67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0210 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0210  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1944  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.47 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752306 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1593  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.758459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3906  excinuclease ABC subunit C  36.51 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647444  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3661  excinuclease ABC subunit C  42.25 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.902012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0107  hypothetical protein  37.66 
 
 		 83 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.629422 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2291  excinuclease ABC subunit C  37.88 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361879  normal  0.317834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0671  Excinuclease ABC C subunit domain protein  34.57 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.807628  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1158  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 		 93 aa  48.9  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1816  excinuclease ABC, C subunit-like protein  33.33 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.406649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2430  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  36.62 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.24 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1901  excinuclease ABC subunit C  41.79 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.873761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2889  excinuclease ABC subunit C  35.29 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0492999  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4146  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.3 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.824379  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.14 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  32.91 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3467  excinuclease ABC subunit C  40.3 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.506637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.83 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.38 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1935  excinuclease ABC subunit C  30.95 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.517176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  40.62 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0838  type I restriction-modification system, R subunit  36.07 
 
 		 1210 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0136  excinuclease ABC subunit C  40.58 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228252 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  36.36 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  37.88 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  37.88 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4264  excinuclease ABC subunit C  34.33 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604611  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  32.88 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0402  excinuclease ABC subunit C  32.89 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  44.44 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2855  Excinuclease ABC C subunit domain protein  33.33 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  40.38 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  40.38 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4364  putative excinuclease ABC protein, C subunit  37.14 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0179482 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  29.85 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0062  Excinuclease ABC C subunit domain protein  32.89 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.330089  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  31.82 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2479  excinuclease ABC subunit C  37.68 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0136  excinuclease ABC subunit C  44.44 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3175  excinuclease ABC subunit C  35.62 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2483  excinuclease ABC subunit C  37.68 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  32.31 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2480  excinuclease ABC subunit C  37.68 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2484  excinuclease ABC subunit C  37.68 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  36.11 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  31.51 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2485  excinuclease ABC subunit C  37.68 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  31.51 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2486  excinuclease ABC subunit C  37.68 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2482  excinuclease ABC subunit C  37.68 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3180  excinuclease ABC subunit C  34.25 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734981  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  33.96 
 
 		 77 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0137  excinuclease ABC subunit C  42.59 
 
 		 139 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0489368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0131  excinuclease ABC subunit C  40.74 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  31.51 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1648  excinuclease ABC subunit C  32.86 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.732413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4056  excinuclease ABC subunit C  31.82 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.38 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2985  Excinuclease ABC C subunit domain protein  31.94 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00056528  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1899  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  30.3 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0294  hypothetical cytosolic protein  30.3 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.479939  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  40.38 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0145  hypothetical protein  40.74 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4225  Excinuclease ABC C subunit domain protein  32.88 
 
 		 95 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>