More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0113 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0113  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
484 aa  1002    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  77.64 
 
 
483 aa  796    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  88.22 
 
 
484 aa  880    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  58.13 
 
 
484 aa  553  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  58.61 
 
 
484 aa  550  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  58.61 
 
 
484 aa  550  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  56.3 
 
 
499 aa  538  1e-151  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 
491 aa  531  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 
486 aa  519  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 
485 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 
491 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 
485 aa  498  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 
485 aa  498  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 
485 aa  498  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 
485 aa  498  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 
485 aa  498  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 
485 aa  498  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0321  glutamyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 
498 aa  499  1e-140  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  54.16 
 
 
491 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 
491 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 
485 aa  491  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0161  glutamyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 
498 aa  488  1e-137  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0361508  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1201  glutamyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
501 aa  450  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000196599  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
482 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
485 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
488 aa  413  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
488 aa  411  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf641  glutamyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
464 aa  410  1e-113  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
482 aa  404  1e-111  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  43 
 
 
485 aa  395  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
485 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0130  glutamyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
483 aa  386  1e-106  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
494 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0704  glutamyl-tRNA synthetase  43 
 
 
482 aa  375  1e-103  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.574846  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 
490 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
490 aa  366  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
488 aa  363  5.0000000000000005e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
477 aa  361  1e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
501 aa  355  7.999999999999999e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
479 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
493 aa  355  1e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
481 aa  354  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
490 aa  354  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
469 aa  350  2e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
481 aa  348  1e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
494 aa  348  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
478 aa  344  2e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
469 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  38.65 
 
 
495 aa  340  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
481 aa  340  2.9999999999999998e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
469 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
465 aa  340  4e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
881 aa  340  4e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
492 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
473 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
482 aa  335  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
481 aa  332  7.000000000000001e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 
491 aa  332  1e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
500 aa  332  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
504 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
504 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
504 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
469 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
469 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
469 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
469 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
487 aa  329  6e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 
483 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 
504 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 
484 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 
472 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
483 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 
495 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
469 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 
469 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
488 aa  325  8.000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4767  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
468 aa  325  8.000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.156269 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
512 aa  325  9e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2123  glutamyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 
468 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000117381  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 
502 aa  324  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1377  glutamyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 
469 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000079335  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 
502 aa  323  5e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 
484 aa  323  6e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2140  glutamyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 
465 aa  323  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000804672  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
471 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2224  glutamyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
469 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  38.33 
 
 
546 aa  322  9.999999999999999e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 
471 aa  320  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
469 aa  319  6e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06791  glutamyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
476 aa  319  6e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 
471 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1179  glutamyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 
500 aa  319  7.999999999999999e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000996044  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
472 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
471 aa  318  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1958  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
469 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846631  normal  0.452731 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
471 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
471 aa  318  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
502 aa  317  2e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2495  glutamyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 
469 aa  318  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.00468963 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  37.68 
 
 
471 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>