123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1277 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1277  Excinuclease ABC C subunit domain protein  100 
 
 		 96 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.129449  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0358  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  49.44 
 
 		 96 aa  90.5  7e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3382  excinuclease ABC subunit C  44.79 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114521  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2602  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.81 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000820325  normal  0.0436651 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3175  excinuclease ABC subunit C  44.68 
 
 		 95 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  45.83 
 
 		 95 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2227  excinuclease ABC subunit C  53.93 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000408802  hitchhiker  0.0000527007 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3180  excinuclease ABC subunit C  43.62 
 
 		 95 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734981  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2317  excinuclease ABC subunit C  46.24 
 
 		 98 aa  87.4  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0365776  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  49.44 
 
 		 100 aa  86.7  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1053  excinuclease ABC, C subunit  42.39 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.175656  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3101  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  43.96 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4225  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.16 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073463  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2291  excinuclease ABC subunit C  41.76 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361879  normal  0.317834 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2914  excinuclease ABC subunit C  47.25 
 
 		 101 aa  84.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00677745  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2997  excinuclease ABC subunit C  49.43 
 
 		 95 aa  84.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.867299  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2226  excinuclease ABC subunit C  42.05 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.163339  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3151  excinuclease ABC subunit C  43.48 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0891506  normal  0.0226516 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  49.43 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7339  putative excinuclease ABC, C subunit  45.16 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  44.44 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.67 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  42.71 
 
 		 95 aa  80.1  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2055  hypothetical protein  41.94 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1266  excinuclease ABC subunit C  44.32 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0720825  normal  0.107878 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  41.05 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0294  hypothetical cytosolic protein  42.39 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.479939  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1899  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  42.39 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.76 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2170  excinuclease ABC subunit C  42.39 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.013295  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05250  endo/excinuclease amino terminal domain protein  44.32 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2878  excinuclease ABC subunit C  45.05 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00418139  hitchhiker  0.000396722 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  43.33 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0285  excinuclease ABC subunit C  42.7 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722146  normal  0.992997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1362  excinuclease ABC subunit C  43.96 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2057  excinuclease ABC subunit C  38.89 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2352  excinuclease ABC subunit C  41.57 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.51382  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0039  hypothetical protein  44.83 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0717  hypothetical protein  44.83 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0882  hypothetical protein  44.83 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1812  hypothetical protein  44.83 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1852  hypothetical protein  44.83 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1944  hypothetical protein  44.83 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2051  hypothetical protein  44.83 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2896  hypothetical protein  44.83 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0331  hypothetical protein  44.83 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0877  excinuclease ABC subunit C  38.04 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  41.11 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2889  excinuclease ABC subunit C  43.18 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0492999  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1144  hypothetical protein  41.57 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  40.7 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2430  excinuclease ABC subunit C  43.02 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0916  excinuclease ABC subunit C  44.57 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0895  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.78 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00270858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1965  excinuclease ABC subunit C  41.94 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.70444 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  41.86 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.84 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0883  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227593  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05230  hypothetical protein  42.39 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610254  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4056  excinuclease ABC subunit C  38.2 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4264  excinuclease ABC subunit C  40.22 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604611  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05270  hypothetical protein  42.17 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05260  endo/excinuclease amino terminal domain protein  40.96 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.509703  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1328  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2855  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.84 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4684  excinuclease ABC subunit C  38.04 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2807  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3672  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.246174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1655  excinuclease ABC subunit C  43.33 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0957  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00735212  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1975  excinuclease ABC subunit C  36.67 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2181  excinuclease ABC subunit C  34.74 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00892068  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0893  excinuclease ABC subunit C  34.07 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01100  hypothetical protein  50.88 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0733  excinuclease ABC subunit C  31.11 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.579236  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  32.61 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  40.91 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1913  hypothetical protein  32.22 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.915766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0827  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437312 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3906  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647444  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4267  excinuclease ABC subunit C  34.09 
 
 		 180 aa  53.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4036  hypothetical protein  42.42 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4673  excinuclease ABC subunit C  33.7 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0203068  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09001  hypothetical protein  40.54 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1103  excinuclease ABC subunit C  39.24 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0811  hypothetical protein  34.09 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0782  hypothetical protein  34.09 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0981  excinuclease ABC subunit C  33.75 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  39.24 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1648  excinuclease ABC subunit C  33.75 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.732413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2245  excinuclease ABC subunit C  37.97 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  39.76 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  39.76 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4370  excinuclease ABC subunit C  36.14 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.77 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0098  excinuclease ABC subunit C  39.73 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807182  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0133  excinuclease ABC subunit C  37.33 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0136  excinuclease ABC subunit C  39.19 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0376  excinuclease ABC subunit C  33.7 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.604182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0145  endonuclease  36.99 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>