More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2999 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  100 
 
 
507 aa  1000  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.332062  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2098  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  94.64 
 
 
505 aa  938  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.303697  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  67.27 
 
 
503 aa  662  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0965483  normal  0.0205766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4990  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  61.33 
 
 
504 aa  598  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1936  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.16 
 
 
493 aa  449  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.28992  normal  0.118656 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0986  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.94 
 
 
509 aa  445  1e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0208  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.75 
 
 
506 aa  416  1e-115  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3742  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.56 
 
 
519 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2037  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.27 
 
 
504 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1214  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.19 
 
 
505 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0816  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.52 
 
 
497 aa  331  2e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0853  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.18 
 
 
545 aa  326  5e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0970  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.06 
 
 
545 aa  322  8e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0163848  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0752  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.55 
 
 
545 aa  320  3e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.511316  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_803  NADH:quinone oxidoreductase subunit 4 (chain M)  40.32 
 
 
497 aa  320  4e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  40.32 
 
 
497 aa  320  4e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1864  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.79 
 
 
544 aa  317  3e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0851  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.03 
 
 
545 aa  317  4e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157945  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1598  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.66 
 
 
545 aa  313  4e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.96 
 
 
495 aa  308  2e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0643  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.57 
 
 
544 aa  307  3e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552071  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1252  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.05 
 
 
485 aa  304  2e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.63 
 
 
497 aa  303  5e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1369  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.67 
 
 
549 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137682  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1268  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.67 
 
 
549 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2580  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.67 
 
 
549 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233516  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.98 
 
 
519 aa  296  6e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  36.7 
 
 
522 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1280  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.37 
 
 
554 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  34.95 
 
 
535 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1059  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.74 
 
 
502 aa  291  2e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  35.41 
 
 
501 aa  290  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2049  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.98 
 
 
495 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.4 
 
 
525 aa  290  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.66 
 
 
517 aa  289  7e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.73 
 
 
535 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.44113e-13 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  37.09 
 
 
505 aa  287  3e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  35.9 
 
 
512 aa  286  7e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.61 
 
 
542 aa  285  1e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01299  NADH dehydrogenase subunit M  35.08 
 
 
491 aa  285  1e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648189  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  34.35 
 
 
502 aa  284  2e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1745  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  33.81 
 
 
525 aa  284  2e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.716507  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  37.34 
 
 
503 aa  283  5e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.42 
 
 
542 aa  283  5e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0759  NADH dehydrogenase subunit M  36.29 
 
 
521 aa  283  5e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0790  NADH dehydrogenase subunit M  35.09 
 
 
489 aa  283  5e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0146664  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  34.36 
 
 
496 aa  282  9e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  34.16 
 
 
496 aa  282  9e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  34.16 
 
 
496 aa  282  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  35.5 
 
 
502 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1037  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.14 
 
 
525 aa  281  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.260264  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  36.91 
 
 
503 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  34.16 
 
 
496 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  34.16 
 
 
496 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  34.16 
 
 
496 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  34.16 
 
 
496 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  36.44 
 
 
505 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2614  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain M  36.99 
 
 
564 aa  280  5e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0658114 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  33.2 
 
 
524 aa  280  6e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2796  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  33.66 
 
 
537 aa  279  8e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  35.29 
 
 
502 aa  279  8e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4155  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.19 
 
 
534 aa  279  9e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0166298 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  33.54 
 
 
496 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  33.54 
 
 
496 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  33.54 
 
 
496 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  33.54 
 
 
496 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  33.54 
 
 
496 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  33.54 
 
 
496 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  35.52 
 
 
510 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  36.23 
 
 
505 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  33.54 
 
 
496 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.4 
 
 
507 aa  278  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.89 
 
 
585 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341288  normal  0.991992 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2618  NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  35.23 
 
 
494 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1202  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.04 
 
 
527 aa  278  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.23 
 
 
494 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1073  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.04 
 
 
527 aa  278  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.397792  normal  0.614174 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  33.33 
 
 
496 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3292  NADH dehydrogenase subunit M  34 
 
 
508 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0193  NADH dehydrogenase subunit M  34.38 
 
 
507 aa  277  3e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2819  NADH dehydrogenase subunit M  34.19 
 
 
502 aa  277  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1328  NADH dehydrogenase subunit M  34.87 
 
 
515 aa  277  3e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0365587 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.02 
 
 
542 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3202  NADH dehydrogenase subunit M  34.88 
 
 
496 aa  277  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422188  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1367  NADH dehydrogenase subunit M  34.93 
 
 
504 aa  276  5e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73718  normal  0.0186615 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  33.79 
 
 
504 aa  276  6e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3126  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.58 
 
 
535 aa  276  9e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.23 
 
 
506 aa  275  1e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4549  NADH dehydrogenase subunit M  35.29 
 
 
502 aa  275  1e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.177769 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  36.05 
 
 
503 aa  275  1e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2416  NADH dehydrogenase subunit M  36.36 
 
 
506 aa  275  1e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185861  hitchhiker  0.00201163 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1007  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.83 
 
 
527 aa  274  2e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244989  normal  0.172272 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0511  NADH ubiquinone/plastoquinone complex subunit, putative  37.92 
 
 
488 aa  274  2e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  34.79 
 
 
503 aa  274  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  34.03 
 
 
513 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0150  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.34 
 
 
508 aa  273  4e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000116263  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0474  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40 
 
 
509 aa  273  4e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.229692 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1355  NADH dehydrogenase subunit M  34.48 
 
 
496 aa  273  5e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000992227  normal  0.0345123 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06501  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  36.51 
 
 
524 aa  273  6e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0939  NADH dehydrogenase subunit M  34.16 
 
 
488 aa  273  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.573933  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>