  31.45 
 
 
309 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.49073e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>