204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2124 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0472  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2124  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 240 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.908976 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  89.17 
 
 		 240 aa  407  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.82 
 
 		 292 aa  236  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.84 
 
 		 287 aa  235  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.25 
 
 		 285 aa  234  7e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  52.81 
 
 		 285 aa  231  8.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  52.38 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.85 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5868  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.74 
 
 		 271 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  47.5 
 
 		 299 aa  207  8e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  50 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.14 
 
 		 231 aa  174  9e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.4 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.68 
 
 		 258 aa  161  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.19 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1916  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.54 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  38.96 
 
 		 273 aa  141  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.43 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.94 
 
 		 228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.01 
 
 		 226 aa  131  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.93 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.74 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.82 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.3 
 
 		 263 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.3 
 
 		 263 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.4 
 
 		 269 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.43 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.81 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.3 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4059  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.55 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.13 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.91 
 
 		 247 aa  108  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.66 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.54 
 
 		 250 aa  101  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  36.12 
 
 		 338 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36.12 
 
 		 338 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.06 
 
 		 264 aa  99  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.54 
 
 		 328 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.8 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.47 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36.12 
 
 		 1153 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.54 
 
 		 328 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  33.89 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.74 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 		 242 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.8 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.54 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.95 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.95 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.54 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.39 
 
 		 283 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.76 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.84 
 
 		 252 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.98 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.65 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.74 
 
 		 231 aa  89  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.88 
 
 		 262 aa  89  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.02 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2216  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.98 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0194229  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.43 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.02 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.47 
 
 		 246 aa  85.1  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.91 
 
 		 253 aa  85.1  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1072  hypothetical protein  33.85 
 
 		 270 aa  81.6  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  27.82 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.3 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  34.15 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  27.82 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0381  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.67 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853038  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4016  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.46 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.77 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0359  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.77 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.4 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  25.61 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3642  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.73 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748827  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 808 aa  76.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.93 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0086  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.1 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1028  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.37 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1158  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.97 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.426304  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0445  endonuclease / exonuclease / phosphatase family protein  30.08 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.625659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.95 
 
 		 278 aa  72  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.2 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.06 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0048  hypothetical protein  28.74 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00965819  normal  0.1661 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.84 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.49 
 
 		 837 aa  70.1  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00757  predicted DNase  29.96 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2853  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.96 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512011 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0844  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.96 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00774  hypothetical protein  29.96 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24830  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.89 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3616  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.41 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2852  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.96 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.350943  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.29 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0813  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.96 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0192282  normal  0.85473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0854  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.96 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>