More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0606 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3504  sulphate transporter  62.61 
 
 		 576 aa  648    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0606  sulphate transporter  100 
 
 		 599 aa  1177    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.754417 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  62.61 
 
 		 565 aa  673    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  63.54 
 
 		 572 aa  667    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0049  sulphate transporter  56.29 
 
 		 556 aa  524  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4103  sulphate transporter  59.06 
 
 		 551 aa  519  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2274  sulphate transporter  57.74 
 
 		 556 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1291  sulphate transporter  56.29 
 
 		 556 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1584  sulphate transporter  56.19 
 
 		 556 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  40.07 
 
 		 557 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  38 
 
 		 571 aa  275  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  33.77 
 
 		 569 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  33.77 
 
 		 569 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  33.27 
 
 		 578 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  34.55 
 
 		 574 aa  258  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  34.8 
 
 		 573 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  35.15 
 
 		 556 aa  253  8.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  35.93 
 
 		 585 aa  251  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0765  sulphate transporter  39.49 
 
 		 573 aa  251  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.284221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  33.7 
 
 		 568 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  33.7 
 
 		 568 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  33.52 
 
 		 588 aa  249  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  33.71 
 
 		 568 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  32.66 
 
 		 560 aa  246  9e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3841  sulphate transporter  34.02 
 
 		 583 aa  243  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.0852274 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  32.47 
 
 		 584 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  31.56 
 
 		 590 aa  233  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  32.92 
 
 		 588 aa  231  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  33.1 
 
 		 572 aa  231  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  30.67 
 
 		 571 aa  228  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  31.68 
 
 		 576 aa  227  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  31.92 
 
 		 576 aa  228  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  32.27 
 
 		 575 aa  226  9e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  30.07 
 
 		 578 aa  225  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  34.25 
 
 		 591 aa  225  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  29.9 
 
 		 575 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  32.28 
 
 		 582 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  29.22 
 
 		 565 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  33.57 
 
 		 586 aa  224  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  35.8 
 
 		 585 aa  223  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  36.09 
 
 		 573 aa  221  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1526  sulphate transporter  37.11 
 
 		 570 aa  221  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  32.34 
 
 		 620 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  31.86 
 
 		 588 aa  217  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  30.6 
 
 		 577 aa  216  8e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  29.05 
 
 		 626 aa  215  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  32.19 
 
 		 592 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  28.47 
 
 		 608 aa  213  7e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1270  sulfate permease family protein  33.08 
 
 		 570 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.333072  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1810  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.08 
 
 		 570 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1029  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.08 
 
 		 570 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141667  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1758  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.08 
 
 		 570 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1789  sulfate permease family protein  33.08 
 
 		 570 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.380427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0137  sulfate permease family protein  33.08 
 
 		 570 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  30.91 
 
 		 590 aa  212  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  30.34 
 
 		 580 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1962  sulfate permease family protein  32.89 
 
 		 570 aa  211  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0829811  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  29.68 
 
 		 585 aa  209  9e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  31.71 
 
 		 583 aa  209  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  29.12 
 
 		 583 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  30.66 
 
 		 596 aa  209  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2521  sulphate transporter  33.13 
 
 		 570 aa  209  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.062267 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  31.97 
 
 		 574 aa  209  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2758  sulphate transporter  31.74 
 
 		 574 aa  207  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  29.39 
 
 		 579 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6352  sulphate transporter  29.57 
 
 		 575 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.734551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  33.71 
 
 		 569 aa  207  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  30.36 
 
 		 595 aa  207  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5881  sulphate transporter  31.59 
 
 		 570 aa  206  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  27.57 
 
 		 580 aa  206  8e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  29.04 
 
 		 574 aa  206  8e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  30.12 
 
 		 570 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1630  sulphate transporter  28.72 
 
 		 600 aa  206  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  31.99 
 
 		 590 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  29.49 
 
 		 585 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  29.49 
 
 		 585 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  29.49 
 
 		 585 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  29.49 
 
 		 585 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2524  sulfate permease family protein  33.78 
 
 		 570 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160455  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  28.18 
 
 		 567 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2077  sulfate transporter  30.59 
 
 		 565 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  28.37 
 
 		 573 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  28.7 
 
 		 584 aa  200  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  35.43 
 
 		 587 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2051  sulphate transporter  27.81 
 
 		 579 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.78423  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  28.82 
 
 		 570 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1943  sulfate permease family protein  27.81 
 
 		 579 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331101  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  26.74 
 
 		 573 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  29.06 
 
 		 585 aa  198  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  30.4 
 
 		 590 aa  197  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  29.06 
 
 		 570 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  29.03 
 
 		 586 aa  197  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  28.87 
 
 		 585 aa  197  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  29.69 
 
 		 730 aa  196  9e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  31.62 
 
 		 605 aa  196  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  29.59 
 
 		 585 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4477  sulphate transporter  29.44 
 
 		 624 aa  194  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.496082 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22210  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  30.02 
 
 		 601 aa  194  5e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2603  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2676  sulphate transporter  28.95 
 
 		 567 aa  193  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.143295  hitchhiker  0.000143719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  30.25 
 
 		 570 aa  192  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.130212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>