140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0767 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 102 aa  213  9e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4684  excinuclease ABC subunit C  62.77 
 
 		 99 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  56.67 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4673  excinuclease ABC subunit C  57.95 
 
 		 95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0203068  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  51.11 
 
 		 95 aa  107  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2807  excinuclease ABC subunit C  53.85 
 
 		 118 aa  104  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3672  excinuclease ABC subunit C  53.85 
 
 		 118 aa  104  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.246174  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0957  excinuclease ABC subunit C  52.75 
 
 		 118 aa  103  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00735212  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1266  excinuclease ABC subunit C  50.56 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0720825  normal  0.107878 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0916  excinuclease ABC subunit C  53.41 
 
 		 95 aa  101  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.74 
 
 		 96 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1053  excinuclease ABC, C subunit  45.36 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.175656  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0893  excinuclease ABC subunit C  49.44 
 
 		 99 aa  100  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3151  excinuclease ABC subunit C  47.87 
 
 		 96 aa  100  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0891506  normal  0.0226516 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1328  excinuclease ABC subunit C  50.57 
 
 		 95 aa  100  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1975  excinuclease ABC subunit C  51 
 
 		 118 aa  99.4  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2226  excinuclease ABC subunit C  47.37 
 
 		 119 aa  97.8  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.163339  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1362  excinuclease ABC subunit C  50.57 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.76 
 
 		 95 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2181  excinuclease ABC subunit C  47.78 
 
 		 113 aa  96.7  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00892068  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0883  excinuclease ABC subunit C  50.56 
 
 		 114 aa  95.9  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227593  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2855  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.65 
 
 		 96 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2352  excinuclease ABC subunit C  46.67 
 
 		 110 aa  94.7  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.51382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4056  excinuclease ABC subunit C  50.56 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366291  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3101  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  48.89 
 
 		 95 aa  94  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1965  excinuclease ABC subunit C  45.26 
 
 		 95 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.70444 
 
 
-
 
NC_002978  WD0358  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  49.43 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05230  hypothetical protein  48.28 
 
 		 100 aa  92.8  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610254  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3175  excinuclease ABC subunit C  45.56 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  45.16 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2430  excinuclease ABC subunit C  48.84 
 
 		 102 aa  92  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3180  excinuclease ABC subunit C  45.56 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734981  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.15 
 
 		 95 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2291  excinuclease ABC subunit C  47.78 
 
 		 95 aa  90.5  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361879  normal  0.317834 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4264  excinuclease ABC subunit C  46.67 
 
 		 95 aa  90.5  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604611  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0733  excinuclease ABC subunit C  48.86 
 
 		 104 aa  90.1  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.579236  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1144  hypothetical protein  46.51 
 
 		 97 aa  89.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0895  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.96 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00270858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7339  putative excinuclease ABC, C subunit  45.74 
 
 		 101 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  43.48 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  46.51 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  43.82 
 
 		 111 aa  88.2  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.11 
 
 		 100 aa  88.2  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2170  excinuclease ABC subunit C  43.16 
 
 		 98 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.013295  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  41.76 
 
 		 95 aa  87.8  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2055  hypothetical protein  47.25 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0827  excinuclease ABC subunit C  50.59 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437312 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0877  excinuclease ABC subunit C  41.86 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  43.48 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05260  endo/excinuclease amino terminal domain protein  48.84 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.509703  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4225  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.22 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073463  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0285  excinuclease ABC subunit C  45.05 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722146  normal  0.992997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2878  excinuclease ABC subunit C  46.67 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00418139  hitchhiker  0.000396722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3382  excinuclease ABC subunit C  41.86 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114521  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2914  excinuclease ABC subunit C  43.62 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00677745  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0294  hypothetical cytosolic protein  41.76 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.479939  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1899  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  41.76 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  44.44 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05270  hypothetical protein  44.58 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0039  hypothetical protein  43.33 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0717  hypothetical protein  43.33 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0882  hypothetical protein  43.33 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1812  hypothetical protein  43.33 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1852  hypothetical protein  43.33 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1944  hypothetical protein  43.33 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2051  hypothetical protein  43.33 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2896  hypothetical protein  43.33 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0331  hypothetical protein  43.33 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05250  endo/excinuclease amino terminal domain protein  44.44 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2889  excinuclease ABC subunit C  44.19 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0492999  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2227  excinuclease ABC subunit C  40.91 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000408802  hitchhiker  0.0000527007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2602  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.08 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000820325  normal  0.0436651 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2317  excinuclease ABC subunit C  41.86 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0365776  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2057  excinuclease ABC subunit C  40.45 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2997  excinuclease ABC subunit C  42.35 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.867299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1655  excinuclease ABC subunit C  47.25 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09001  hypothetical protein  40.28 
 
 		 80 aa  65.5  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1277  Excinuclease ABC C subunit domain protein  32.61 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.129449  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4036  hypothetical protein  38.57 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0126  hypothetical protein  35.06 
 
 		 82 aa  52.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1648  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 117 aa  52.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.732413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4162  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.39 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2245  excinuclease ABC subunit C  36.84 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1913  hypothetical protein  29.89 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.915766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3906  excinuclease ABC subunit C  37.1 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647444  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  33.77 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1622  excinuclease ABC subunit C  56.76 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  35 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21070  predicted endonuclease containing a URI domain  30.59 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4370  excinuclease ABC subunit C  41.18 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.36 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  32.93 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3763  excinuclease ABC subunit C  39.13 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0133  excinuclease ABC subunit C  34.15 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  32.91 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1009  Excinuclease ABC C subunit domain protein  33.8 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  37.66 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>