32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2856 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2856  hypothetical protein  100 
 
 
560 aa  1157    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00133424  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3008  hypothetical protein  48.8 
 
 
204 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1129  hypothetical protein  34.15 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3654  hypothetical protein  36.44 
 
 
273 aa  65.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2091  hypothetical protein  35.96 
 
 
302 aa  65.1  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173629  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1811  hypothetical protein  36 
 
 
217 aa  60.5  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106842  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1160  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  59.3  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.452859 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1129  hypothetical protein  32.06 
 
 
215 aa  57.8  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0455873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4746  hypothetical protein  29.49 
 
 
221 aa  57.4  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404087  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4524  hypothetical protein  32.79 
 
 
211 aa  57  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.116106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4036  hypothetical protein  31.68 
 
 
273 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.150015  hitchhiker  0.0050181 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4392  hypothetical protein  31.15 
 
 
208 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0591  hypothetical protein  35 
 
 
219 aa  55.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3681  hypothetical protein  29.71 
 
 
224 aa  54.7  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2130  hypothetical protein  36.89 
 
 
197 aa  54.7  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0005588  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1898  hypothetical protein  31.09 
 
 
275 aa  54.3  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6159  hypothetical protein  32.11 
 
 
289 aa  54.3  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1238  hypothetical protein  35.29 
 
 
236 aa  53.9  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal  0.0188331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1405  hypothetical protein  30.77 
 
 
212 aa  53.9  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0207185  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2624  hypothetical protein  31.76 
 
 
379 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000177581  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18440  hypothetical protein  23.16 
 
 
316 aa  52.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0765744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2559  hypothetical protein  32.54 
 
 
231 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0292  hypothetical protein  30.43 
 
 
202 aa  51.2  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0424844  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4456  hypothetical protein  27.75 
 
 
211 aa  50.8  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.135764  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29990  hypothetical protein  31.53 
 
 
283 aa  50.8  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0490987  normal  0.279629 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0143  hypothetical protein  30.51 
 
 
205 aa  50.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4156  hypothetical protein  30.48 
 
 
259 aa  49.3  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219013  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4576  hypothetical protein  31.15 
 
 
233 aa  49.3  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4994  hypothetical protein  32.99 
 
 
236 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227718  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4623  hypothetical protein  27.43 
 
 
336 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0740  hypothetical protein  30.95 
 
 
291 aa  43.5  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0640  hypothetical protein  44.44 
 
 
226 aa  43.5  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>