212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1648 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1648  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 117 aa  246  8e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.732413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0981  excinuclease ABC subunit C  65.56 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16466  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0811  hypothetical protein  54.35 
 
 		 93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0782  hypothetical protein  53.26 
 
 		 93 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4267  excinuclease ABC subunit C  51.61 
 
 		 180 aa  105  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0376  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.604182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4258  excinuclease ABC subunit C  48.96 
 
 		 100 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00754458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7672  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4162  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.07 
 
 		 97 aa  87.8  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3649  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.74 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3525  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.75 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.506874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4363  excinuclease ABC, C subunit-like protein  53.25 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2665  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.67 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0964299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  36.84 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2245  excinuclease ABC subunit C  40.43 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3490  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.83 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3325  excinuclease ABC subunit C  42.22 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.369654 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1038  hypothetical protein  38.46 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3514  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.71 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  33.72 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  41.56 
 
 		 83 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3763  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1867  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.47 
 
 		 80 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000216284  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0452  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.97 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122957  normal  0.760356 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.36 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2084  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.8 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000359134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4370  excinuclease ABC subunit C  44.16 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  39.47 
 
 		 103 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3382  excinuclease ABC subunit C  41.25 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114521  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  35.9 
 
 		 82 aa  62  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  35.9 
 
 		 82 aa  62  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21070  predicted endonuclease containing a URI domain  38.96 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2943  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.47 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2851  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.47 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1525  endonuclease  36.84 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1970  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.74 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.712679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0446  excinuclease ABC subunit C  37.18 
 
 		 80 aa  60.1  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029981  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  39.73 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1009  Excinuclease ABC C subunit domain protein  34.18 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53905  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5558  excinuclease ABC subunit C  36.25 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.33 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1965  excinuclease ABC subunit C  38.89 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.70444 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0778  hypothetical protein  32.1 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.68184  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0827  excinuclease ABC subunit C  39.33 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437312 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3752  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.49 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7339  putative excinuclease ABC, C subunit  36.46 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.99 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.62 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0133  excinuclease ABC subunit C  37.66 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  36 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  36 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2889  excinuclease ABC subunit C  41.43 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0492999  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  33.33 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.8 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4762  excinuclease ABC subunit C  38.96 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000128421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  37.18 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1312  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.51 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.12439  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  37.8 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1200  URI-like endonuclease  40.54 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.221848  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.08 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  37.66 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0115  excinuclease ABC subunit C  34.18 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0141  excinuclease ABC subunit C  35.06 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0136  excinuclease ABC subunit C  36.25 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0136  excinuclease ABC subunit C  30.11 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3617  putative excinuclease, subunit C  39.73 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3055  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.56 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0039  hypothetical protein  40.28 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0717  hypothetical protein  40.28 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0882  hypothetical protein  40.28 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1812  hypothetical protein  40.28 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1852  hypothetical protein  40.28 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1944  hypothetical protein  40.28 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2051  hypothetical protein  40.28 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2896  hypothetical protein  40.28 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2194  excinuclease ABC subunit C  42.5 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0733  excinuclease ABC subunit C  35.48 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.579236  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 102 aa  52.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2352  excinuclease ABC subunit C  36.63 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.51382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  34.34 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0331  hypothetical protein  40.28 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3906  excinuclease ABC subunit C  40.91 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647444  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0137  excinuclease ABC subunit C  33.77 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0489368 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  37.97 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0285  excinuclease ABC subunit C  35.9 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722146  normal  0.992997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.47 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4264  excinuclease ABC subunit C  37.97 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604611  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2430  excinuclease ABC subunit C  36.71 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  30.23 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2855  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.56 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0682  excinuclease ABC subunit C  30.77 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000227073  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02157  GIY-YIG nuclease superfamily protein  32.93 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  32.22 
 
 		 95 aa  50.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0080  excinuclease ABC subunit C  34.67 
 
 		 117 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.76446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0675  hypothetical protein  33.71 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0879  endo/excinuclease domain-containing protein  35 
 
 		 165 aa  50.1  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1731  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.35 
 
 		 91 aa  50.4  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.26715  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2226  excinuclease ABC subunit C  37.33 
 
 		 119 aa  50.1  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.163339  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2291  excinuclease ABC subunit C  38.89 
 
 		 95 aa  50.1  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361879  normal  0.317834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>