32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4623 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4623  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  694    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0044  hypothetical protein  46.42 
 
 		 377 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314723 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  47.06 
 
 		 593 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  44.19 
 
 		 615 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2964  hypothetical protein  44.87 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000129712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2624  hypothetical protein  41.25 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000177581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0182  hypothetical protein  35.37 
 
 		 226 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1125  hypothetical protein  41.03 
 
 		 160 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1166  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 334 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0738188  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0181  hypothetical protein  39.73 
 
 		 299 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1393  TPR repeat-containing protein  38.61 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0235  hypothetical protein  38.75 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0690  hypothetical protein  42.67 
 
 		 241 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0534  TPR repeat-containing protein  39.73 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2627  hypothetical protein  38.46 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000512231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0657  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3831  TPR repeat-containing protein  44.12 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.948329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0306  hypothetical protein  36.25 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279788  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1951  TPR repeat-containing protein  44.12 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1614  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0005  TPR repeat-containing protein  40.58 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153981  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4409  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 620 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1639  hypothetical protein  27.4 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0764738  hitchhiker  0.00145083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1314  hypothetical protein  26.35 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0752  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 634 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100728  normal  0.0772992 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1257  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 464 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4082  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 492 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0004  hypothetical protein  22.73 
 
 		 287 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.971077  hitchhiker  0.000830744 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2840  hypothetical protein  39.19 
 
 		 87 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2856  hypothetical protein  27.43 
 
 		 560 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00133424  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0964  TPR repeat-containing protein  40.58 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3881  hypothetical protein  30 
 
 		 285 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0120157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>