23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4363 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4363  excinuclease ABC, C subunit-like protein  100 
 
 		 91 aa  187  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4258  excinuclease ABC subunit C  55.81 
 
 		 100 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00754458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0376  excinuclease ABC subunit C  59.76 
 
 		 104 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.604182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3649  Excinuclease ABC C subunit domain protein  53.33 
 
 		 131 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7672  Excinuclease ABC C subunit domain protein  53.16 
 
 		 104 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3325  excinuclease ABC subunit C  54.55 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.369654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3525  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.81 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.506874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1648  excinuclease ABC subunit C  53.25 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.732413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3490  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.9 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1038  hypothetical protein  44.44 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2665  Excinuclease ABC C subunit domain protein  49.33 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0964299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  36.14 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0981  excinuclease ABC subunit C  39.77 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4267  excinuclease ABC subunit C  48.1 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4162  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.15 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0811  hypothetical protein  37.8 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0782  hypothetical protein  36.59 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3763  excinuclease ABC subunit C  41.03 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3514  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.59 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2245  excinuclease ABC subunit C  55.32 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  40.3 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0181  excinuclease ABC, C subunit domain protein  39.19 
 
 		 83 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.191258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4129  excinuclease ABC subunit C  37.8 
 
 		 127 aa  41.2  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>