More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0083 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0083  30S ribosomal protein S11  100 
 
 
127 aa  254  4e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000400569  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1882  30S ribosomal protein S11  97.64 
 
 
127 aa  232  1e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  86.18 
 
 
129 aa  218  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  86.18 
 
 
129 aa  218  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  85.37 
 
 
129 aa  216  7e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1458  30S ribosomal protein S11  84.8 
 
 
129 aa  204  4e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  4.30937e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2376  30S ribosomal protein S11  89.76 
 
 
127 aa  203  6e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00164353  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  85.37 
 
 
129 aa  201  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.08519e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0137  30S ribosomal protein S11  83.74 
 
 
129 aa  197  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.97157e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0131  30S ribosomal protein S11  86.18 
 
 
129 aa  195  2e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.58036e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0129  30S ribosomal protein S11  86.18 
 
 
129 aa  195  2e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.61096e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0157  30S ribosomal protein S11  85.37 
 
 
129 aa  194  2e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.39705e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5169  30S ribosomal protein S11  86.18 
 
 
129 aa  194  2e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.15107e-10  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0136  30S ribosomal protein S11  86.18 
 
 
129 aa  195  2e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.20861e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0167  30S ribosomal protein S11  86.18 
 
 
129 aa  195  2e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  8.03352e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0136  30S ribosomal protein S11  86.18 
 
 
129 aa  195  2e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  6.02059e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0220  30S ribosomal protein S11  88 
 
 
128 aa  195  2e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.275034  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0133  30S ribosomal protein S11  82.11 
 
 
129 aa  194  2e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0136  30S ribosomal protein S11  86.18 
 
 
129 aa  195  2e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  7.00978e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0149  30S ribosomal protein S11  86.18 
 
 
129 aa  195  2e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.28722e-60 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0315  30S ribosomal protein S11  84.8 
 
 
129 aa  194  3e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.50356e-25 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  72.09 
 
 
129 aa  193  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  71.32 
 
 
129 aa  193  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0130  30S ribosomal protein S11  84.55 
 
 
129 aa  193  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.00663e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  71.9 
 
 
129 aa  192  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  71.2 
 
 
131 aa  191  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.83991e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 
129 aa  191  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  72.73 
 
 
129 aa  190  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  70.54 
 
 
129 aa  190  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0616  30S ribosomal protein S11  68.22 
 
 
129 aa  189  8e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 
129 aa  189  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  74.38 
 
 
128 aa  189  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.06792e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  71.9 
 
 
129 aa  189  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  71.9 
 
 
129 aa  189  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  71.9 
 
 
129 aa  189  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  71.07 
 
 
129 aa  189  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  71.9 
 
 
129 aa  189  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 
129 aa  187  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  68.6 
 
 
131 aa  187  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  9.18972e-09  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 
129 aa  186  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  74.8 
 
 
131 aa  186  9e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  73.28 
 
 
129 aa  185  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  74.14 
 
 
129 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  74.14 
 
 
129 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 
129 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 
129 aa  185  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 
129 aa  185  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  69.05 
 
 
129 aa  185  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  69.05 
 
 
129 aa  185  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  69.77 
 
 
129 aa  185  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  70.99 
 
 
131 aa  184  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 
129 aa  184  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 
129 aa  183  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  75.65 
 
 
130 aa  183  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 
130 aa  183  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 
129 aa  182  9e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  68.6 
 
 
129 aa  182  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  68.99 
 
 
129 aa  182  1e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  68.6 
 
 
130 aa  182  1e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  75.65 
 
 
131 aa  182  1e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  75.65 
 
 
131 aa  182  2e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  4.56607e-06 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  73.04 
 
 
131 aa  182  2e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 
130 aa  181  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl149  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 
130 aa  180  6e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  5.75404e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  71.55 
 
 
129 aa  180  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  67.77 
 
 
131 aa  179  8e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
135 aa  179  9e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3419  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
133 aa  179  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.119474 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  68.99 
 
 
129 aa  179  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.59501e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  68.99 
 
 
129 aa  179  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2151  30S ribosomal protein S11  68.99 
 
 
129 aa  179  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.7735e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2930  30S ribosomal protein S11  80.33 
 
 
134 aa  179  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000145745  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
133 aa  178  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
134 aa  178  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  1.05746e-09 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0082  30S ribosomal protein S11  69.77 
 
 
129 aa  178  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  6.25128e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
134 aa  178  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
134 aa  178  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
133 aa  178  3e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
133 aa  178  3e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
133 aa  178  3e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
133 aa  178  3e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
133 aa  178  3e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
133 aa  178  3e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
133 aa  178  3e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
133 aa  178  3e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
133 aa  178  3e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
133 aa  178  3e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
133 aa  178  3e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
133 aa  178  3e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
133 aa  178  3e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
133 aa  178  3e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
133 aa  178  3e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  75.21 
 
 
130 aa  177  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  4.94342e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0512  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 
129 aa  177  4e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11652  hitchhiker  0.00952872 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2528  30S ribosomal protein S11  69.84 
 
 
129 aa  177  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.481275  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  66.92 
 
 
130 aa  177  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.27993e-06  unclonable  9.19144e-06 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0507  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 
129 aa  177  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00376989  normal  0.069652 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3799  30S ribosomal protein S11  67.44 
 
 
129 aa  177  5e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3613  30S ribosomal protein S11  67.44 
 
 
129 aa  177  5e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00134375  normal  0.497735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 
132 aa  177  5e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>