78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01100 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01100  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  140  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3101  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  58.73 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0358  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  57.14 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  55 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  46.77 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2997  excinuclease ABC subunit C  51.61 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.867299  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2291  excinuclease ABC subunit C  44.44 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361879  normal  0.317834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2430  excinuclease ABC subunit C  46.77 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1655  excinuclease ABC subunit C  46.77 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2878  excinuclease ABC subunit C  44.44 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00418139  hitchhiker  0.000396722 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  45.16 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1144  hypothetical protein  45.16 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2227  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000408802  hitchhiker  0.0000527007 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  46.03 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1266  excinuclease ABC subunit C  39.68 
 
 		 109 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0720825  normal  0.107878 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2602  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.83 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000820325  normal  0.0436651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0916  excinuclease ABC subunit C  47.37 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1975  excinuclease ABC subunit C  45.16 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.37 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  42.62 
 
 		 115 aa  60.1  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1277  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50.88 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.129449  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0331  hypothetical protein  42.86 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3151  excinuclease ABC subunit C  39.68 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0891506  normal  0.0226516 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3382  excinuclease ABC subunit C  39.66 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114521  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2226  excinuclease ABC subunit C  40.32 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.163339  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0717  hypothetical protein  41.27 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0882  hypothetical protein  41.27 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0039  hypothetical protein  41.27 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2051  hypothetical protein  41.27 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1944  hypothetical protein  41.27 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2896  hypothetical protein  41.27 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1812  hypothetical protein  41.27 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1852  hypothetical protein  41.27 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1053  excinuclease ABC, C subunit  39.68 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.175656  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.34 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1362  excinuclease ABC subunit C  39.66 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0294  hypothetical cytosolic protein  46.3 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.479939  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2914  excinuclease ABC subunit C  51.56 
 
 		 101 aa  57  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00677745  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1899  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  46.3 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  43.86 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2317  excinuclease ABC subunit C  40.68 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0365776  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3175  excinuclease ABC subunit C  39.66 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2055  hypothetical protein  40.98 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  42.11 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0883  excinuclease ABC subunit C  41.94 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227593  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  41.38 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4225  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.93 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073463  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3180  excinuclease ABC subunit C  37.93 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734981  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4056  excinuclease ABC subunit C  43.1 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.38 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.38 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0733  excinuclease ABC subunit C  39.34 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.579236  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4264  excinuclease ABC subunit C  38.33 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604611  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0285  excinuclease ABC subunit C  34.92 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722146  normal  0.992997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2889  excinuclease ABC subunit C  36.51 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0492999  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05230  hypothetical protein  47.17 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610254  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7339  putative excinuclease ABC, C subunit  43.86 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2352  excinuclease ABC subunit C  36.21 
 
 		 110 aa  50.1  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.51382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0827  excinuclease ABC subunit C  46.94 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437312 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2170  excinuclease ABC subunit C  32.76 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.013295  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2855  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.38 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4684  excinuclease ABC subunit C  38.1 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05250  endo/excinuclease amino terminal domain protein  44.83 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0957  excinuclease ABC subunit C  32.76 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00735212  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3672  excinuclease ABC subunit C  32.76 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.246174  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2807  excinuclease ABC subunit C  32.76 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  35.09 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2181  excinuclease ABC subunit C  33.9 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00892068  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1965  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.70444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2057  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1328  excinuclease ABC subunit C  36.21 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  46.55 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  46.55 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09001  hypothetical protein  44 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1622  excinuclease ABC subunit C  54.55 
 
 		 95 aa  43.9  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  41.38 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3906  excinuclease ABC subunit C  35.29 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647444  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0877  excinuclease ABC subunit C  36.21 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>