More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2376 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2376  30S ribosomal protein S11  100 
 
 
127 aa  254  3e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00164353  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1882  30S ribosomal protein S11  90.55 
 
 
127 aa  213  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  80.8 
 
 
129 aa  209  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  80.8 
 
 
129 aa  209  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  80.8 
 
 
129 aa  209  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0083  30S ribosomal protein S11  89.76 
 
 
127 aa  209  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000400569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  80.49 
 
 
129 aa  192  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  73.44 
 
 
128 aa  191  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0220  30S ribosomal protein S11  84 
 
 
128 aa  190  7e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.275034  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0137  30S ribosomal protein S11  80.49 
 
 
129 aa  189  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000197157  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1458  30S ribosomal protein S11  79.2 
 
 
129 aa  188  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000430937  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0133  30S ribosomal protein S11  78.86 
 
 
129 aa  186  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0315  30S ribosomal protein S11  78.4 
 
 
129 aa  186  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.50356e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0157  30S ribosomal protein S11  81.3 
 
 
129 aa  185  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000139705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0136  30S ribosomal protein S11  80.49 
 
 
129 aa  185  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0136  30S ribosomal protein S11  80.49 
 
 
129 aa  185  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000120861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0131  30S ribosomal protein S11  80.49 
 
 
129 aa  185  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000558036  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0129  30S ribosomal protein S11  80.49 
 
 
129 aa  185  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000161096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0149  30S ribosomal protein S11  80.49 
 
 
129 aa  185  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.28722e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0136  30S ribosomal protein S11  80.49 
 
 
129 aa  185  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000602059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5169  30S ribosomal protein S11  81.3 
 
 
129 aa  185  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0167  30S ribosomal protein S11  80.49 
 
 
129 aa  185  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 
129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0130  30S ribosomal protein S11  78.86 
 
 
129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000100663  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  65.6 
 
 
131 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
129 aa  181  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
131 aa  181  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  68.6 
 
 
129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 
129 aa  180  6e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  72.36 
 
 
131 aa  180  7e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  67.44 
 
 
129 aa  179  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  67.77 
 
 
129 aa  179  9.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  67.77 
 
 
129 aa  179  9.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  67.77 
 
 
129 aa  179  9.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  67.77 
 
 
129 aa  179  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  66.12 
 
 
129 aa  179  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0616  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 
129 aa  178  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
129 aa  178  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
129 aa  177  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  67.77 
 
 
129 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  68.7 
 
 
131 aa  177  5.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
129 aa  177  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
131 aa  176  7e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl149  30S ribosomal protein S11  69.17 
 
 
130 aa  176  8e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575404  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 
129 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  68.97 
 
 
129 aa  176  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  69.83 
 
 
129 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  69.83 
 
 
129 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
130 aa  174  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3419  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 
133 aa  174  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.119474 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
129 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 
129 aa  174  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  70.43 
 
 
130 aa  174  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0404  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 
134 aa  174  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 
129 aa  174  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 
129 aa  174  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
129 aa  174  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0396  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 
134 aa  174  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 
129 aa  174  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
130 aa  174  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0624  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 
134 aa  173  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3925  30S ribosomal protein S11  63.33 
 
 
134 aa  173  9e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1045  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 
134 aa  173  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0619  30S ribosomal protein S11  75.83 
 
 
132 aa  172  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000412028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5047  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 
134 aa  171  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  69.57 
 
 
131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 
133 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 
134 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 
133 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 
133 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 
133 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 
133 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 
133 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0512  30S ribosomal protein S11  63.57 
 
 
129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11652  hitchhiker  0.00952872 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 
133 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0726  30S ribosomal protein S11  68 
 
 
131 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873114  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 
133 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 
133 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  69.57 
 
 
131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 
133 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 
133 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 
134 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 
133 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 
134 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  68.97 
 
 
129 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0507  30S ribosomal protein S11  63.57 
 
 
129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00376989  normal  0.069652 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 
133 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 
133 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 
133 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  66.96 
 
 
131 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 
130 aa  171  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 
129 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 
133 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 
129 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2303  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 
134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 
135 aa  170  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 
132 aa  170  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2930  30S ribosomal protein S11  77.05 
 
 
134 aa  170  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000145745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>