150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4056 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4056  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 130 aa  268  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3175  excinuclease ABC subunit C  53.26 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2889  excinuclease ABC subunit C  55.32 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0492999  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3180  excinuclease ABC subunit C  52.17 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734981  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  52.63 
 
 		 101 aa  108  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2352  excinuclease ABC subunit C  50.53 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.51382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0733  excinuclease ABC subunit C  56.98 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.579236  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3101  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  55.81 
 
 		 95 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4684  excinuclease ABC subunit C  58.82 
 
 		 99 aa  104  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0285  excinuclease ABC subunit C  52.75 
 
 		 95 aa  103  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722146  normal  0.992997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2855  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.94 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675434  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1144  hypothetical protein  46.88 
 
 		 97 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2181  excinuclease ABC subunit C  53.41 
 
 		 113 aa  102  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00892068  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1266  excinuclease ABC subunit C  52.81 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0720825  normal  0.107878 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2226  excinuclease ABC subunit C  52.94 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.163339  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0827  excinuclease ABC subunit C  53.85 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437312 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2430  excinuclease ABC subunit C  51.55 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  56.47 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2057  excinuclease ABC subunit C  55.43 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  55.68 
 
 		 95 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  48.91 
 
 		 95 aa  100  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0039  hypothetical protein  51.16 
 
 		 97 aa  99.4  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0717  hypothetical protein  51.16 
 
 		 97 aa  99.4  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0882  hypothetical protein  51.16 
 
 		 97 aa  99.4  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1812  hypothetical protein  51.16 
 
 		 97 aa  99.4  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1852  hypothetical protein  51.16 
 
 		 97 aa  99.4  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1944  hypothetical protein  51.16 
 
 		 97 aa  99.4  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2051  hypothetical protein  51.16 
 
 		 97 aa  99.4  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2896  hypothetical protein  51.16 
 
 		 97 aa  99.4  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4225  Excinuclease ABC C subunit domain protein  47.25 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073463  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0877  excinuclease ABC subunit C  42.98 
 
 		 125 aa  99.4  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0331  hypothetical protein  51.16 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1053  excinuclease ABC, C subunit  50.56 
 
 		 110 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.175656  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50.55 
 
 		 96 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3382  excinuclease ABC subunit C  51.14 
 
 		 120 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114521  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2878  excinuclease ABC subunit C  51.16 
 
 		 95 aa  96.7  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00418139  hitchhiker  0.000396722 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4264  excinuclease ABC subunit C  47.83 
 
 		 95 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604611  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  48.89 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  48.94 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  50.56 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  47.78 
 
 		 100 aa  94.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2170  excinuclease ABC subunit C  51.11 
 
 		 98 aa  94.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.013295  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0883  excinuclease ABC subunit C  46.15 
 
 		 114 aa  94  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227593  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.09 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0893  excinuclease ABC subunit C  51.69 
 
 		 99 aa  92  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1328  excinuclease ABC subunit C  49.45 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0957  excinuclease ABC subunit C  54.12 
 
 		 118 aa  92  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00735212  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2807  excinuclease ABC subunit C  54.12 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3672  excinuclease ABC subunit C  54.12 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.246174  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  49.41 
 
 		 100 aa  91.3  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2227  excinuclease ABC subunit C  40.78 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000408802  hitchhiker  0.0000527007 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2291  excinuclease ABC subunit C  48.84 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361879  normal  0.317834 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3151  excinuclease ABC subunit C  50.59 
 
 		 96 aa  90.9  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0891506  normal  0.0226516 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2602  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.3 
 
 		 97 aa  89.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000820325  normal  0.0436651 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1965  excinuclease ABC subunit C  47.83 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.70444 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  46.59 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2317  excinuclease ABC subunit C  43.48 
 
 		 98 aa  89.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0365776  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  50.59 
 
 		 95 aa  87  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1362  excinuclease ABC subunit C  44.57 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05230  hypothetical protein  42.22 
 
 		 100 aa  86.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610254  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0916  excinuclease ABC subunit C  49.41 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2055  hypothetical protein  46.07 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7339  putative excinuclease ABC, C subunit  42 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2997  excinuclease ABC subunit C  43.33 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.867299  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1975  excinuclease ABC subunit C  45.35 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0294  hypothetical cytosolic protein  44.71 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.479939  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1899  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  44.71 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0358  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  42.35 
 
 		 96 aa  83.6  8e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4673  excinuclease ABC subunit C  47.06 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0203068  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05270  hypothetical protein  41.46 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1655  excinuclease ABC subunit C  47.83 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05260  endo/excinuclease amino terminal domain protein  39.76 
 
 		 98 aa  76.6  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.509703  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0895  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.23 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00270858 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05250  endo/excinuclease amino terminal domain protein  40.7 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4036  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1277  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.2 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.129449  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2914  excinuclease ABC subunit C  39.53 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00677745  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09001  hypothetical protein  39.73 
 
 		 80 aa  63.9  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  49.25 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3906  excinuclease ABC subunit C  42.19 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647444  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2943  Excinuclease ABC C subunit domain protein  47.76 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2851  Excinuclease ABC C subunit domain protein  47.76 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01100  hypothetical protein  43.1 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  38.27 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4267  excinuclease ABC subunit C  36.46 
 
 		 180 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11350  GIY-YIG nuclease superfamily protein  37.66 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.651931  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0972  GIY-YIG nuclease superfamily protein  36 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1913  hypothetical protein  33.71 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.915766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1011  GIY-YIG nuclease superfamily protein  36 
 
 		 113 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  41.18 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2245  excinuclease ABC subunit C  38.96 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  35.37 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2225  hypothetical protein  48.94 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.528424 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  32.58 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0133  excinuclease ABC subunit C  36.11 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  37.04 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  31.46 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  34.78 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0979  GIY-YIG nuclease superfamily protein  36.36 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>