More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0812 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  100 
 
 
585 aa  1152    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  71.35 
 
 
588 aa  789    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  89.74 
 
 
585 aa  1014    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  50.7 
 
 
574 aa  524  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  50.26 
 
 
586 aa  498  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  47.6 
 
 
578 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  50.62 
 
 
605 aa  491  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  46.89 
 
 
588 aa  476  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  43.72 
 
 
571 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  42 
 
 
574 aa  458  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  47.43 
 
 
592 aa  453  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  45.5 
 
 
583 aa  442  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  41.58 
 
 
573 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1620  sulfate transporter  45.68 
 
 
582 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  43.49 
 
 
590 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  42.78 
 
 
572 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  40.21 
 
 
591 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  42.36 
 
 
558 aa  353  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  36.49 
 
 
597 aa  331  3e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  37.43 
 
 
570 aa  330  4e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  39.24 
 
 
588 aa  325  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  39.12 
 
 
584 aa  324  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  37.15 
 
 
570 aa  324  3e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  32.74 
 
 
608 aa  318  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  31.48 
 
 
603 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  35.48 
 
 
577 aa  287  4e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  38.14 
 
 
571 aa  287  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  33.68 
 
 
626 aa  283  6.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  33.28 
 
 
620 aa  282  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  33.63 
 
 
580 aa  280  4e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  34.72 
 
 
588 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  33.63 
 
 
582 aa  273  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  33.27 
 
 
569 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  33.45 
 
 
569 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  32.36 
 
 
584 aa  269  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  32.53 
 
 
573 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  30.8 
 
 
711 aa  267  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  32.14 
 
 
560 aa  264  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  34.49 
 
 
574 aa  264  4e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  33.57 
 
 
581 aa  263  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  32.1 
 
 
579 aa  262  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  32.01 
 
 
583 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  31.3 
 
 
575 aa  259  8e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3023  sulphate transporter  36.3 
 
 
574 aa  258  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.524361  normal  0.25764 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  32.86 
 
 
570 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  34.35 
 
 
584 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  32.64 
 
 
603 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  28.95 
 
 
573 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  32.16 
 
 
570 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  32.66 
 
 
595 aa  253  7e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  32.28 
 
 
568 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  33.39 
 
 
565 aa  252  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  33.16 
 
 
596 aa  253  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  32.28 
 
 
568 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  33.75 
 
 
592 aa  251  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  33.22 
 
 
590 aa  251  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  32.28 
 
 
568 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  31.99 
 
 
570 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  33.1 
 
 
586 aa  249  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3287  sulphate transporter  33.57 
 
 
571 aa  248  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  34.85 
 
 
571 aa  247  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  33.09 
 
 
576 aa  246  9e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  30.76 
 
 
703 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  30.34 
 
 
578 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  31.66 
 
 
703 aa  243  7e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2470  sulphate transporter  39.88 
 
 
706 aa  243  7e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.760506  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  32.52 
 
 
590 aa  243  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  31.96 
 
 
599 aa  243  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  34.47 
 
 
730 aa  240  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  30.69 
 
 
586 aa  240  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  30.14 
 
 
711 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  27.66 
 
 
580 aa  236  9e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  32.8 
 
 
572 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0606  sulphate transporter  35.52 
 
 
599 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.754417 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2275  sulphate transporter  33.91 
 
 
580 aa  234  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.571929 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  33.39 
 
 
521 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1599  sulphate transporter  33.74 
 
 
580 aa  233  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  33.39 
 
 
575 aa  233  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2031  sulfate permease family protein  33.51 
 
 
610 aa  230  7e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1341  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.51 
 
 
610 aa  230  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2321  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.51 
 
 
610 aa  230  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.986632  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  30.76 
 
 
573 aa  230  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1055  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.51 
 
 
610 aa  230  7e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516115  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1427  ulfate transporter family protein  33.33 
 
 
610 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  32.87 
 
 
605 aa  229  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3214  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.33 
 
 
610 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3088  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.33 
 
 
610 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447137  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0094  sulphate transporter  33.45 
 
 
521 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317812  hitchhiker  0.000091476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  31.25 
 
 
522 aa  227  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  30.86 
 
 
565 aa  226  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0075  sulphate transporter  32.6 
 
 
521 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103886  hitchhiker  0.00048278 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  31.68 
 
 
522 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  33.83 
 
 
569 aa  224  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3504  sulphate transporter  33.27 
 
 
576 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5910  sulphate transporter  32.53 
 
 
585 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219176  normal  0.352923 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  33.56 
 
 
573 aa  222  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  32.11 
 
 
522 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0653  sulphate transporter  33.85 
 
 
708 aa  222  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.266407  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2671  sulfate transporter  34.77 
 
 
736 aa  221  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.183061  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2336  sulfate transporter  36.56 
 
 
703 aa  220  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0246739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>