More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1929 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0708  peptidase S16, lon domain protein  47.4 
 
 		 819 aa  761    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3051  peptidase S16 lon domain protein  46 
 
 		 825 aa  737    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2433  ATP-dependent protease, putative  48.44 
 
 		 821 aa  775    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0680  ATP-dependent protease, putative  44.33 
 
 		 812 aa  662    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0697551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0740  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.23 
 
 		 843 aa  828    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0853  ATP-dependent protease, putative  53.43 
 
 		 844 aa  857    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105216  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0263  hypothetical protein  42.04 
 
 		 786 aa  659    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1200  ATP-dependent protease-like protein  44.57 
 
 		 829 aa  671    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000280038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0259  peptidase S16 lon domain protein  54.78 
 
 		 832 aa  867    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4585  ATP-dependent protease, putative  43.69 
 
 		 811 aa  678    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560792  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2107  peptidase S16 lon domain-containing protein  50.5 
 
 		 806 aa  760    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.801534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  41.27 
 
 		 786 aa  652    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3069  ATP-dependent protease, putative  45.08 
 
 		 813 aa  701    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  48.12 
 
 		 805 aa  775    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4259  ATP-dependent protease, putative  43.82 
 
 		 811 aa  679    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1920  peptidase S16 lon domain protein  52.49 
 
 		 808 aa  887    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5216  putative ATP-dependent protease  44.52 
 
 		 817 aa  685    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0128241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1359  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.43 
 
 		 807 aa  684    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4869  ATP-dependent protease, putative  43.95 
 
 		 812 aa  669    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1020  ATP-dependent protease  45.64 
 
 		 803 aa  717    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2309  peptidase S16 lon domain protein  43.77 
 
 		 817 aa  665    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0298  ATP-dependent protease, putative  52.84 
 
 		 799 aa  855    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2746  peptidase S16, lon-like  47.43 
 
 		 811 aa  775    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000135674  normal  0.815417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2449  peptidase S16 lon domain protein  49.94 
 
 		 809 aa  749    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3006  ATP-dependent protease-like protein  49.87 
 
 		 815 aa  759    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0787  ATP-dependent protease  54.92 
 
 		 861 aa  842    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1447  ATP-dependent protease, putative  56.83 
 
 		 806 aa  809    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2347  peptidase S16, lon domain-containing protein  47.27 
 
 		 805 aa  724    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0712  peptidase S16 lon domain-containing protein  44.2 
 
 		 812 aa  664    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0831  ATP-dependent protease, putative  55.01 
 
 		 811 aa  890    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.726223  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2088  peptidase S16 lon domain protein  54.08 
 
 		 803 aa  901    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0981  peptidase S16 lon domain protein  44.26 
 
 		 831 aa  689    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000165888  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4505  ATP-dependent protease  44.46 
 
 		 812 aa  674    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0802  peptidase S16, lon-like protein  42.39 
 
 		 801 aa  707    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2430  ATP-dependent protease, putative  48.21 
 
 		 798 aa  754    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1297  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.09 
 
 		 786 aa  664    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000625582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1773  peptidase S16, lon-like protein  45.64 
 
 		 814 aa  734    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0720  peptidase S16, lon domain protein  47.4 
 
 		 819 aa  762    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59212e-16 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0711  ATP-dependent protease-like protein  44.33 
 
 		 812 aa  662    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.807483  normal  0.0469717 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1417  peptidase S16 lon domain protein  49.44 
 
 		 819 aa  740    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185581  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03380  peptidase S16 lon domain protein  42.84 
 
 		 810 aa  687    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1929  ATP-dependent protease, putative  100 
 
 		 803 aa  1594    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355621  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  42.33 
 
 		 786 aa  660    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2123  peptidase S16 lon domain protein  53.06 
 
 		 809 aa  895    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0177  peptidase S16 lon domain protein  50.13 
 
 		 818 aa  758    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.16877  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2079  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.32 
 
 		 802 aa  677    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40850  ATP-dependent protease  44.7 
 
 		 806 aa  675    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.887392  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1717  peptidase S16, lon domain-containing protein  51.62 
 
 		 801 aa  821    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1517  peptidase S16, lon domain-containing protein  52.2 
 
 		 813 aa  822    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.30513  normal  0.334171 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0823  peptidase S16 lon domain protein  54.32 
 
 		 813 aa  872    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.517782 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0925  ATP-dependent protease  41.77 
 
 		 786 aa  648    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.819231  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2793  ATP-dependent protease, putative  53.34 
 
 		 814 aa  798    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60550  putative ATP-dependent protease  44.39 
 
 		 817 aa  682    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190138  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3407  peptidase S16 lon domain protein  43.55 
 
 		 806 aa  663    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025789  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1543  peptidase S16, lon domain-containing protein  49.08 
 
 		 865 aa  720    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0020  ATP-dependent protease, putative  41.5 
 
 		 823 aa  659    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140592  normal  0.225222 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1519  peptidase S16, lon-like protein  41.05 
 
 		 787 aa  664    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2264  putative ATP-dependent protease  41.71 
 
 		 827 aa  629  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.412132 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0928  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.89 
 
 		 794 aa  626  1e-178  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00182033  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1662  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.03 
 
 		 788 aa  622  1e-177  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0950  peptidase S16 lon domain-containing protein  42.89 
 
 		 794 aa  623  1e-177  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.71 
 
 		 810 aa  610  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2007  ATP-dependent protease, putative  41.58 
 
 		 829 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.303021  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01670  putative ATP-dependent protease  40.1 
 
 		 798 aa  601  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1294  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.25 
 
 		 805 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1328  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.38 
 
 		 805 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.047879 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3060  peptidase S16, lon domain protein  40.25 
 
 		 805 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0329616  hitchhiker  0.000400818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1976  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  39.78 
 
 		 800 aa  600  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000551631  normal  0.8017 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0312  peptidase S16 lon domain protein  41.03 
 
 		 873 aa  597  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1250  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.87 
 
 		 805 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2180  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  39.15 
 
 		 807 aa  593  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2181  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  40.03 
 
 		 795 aa  593  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1567  peptidase S16, lon-like  40.5 
 
 		 795 aa  593  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.617903  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  39.58 
 
 		 806 aa  590  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  39.92 
 
 		 805 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.92 
 
 		 805 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  39.92 
 
 		 805 aa  591  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2600  ATP-dependent protease, putative  44.41 
 
 		 784 aa  588  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  40.94 
 
 		 791 aa  588  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1607  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.64 
 
 		 815 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2463  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.2 
 
 		 816 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  37.73 
 
 		 777 aa  578  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0319  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.37 
 
 		 783 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  39.13 
 
 		 810 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1724  putative ATP-dependent protease LA  39.47 
 
 		 802 aa  567  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.79 
 
 		 806 aa  558  1e-157  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.347497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3315  putative ATP-dependent protease La, putative  41.75 
 
 		 806 aa  554  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1322  hypothetical protein  38.54 
 
 		 951 aa  548  1e-154  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2626  ATP-dependent protease, putative  40.48 
 
 		 803 aa  548  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000239913  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1056  peptidase S16, lon-like  38.31 
 
 		 975 aa  546  1e-154  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0590  ATP-dependent protease, putative  38.44 
 
 		 811 aa  542  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0118699 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0676  putative ATP-dependent protease LA, putative  39.85 
 
 		 810 aa  525  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2798  peptidase S16 lon domain protein  36.91 
 
 		 811 aa  505  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00224654  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0220  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.6 
 
 		 790 aa  504  1e-141  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.229141  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1037  peptidase S16 lon domain protein  33.38 
 
 		 774 aa  501  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.350098  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1288  peptidase S16 lon domain protein  38.42 
 
 		 811 aa  501  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0955  ATP-dependent protease, putative  35.18 
 
 		 797 aa  487  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.099615  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  52.25 
 
 		 660 aa  480  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2053  putative ATP-dependent protease La, putative  38.75 
 
 		 817 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0284052  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1399  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.68 
 
 		 810 aa  391  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000669789  hitchhiker  0.00375305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>