262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4461 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  397  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  74.5 
 
 
201 aa  301  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  61.75 
 
 
197 aa  221  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  60.11 
 
 
197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  58.47 
 
 
197 aa  208  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  58.6 
 
 
200 aa  195  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  54.04 
 
 
203 aa  150  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  51.55 
 
 
203 aa  144  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  49.69 
 
 
218 aa  143  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  51.55 
 
 
203 aa  142  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  46.29 
 
 
187 aa  141  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  48.63 
 
 
183 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  45.51 
 
 
207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  45.81 
 
 
203 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  46.67 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  46.76 
 
 
182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  42.86 
 
 
187 aa  128  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  42.24 
 
 
180 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  43.67 
 
 
189 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  39.2 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  43.31 
 
 
188 aa  124  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  45.71 
 
 
203 aa  122  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  43.32 
 
 
207 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  42.33 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  41.46 
 
 
185 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  42.69 
 
 
191 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  43.07 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  39.18 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  37.43 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  43.43 
 
 
191 aa  112  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  39.74 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  43.8 
 
 
227 aa  107  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  38.46 
 
 
206 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  34.48 
 
 
190 aa  105  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  35.98 
 
 
192 aa  104  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  41.77 
 
 
197 aa  104  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  39.57 
 
 
200 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  40.82 
 
 
253 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  38.46 
 
 
204 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  34.66 
 
 
192 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  36.67 
 
 
204 aa  101  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
193 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  38.17 
 
 
199 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  40.67 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  44.72 
 
 
195 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  41.83 
 
 
186 aa  99.4  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  37.87 
 
 
200 aa  99  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  39.18 
 
 
192 aa  99.4  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  37.01 
 
 
193 aa  99  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  37.91 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  38.12 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  36.11 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  37.78 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  37.13 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  32.56 
 
 
181 aa  95.5  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  30.48 
 
 
187 aa  95.9  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  31.79 
 
 
193 aa  95.1  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  40.76 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  33.75 
 
 
190 aa  93.2  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  37.36 
 
 
195 aa  92  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  35.06 
 
 
191 aa  92  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  32.43 
 
 
184 aa  90.9  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  41.13 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  39.31 
 
 
189 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  34.64 
 
 
191 aa  88.2  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  33.69 
 
 
195 aa  86.3  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0217  hypothetical protein  38.22 
 
 
233 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  normal  0.202334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  32.8 
 
 
205 aa  85.1  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  31.98 
 
 
190 aa  84.7  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  34.13 
 
 
241 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  35.03 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  31.72 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  31.55 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  31.17 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  33.99 
 
 
190 aa  82  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  36.49 
 
 
244 aa  82  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  40.97 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  35.29 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  36.49 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  32.34 
 
 
245 aa  78.2  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2595  hypothetical protein  33.54 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  31.61 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  33.54 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  33.95 
 
 
223 aa  72  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  29.79 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1419  protein of unknown function DUF820  30.12 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1385  protein of unknown function DUF820  29.28 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  30.49 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3352  hypothetical protein  30.62 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0400145  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  36.84 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0553  hypothetical protein  34.08 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0174  hypothetical protein  31.85 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2963  protein of unknown function DUF820  31.25 
 
 
153 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  34.11 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  36.49 
 
 
186 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0002  protein of unknown function DUF820  32.76 
 
 
195 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4805  hypothetical protein  31.76 
 
 
186 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0150793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3390  response regulator receiver protein  31.61 
 
 
197 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0820  protein of unknown function DUF820  27.98 
 
 
192 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0980811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4511  protein of unknown function DUF820  32.18 
 
 
195 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>