More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0074 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  100 
 
 
118 aa  237  4e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  97.46 
 
 
118 aa  233  6e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  77.12 
 
 
118 aa  186  8e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  5.95755e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  76.27 
 
 
118 aa  185  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  76.27 
 
 
117 aa  183  7e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  72.27 
 
 
119 aa  177  5e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  72.5 
 
 
120 aa  171  4e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.42863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  72.5 
 
 
120 aa  171  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.11819e-09  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  71.67 
 
 
120 aa  168  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  71.67 
 
 
120 aa  168  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  6.18216e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  71.67 
 
 
120 aa  168  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.09989e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  71.67 
 
 
120 aa  168  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.39258e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  71.67 
 
 
120 aa  168  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.02498e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  71.67 
 
 
120 aa  168  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.09054e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  71.67 
 
 
120 aa  168  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.40079e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2385  50S ribosomal protein L18  77.12 
 
 
115 aa  168  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00226335  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  67.5 
 
 
120 aa  167  6e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  70.83 
 
 
120 aa  166  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  70.83 
 
 
120 aa  166  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  5.38516e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  65.83 
 
 
120 aa  158  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  64.71 
 
 
119 aa  157  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  64.71 
 
 
119 aa  157  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  63.33 
 
 
120 aa  153  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  62.18 
 
 
119 aa  151  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 
122 aa  149  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  67.86 
 
 
125 aa  149  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  59.84 
 
 
122 aa  147  5e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  59.84 
 
 
122 aa  146  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.6259e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 
121 aa  145  1e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  58.47 
 
 
116 aa  144  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  58.82 
 
 
119 aa  144  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  58.82 
 
 
119 aa  144  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  63.06 
 
 
120 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 
120 aa  142  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  57.38 
 
 
122 aa  142  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  63.06 
 
 
120 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  55.74 
 
 
122 aa  141  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  60.16 
 
 
122 aa  141  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  58.2 
 
 
122 aa  141  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  63.96 
 
 
120 aa  139  1e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  60.68 
 
 
122 aa  139  2e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  56.67 
 
 
120 aa  138  2e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  63.73 
 
 
117 aa  137  4e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  60.91 
 
 
118 aa  137  5e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  60.71 
 
 
122 aa  136  9e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  58.26 
 
 
115 aa  136  1e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  55.65 
 
 
116 aa  135  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  59.82 
 
 
122 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  58.68 
 
 
121 aa  135  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  58.93 
 
 
120 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  5.04342e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  58.12 
 
 
118 aa  135  3e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  57.85 
 
 
121 aa  134  4e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.58089e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  54.78 
 
 
116 aa  134  4e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  60 
 
 
120 aa  134  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  59.82 
 
 
122 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  57.14 
 
 
116 aa  134  6e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0490  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 
121 aa  133  7e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 
121 aa  133  7e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  7.81328e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  58.47 
 
 
114 aa  132  2e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  56.56 
 
 
122 aa  132  2e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 
120 aa  131  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  63.96 
 
 
120 aa  131  4e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  58.77 
 
 
117 aa  131  4e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  57.63 
 
 
124 aa  130  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  57.85 
 
 
121 aa  130  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  54.92 
 
 
122 aa  130  6e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  66.02 
 
 
121 aa  130  7e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  53.28 
 
 
122 aa  130  7e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  53.28 
 
 
122 aa  130  7e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  60 
 
 
114 aa  130  8e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  57.5 
 
 
118 aa  130  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  61.82 
 
 
121 aa  129  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.62342e-09  hitchhiker  3.24401e-08 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17251  50S ribosomal protein L18  58.04 
 
 
122 aa  129  1e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
122 aa  129  1e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  4.55959e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  60.34 
 
 
120 aa  129  2e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  54.7 
 
 
119 aa  128  2e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  60.34 
 
 
120 aa  129  2e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  67.35 
 
 
117 aa  128  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0714  50S ribosomal protein L18  57.39 
 
 
120 aa  127  4e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0742927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  62.16 
 
 
120 aa  127  5e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  62.16 
 
 
120 aa  127  5e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0598  50S ribosomal protein L18  65.74 
 
 
124 aa  127  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  52.46 
 
 
124 aa  127  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.00708e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  60.36 
 
 
120 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  61.26 
 
 
120 aa  127  7e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  58.18 
 
 
122 aa  127  7e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  9.83895e-07 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  64.81 
 
 
124 aa  126  8e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2982  50S ribosomal protein L18  66.32 
 
 
120 aa  126  8e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.864504  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  53.72 
 
 
122 aa  126  8e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  54.92 
 
 
122 aa  127  8e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.52303e-10 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  58.33 
 
 
117 aa  126  9e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  2.57389e-05  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 
136 aa  125  1e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  6.97313e-06  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23181  50S ribosomal protein L18  62.38 
 
 
122 aa  126  1e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  53.39 
 
 
123 aa  126  1e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  54.03 
 
 
124 aa  125  2e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0231  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 
122 aa  125  2e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00019392  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1348  50S ribosomal protein L18  59.46 
 
 
120 aa  124  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  4.32903e-05  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  57.63 
 
 
120 aa  124  4e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  62.63 
 
 
120 aa  124  4e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  64 
 
 
121 aa  124  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  7.37084e-06  hitchhiker  6.40833e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>