132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2291 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2291  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 95 aa  199  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361879  normal  0.317834 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  55.79 
 
 		 95 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2889  excinuclease ABC subunit C  58.51 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0492999  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0039  hypothetical protein  55.79 
 
 		 97 aa  120  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0717  hypothetical protein  55.79 
 
 		 97 aa  120  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0882  hypothetical protein  55.79 
 
 		 97 aa  120  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1812  hypothetical protein  55.79 
 
 		 97 aa  120  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1852  hypothetical protein  55.79 
 
 		 97 aa  120  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1944  hypothetical protein  55.79 
 
 		 97 aa  120  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2051  hypothetical protein  55.79 
 
 		 97 aa  120  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2896  hypothetical protein  55.79 
 
 		 97 aa  120  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0331  hypothetical protein  54.74 
 
 		 97 aa  120  9e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2878  excinuclease ABC subunit C  53.68 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00418139  hitchhiker  0.000396722 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0733  excinuclease ABC subunit C  56.52 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.579236  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3101  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  55.79 
 
 		 95 aa  117  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  56.99 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2997  excinuclease ABC subunit C  56.82 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.867299  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2181  excinuclease ABC subunit C  57.14 
 
 		 113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00892068  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  57.95 
 
 		 100 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  55.68 
 
 		 111 aa  110  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0294  hypothetical cytosolic protein  51.06 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.479939  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1899  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  51.06 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3151  excinuclease ABC subunit C  58.89 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0891506  normal  0.0226516 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1144  hypothetical protein  55.06 
 
 		 97 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1655  excinuclease ABC subunit C  58.24 
 
 		 98 aa  107  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.27 
 
 		 95 aa  107  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0883  excinuclease ABC subunit C  53.76 
 
 		 114 aa  107  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227593  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  50.55 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1975  excinuclease ABC subunit C  52.75 
 
 		 118 aa  103  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2430  excinuclease ABC subunit C  56.18 
 
 		 102 aa  103  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4684  excinuclease ABC subunit C  54.44 
 
 		 99 aa  102  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_002978  WD0358  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  47.83 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2055  hypothetical protein  47.87 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  51.11 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0285  excinuclease ABC subunit C  53.85 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722146  normal  0.992997 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.91 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3382  excinuclease ABC subunit C  50.56 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114521  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  55.29 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3175  excinuclease ABC subunit C  49.44 
 
 		 95 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.11 
 
 		 95 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2352  excinuclease ABC subunit C  53.49 
 
 		 110 aa  100  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.51382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3180  excinuclease ABC subunit C  48.31 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734981  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  47.78 
 
 		 95 aa  99.4  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4225  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50.56 
 
 		 95 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073463  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2226  excinuclease ABC subunit C  51.16 
 
 		 119 aa  99.4  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.163339  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2170  excinuclease ABC subunit C  50.56 
 
 		 98 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.013295  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0877  excinuclease ABC subunit C  52.81 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1266  excinuclease ABC subunit C  51.06 
 
 		 109 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0720825  normal  0.107878 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0916  excinuclease ABC subunit C  52.33 
 
 		 95 aa  95.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2855  Excinuclease ABC C subunit domain protein  49.41 
 
 		 96 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2057  excinuclease ABC subunit C  44.68 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1053  excinuclease ABC, C subunit  51.11 
 
 		 110 aa  93.6  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.175656  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  48.24 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0827  excinuclease ABC subunit C  50.56 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437312 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2317  excinuclease ABC subunit C  46.51 
 
 		 98 aa  92.8  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0365776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2227  excinuclease ABC subunit C  47.06 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000408802  hitchhiker  0.0000527007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2602  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.71 
 
 		 97 aa  91.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000820325  normal  0.0436651 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0895  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.76 
 
 		 99 aa  90.9  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00270858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4056  excinuclease ABC subunit C  48.84 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  47.78 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  49.41 
 
 		 96 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2914  excinuclease ABC subunit C  46.67 
 
 		 101 aa  87.4  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00677745  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1328  excinuclease ABC subunit C  50.59 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1277  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.76 
 
 		 96 aa  85.5  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.129449  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4264  excinuclease ABC subunit C  46.07 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604611  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1965  excinuclease ABC subunit C  46.07 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.70444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7339  putative excinuclease ABC, C subunit  46.07 
 
 		 101 aa  84.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0957  excinuclease ABC subunit C  49.43 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00735212  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2807  excinuclease ABC subunit C  48.28 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3672  excinuclease ABC subunit C  48.28 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.246174  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05230  hypothetical protein  43.96 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610254  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0893  excinuclease ABC subunit C  45.56 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1362  excinuclease ABC subunit C  44.71 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4673  excinuclease ABC subunit C  44.71 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0203068  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05260  endo/excinuclease amino terminal domain protein  43.37 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.509703  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05270  hypothetical protein  42.68 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05250  endo/excinuclease amino terminal domain protein  40.66 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4036  hypothetical protein  39.47 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01100  hypothetical protein  44.44 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3906  excinuclease ABC subunit C  48.39 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647444  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09001  hypothetical protein  42.65 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1622  excinuclease ABC subunit C  70.97 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0838  type I restriction-modification system, R subunit  33.33 
 
 		 1210 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1648  excinuclease ABC subunit C  38.89 
 
 		 117 aa  50.1  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.732413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1913  hypothetical protein  32.94 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.915766  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1038  hypothetical protein  35.53 
 
 		 93 aa  49.7  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0210  hypothetical protein  37.88 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2665  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.53 
 
 		 98 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0964299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2245  excinuclease ABC subunit C  38.67 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  36.84 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0981  excinuclease ABC subunit C  37.31 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  35.53 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  37.66 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  37.66 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2851  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.53 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2943  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.53 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  34.15 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3763  excinuclease ABC subunit C  35.71 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  34.57 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1944  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.92 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752306 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>