266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3728 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3728  HSP90 family molecular chaperone-like protein  100 
 
 
958 aa  1971    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00163945  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1497  ATPase domain-containing protein  35.67 
 
 
945 aa  422  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0028368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5709  Molecular chaperone HSP90 family-like protein  34.11 
 
 
939 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147781 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1982  metal dependent phosphohydrolase  25.1 
 
 
814 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0121434  decreased coverage  0.00400168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2572  HSP90 family molecular chaperone-like protein  23.05 
 
 
881 aa  97.8  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710884  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4138  ATP-binding region, ATPase-like  24.9 
 
 
887 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322589  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0435  ATP-binding region ATPase domain protein  25.74 
 
 
640 aa  75.1  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2497  heat shock protein 90  26.24 
 
 
632 aa  73.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.558694  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0958  heat shock protein 90  27.23 
 
 
617 aa  73.2  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2002  Heat shock protein Hsp90-like protein  30.81 
 
 
626 aa  73.2  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000463529  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1348  heat shock protein 90  29.1 
 
 
618 aa  72.4  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.323848  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1407  Heat shock protein Hsp90-like protein  22.3 
 
 
623 aa  71.2  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  29.95 
 
 
634 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0237  heat shock protein 90  26.68 
 
 
637 aa  70.1  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.528413  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3587  heat shock protein 90  31.87 
 
 
629 aa  68.9  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  29.95 
 
 
630 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0853  heat shock protein 90  24.52 
 
 
637 aa  68.6  0.0000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.773186  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0044  heat shock protein 90  27.99 
 
 
611 aa  68.2  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  32.26 
 
 
632 aa  68.2  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2368  heat shock protein 90  31.72 
 
 
632 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231362  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1735  heat shock protein 90  31.72 
 
 
632 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2347  heat shock protein 90  31.72 
 
 
632 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75134  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0990  heat shock protein 90  30.62 
 
 
640 aa  67.8  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0890084  normal  0.343937 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1216  heat shock protein 90  29.47 
 
 
632 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1175  heat shock protein 90  25.26 
 
 
650 aa  67.4  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  31.28 
 
 
644 aa  67.8  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2390  heat shock protein 90  28.81 
 
 
650 aa  67  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0044  heat shock protein 90  27.13 
 
 
611 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2342  heat shock protein 90  29.41 
 
 
633 aa  66.6  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0072  heat shock protein 90  26.1 
 
 
626 aa  66.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2370  heat shock protein 90  29.83 
 
 
642 aa  66.2  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0508031  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1625  heat shock protein 90  29.84 
 
 
634 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2383  heat shock protein 90  31.18 
 
 
632 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  24.41 
 
 
639 aa  66.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000100055  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5467  heat shock protein 90  30.56 
 
 
610 aa  65.5  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306325  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0570  heat shock protein 90  23.19 
 
 
616 aa  65.5  0.000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1313  heat shock protein 90  25.71 
 
 
637 aa  65.1  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.133282 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0956  heat shock protein 90  29.12 
 
 
634 aa  65.5  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.538924  normal  0.713469 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0960  heat shock protein 90  26.62 
 
 
626 aa  65.1  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.515332  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0851  heat shock protein 90  29.91 
 
 
643 aa  64.7  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415809  normal  0.667015 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1375  heat shock protein 90  25.83 
 
 
645 aa  64.7  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000122327  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1947  heat shock protein 90  28.02 
 
 
632 aa  64.7  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.76829  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0289  heat shock protein 90  28.02 
 
 
632 aa  64.7  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1318  heat shock protein 90  28.02 
 
 
632 aa  64.7  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  30.11 
 
 
632 aa  64.7  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1158  heat shock protein 90  28.02 
 
 
632 aa  64.7  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789148  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1998  heat shock protein 90  28.57 
 
 
666 aa  64.7  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.154063  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1028  heat shock protein 90  26.62 
 
 
626 aa  64.7  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162426  normal  0.169491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1155  heat shock protein 90  26.62 
 
 
626 aa  64.7  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0859  heat shock protein 90  28.02 
 
 
632 aa  64.7  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1005  heat shock protein 90  28.02 
 
 
632 aa  64.7  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.406773  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1167  heat shock protein 90  28.02 
 
 
632 aa  64.7  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1719  heat shock protein 90  27.13 
 
 
656 aa  64.3  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0416  heat shock protein 90  26.94 
 
 
633 aa  63.9  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000647765  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0920  heat shock protein 90  29.44 
 
 
643 aa  64.3  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  27.37 
 
 
628 aa  64.3  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  27.37 
 
 
628 aa  64.3  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0614  heat shock protein 90  31.15 
 
 
626 aa  64.3  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00438217  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3387  heat shock protein 90  29.89 
 
 
643 aa  63.9  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1538  heat shock protein 90  30.39 
 
 
637 aa  63.9  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0309955  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2491  heat shock protein 90  30.37 
 
 
634 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  30.37 
 
 
634 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_002978  WD1277  heat shock protein 90  23.42 
 
 
635 aa  63.5  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.318066  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1006  heat shock protein 90  26.52 
 
 
612 aa  63.5  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.511721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2498  heat shock protein 90  28.86 
 
 
650 aa  63.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000559019  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0955  heat shock protein 90  28.02 
 
 
632 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464007  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0417  heat shock protein 90  26.61 
 
 
623 aa  63.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0746567  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0413  heat shock protein 90  26.61 
 
 
623 aa  63.5  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  28.29 
 
 
632 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1771  heat shock protein 90  30.61 
 
 
633 aa  63.5  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000171528  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0848  heat shock protein 90  29.69 
 
 
634 aa  62.8  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.846275  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2016  heat shock protein 90  22.83 
 
 
637 aa  62.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2392  heat shock protein 90  25.67 
 
 
646 aa  62.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393625  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2299  heat shock protein 90  22.83 
 
 
637 aa  62.8  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000323275  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4976  heat shock protein 90  24.53 
 
 
678 aa  62.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144438  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  29.83 
 
 
634 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5294  heat shock protein 90  31.15 
 
 
636 aa  62.4  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117014  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  29.83 
 
 
634 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5718  Molecular chaperone HSP90 family-like protein  29.12 
 
 
872 aa  62  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.903577 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1109  heat shock protein 90  29.51 
 
 
639 aa  62  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2506  heat shock protein 90  29.67 
 
 
633 aa  62  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595688  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1086  heat shock protein 90  27.87 
 
 
623 aa  62  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  29.28 
 
 
634 aa  62  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1997  heat shock protein 90  26.67 
 
 
619 aa  61.2  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1779  ATP-binding region ATPase domain protein  26.49 
 
 
613 aa  61.2  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2657  heat shock protein 90  28.19 
 
 
636 aa  61.2  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0502417  hitchhiker  0.00031577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3368  ATP-binding region, ATPase-like  25.2 
 
 
833 aa  61.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76622  hitchhiker  0.00609723 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  24.08 
 
 
624 aa  61.2  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1803  heat shock protein 90  25 
 
 
644 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  27.87 
 
 
636 aa  60.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19170  heat shock protein 90  28.95 
 
 
635 aa  60.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000174366  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1472  heat shock protein 90  30.05 
 
 
615 aa  60.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0532  heat shock protein 90  23.82 
 
 
624 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2251  heat shock protein 90  22.31 
 
 
637 aa  60.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000711928  normal  0.266626 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2323  heat shock protein 90  22.31 
 
 
637 aa  60.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000423215  hitchhiker  0.000689405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2443  heat shock protein 90  22.31 
 
 
637 aa  60.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000425948  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3161  heat shock protein 90  27.98 
 
 
625 aa  60.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0144125 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  24.08 
 
 
624 aa  60.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  23.55 
 
 
635 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  24.08 
 
 
624 aa  60.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>