152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3101 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3101  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  100 
 
 
95 aa  196  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  61.8 
 
 
111 aa  127  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0358  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  60.44 
 
 
96 aa  122  1e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1899  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  56.84 
 
 
96 aa  121  4e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0294  hypothetical cytosolic protein  56.84 
 
 
96 aa  121  4e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.479939  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2430  excinuclease ABC subunit C  61.8 
 
 
102 aa  120  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1144  hypothetical protein  65.17 
 
 
97 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2226  excinuclease ABC subunit C  53.68 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.163339  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7339  putative excinuclease ABC, C subunit  62.22 
 
 
101 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.17 
 
 
100 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  61.29 
 
 
100 aa  118  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2291  excinuclease ABC subunit C  55.79 
 
 
95 aa  117  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361879  normal  0.317834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  56.18 
 
 
100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3151  excinuclease ABC subunit C  54.74 
 
 
96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0891506  normal  0.0226516 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2055  hypothetical protein  55.79 
 
 
96 aa  113  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  54.84 
 
 
115 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2878  excinuclease ABC subunit C  54.74 
 
 
95 aa  113  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00418139  hitchhiker  0.000396722 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3175  excinuclease ABC subunit C  57.3 
 
 
95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  54.44 
 
 
95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  58.82 
 
 
95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3382  excinuclease ABC subunit C  54.44 
 
 
120 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114521  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0039  hypothetical protein  53.68 
 
 
97 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0717  hypothetical protein  53.68 
 
 
97 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0882  hypothetical protein  53.68 
 
 
97 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1812  hypothetical protein  53.68 
 
 
97 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1852  hypothetical protein  53.68 
 
 
97 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1944  hypothetical protein  53.68 
 
 
97 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2051  hypothetical protein  53.68 
 
 
97 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2896  hypothetical protein  53.68 
 
 
97 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4225  Excinuclease ABC C subunit domain protein  55.56 
 
 
95 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073463  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0331  hypothetical protein  53.68 
 
 
97 aa  110  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3180  excinuclease ABC subunit C  57.3 
 
 
95 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734981  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1053  excinuclease ABC, C subunit  52.63 
 
 
110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.175656  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1362  excinuclease ABC subunit C  55.29 
 
 
107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  57.65 
 
 
96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1266  excinuclease ABC subunit C  51.06 
 
 
109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0720825  normal  0.107878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  57.65 
 
 
101 aa  107  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4684  excinuclease ABC subunit C  52.63 
 
 
99 aa  107  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2855  Excinuclease ABC C subunit domain protein  57.65 
 
 
96 aa  105  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675434  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2352  excinuclease ABC subunit C  52.81 
 
 
110 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.51382  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0916  excinuclease ABC subunit C  56.98 
 
 
95 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0733  excinuclease ABC subunit C  53.26 
 
 
104 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.579236  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4056  excinuclease ABC subunit C  55.81 
 
 
130 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366291  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  54.44 
 
 
95 aa  104  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0877  excinuclease ABC subunit C  56.98 
 
 
125 aa  103  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  55.56 
 
 
95 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1655  excinuclease ABC subunit C  60.22 
 
 
98 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0957  excinuclease ABC subunit C  51.72 
 
 
118 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00735212  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 
95 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2807  excinuclease ABC subunit C  50.57 
 
 
118 aa  101  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3672  excinuclease ABC subunit C  50.57 
 
 
118 aa  101  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.246174  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2889  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 
95 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0492999  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0285  excinuclease ABC subunit C  51.06 
 
 
95 aa  99.4  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722146  normal  0.992997 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2181  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 
113 aa  98.6  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00892068  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1328  excinuclease ABC subunit C  55.29 
 
 
95 aa  97.4  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1975  excinuclease ABC subunit C  50.54 
 
 
118 aa  97.4  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2997  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 
95 aa  97.4  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.867299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 
95 aa  97.1  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0883  excinuclease ABC subunit C  50.54 
 
 
114 aa  97.1  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227593  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1965  excinuclease ABC subunit C  51.69 
 
 
95 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.70444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4264  excinuclease ABC subunit C  48.31 
 
 
95 aa  95.5  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604611  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2057  excinuclease ABC subunit C  47.78 
 
 
113 aa  95.5  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2170  excinuclease ABC subunit C  46.67 
 
 
98 aa  95.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.013295  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  48.89 
 
 
102 aa  94  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2317  excinuclease ABC subunit C  50.56 
 
 
98 aa  94  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0365776  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0827  excinuclease ABC subunit C  47.78 
 
 
121 aa  92  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000437312 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2227  excinuclease ABC subunit C  49.44 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000408802  hitchhiker  0.0000527007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2602  Excinuclease ABC C subunit domain protein  49.41 
 
 
97 aa  89  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000820325  normal  0.0436651 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05230  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  89.4  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610254  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05250  endo/excinuclease amino terminal domain protein  49.45 
 
 
107 aa  88.2  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0895  Excinuclease ABC C subunit domain protein  47.25 
 
 
99 aa  86.3  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00270858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0893  excinuclease ABC subunit C  42.22 
 
 
99 aa  86.3  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1277  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.96 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.129449  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4673  excinuclease ABC subunit C  44.83 
 
 
95 aa  83.6  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0203068  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05260  endo/excinuclease amino terminal domain protein  46.99 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.509703  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2914  excinuclease ABC subunit C  47.37 
 
 
101 aa  81.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00677745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01100  hypothetical protein  58.73 
 
 
67 aa  81.3  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4036  hypothetical protein  44.16 
 
 
79 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05270  hypothetical protein  41.46 
 
 
100 aa  72.4  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09001  hypothetical protein  46.48 
 
 
80 aa  66.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1913  hypothetical protein  34.12 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.915766  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3906  excinuclease ABC subunit C  39.34 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647444  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2245  excinuclease ABC subunit C  37.33 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1103  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 
87 aa  53.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1622  excinuclease ABC subunit C  64.52 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  38.89 
 
 
106 aa  51.2  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  44 
 
 
88 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0980  GIY-YIG nuclease superfamily protein  31.17 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7672  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.5 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  34.21 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4267  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 
180 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  39.51 
 
 
97 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  38.46 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  36.84 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  34.21 
 
 
163 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  32.47 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2943  Excinuclease ABC C subunit domain protein  32.89 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.31 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2851  Excinuclease ABC C subunit domain protein  32.89 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0448  excinuclease ABC subunit C  35.71 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>