255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4375 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01759  fumarylacetoacetase  73.63 
 
 		 423 aa  651    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25081 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3924  fumarylacetoacetate hydrolase  80.91 
 
 		 422 aa  717    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4535  fumarylacetoacetase  71.97 
 
 		 423 aa  639    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113775  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4375  fumarylacetoacetase  100 
 
 		 420 aa  867    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00028234  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3463  fumarylacetoacetase  71.97 
 
 		 423 aa  639    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.211156 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0821  fumarylacetoacetase  66.99 
 
 		 434 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.386558  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0719  fumarylacetoacetase  66.75 
 
 		 434 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0338  fumarylacetoacetase  66.75 
 
 		 434 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0790  fumarylacetoacetase  66.75 
 
 		 434 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3914  fumarylacetoacetate hydrolase  65.71 
 
 		 434 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0702  fumarylacetoacetase  66.51 
 
 		 434 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1398  fumarylacetoacetase  64.75 
 
 		 435 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312846  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3899  fumarylacetoacetate hydrolase  65.24 
 
 		 436 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0781  fumarylacetoacetase  65 
 
 		 436 aa  570  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477109  normal  0.394734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2434  fumarylacetoacetase  64 
 
 		 436 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0470374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2562  fumarylacetoacetase  67.15 
 
 		 434 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3227  fumarylacetoacetase  65.55 
 
 		 886 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2055  fumarylacetoacetase  65.31 
 
 		 449 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1920  fumarylacetoacetase  65.31 
 
 		 435 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.882274  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2689  fumarylacetoacetase  65.31 
 
 		 435 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.705809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0857  fumarylacetoacetase  65.31 
 
 		 435 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3577  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3173  fumarylacetoacetase  65.07 
 
 		 449 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3212  fumarylacetoacetase  64.83 
 
 		 435 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1038  fumarylacetoacetase  57.53 
 
 		 429 aa  501  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.318112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1020  fumarylacetoacetase  58.82 
 
 		 422 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.406627  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1558  fumarylacetoacetase  56.25 
 
 		 429 aa  496  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0952524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0567  fumarylacetoacetate hydrolase  58.82 
 
 		 424 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5151  fumarylacetoacetase  58.02 
 
 		 422 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389186  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0909  fumarylacetoacetase  58.13 
 
 		 422 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0926  fumarylacetoacetase  56.9 
 
 		 433 aa  488  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.523606  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0892  fumarylacetoacetase  59.07 
 
 		 421 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2622  fumarylacetoacetate hydrolase  55.42 
 
 		 418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.817563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3806  fumarylacetoacetase  54.55 
 
 		 415 aa  439  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.020804  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3411  fumarylacetoacetase  50.24 
 
 		 427 aa  439  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09238  Fumarylacetoacetase  51.11 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0394103  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1081  fumarylacetoacetase  53.72 
 
 		 420 aa  431  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.075804  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3811  fumarylacetoacetase  54.96 
 
 		 413 aa  417  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.685186  normal  0.278222 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3548  fumarylacetoacetase  51.57 
 
 		 401 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.787467  normal  0.296952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50190  fumarylacetoacetase  51.28 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01896  Fumarylacetoacetase (FAA)(EC 3.7.1.2)(Fumarylacetoacetate hydrolase)(Beta-diketonase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00770]  49.88 
 
 		 431 aa  390  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0911  fumarylacetoacetate hydrolase  48.95 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2036  fumarylacetoacetase  47.32 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94384  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2735  fumarylacetoacetase  46.92 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4480  fumarylacetoacetase  50 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4620  fumarylacetoacetase  49.31 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4604  fumarylacetoacetase  48.84 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00921508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3281  fumarylacetoacetase  50.23 
 
 		 432 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38530  fumarylacetoacetase  50.23 
 
 		 432 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000507003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2109  fumarylacetoacetase  47.85 
 
 		 413 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0101993  normal  0.602779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2044  fumarylacetoacetase  48.24 
 
 		 431 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0798972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2724  fumarylacetoacetate hydrolase  48.48 
 
 		 437 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801091  normal  0.0910704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4887  fumarylacetoacetase  47.76 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1436  fumarylacetoacetate hydrolase  49.28 
 
 		 416 aa  378  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0287  fumarylacetoacetase  48.11 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3789  fumarylacetoacetase  51.11 
 
 		 398 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0818  fumarylacetoacetase  48.61 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0256  fumarylacetoacetate hydrolase  48.46 
 
 		 421 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50281  predicted protein  46.93 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3332  fumarylacetoacetase  51.75 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1118  fumarylacetoacetase  47.06 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1685  fumarylacetoacetase  46.78 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0709  fumarylacetoacetase  46.85 
 
 		 438 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.981478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0100  fumarylacetoacetase  46.39 
 
 		 441 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2007  fumarylacetoacetate hydrolase  47.06 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1916  fumarylacetoacetase  48.76 
 
 		 397 aa  365  1e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00439783  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2380  fumarylacetoacetase  45.92 
 
 		 440 aa  365  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1686  fumarylacetoacetase  47.86 
 
 		 413 aa  364  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1192  fumarylacetoacetase  48.33 
 
 		 435 aa  363  4e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500062  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2996  fumarylacetoacetate hydrolase  45.77 
 
 		 425 aa  363  4e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1870  fumarylacetoacetase  48.44 
 
 		 405 aa  362  8e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1123  fumarylacetoacetase  46.28 
 
 		 437 aa  362  9e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6317  fumarylacetoacetase  48 
 
 		 390 aa  361  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3863  fumarylacetoacetate hydrolase  46.95 
 
 		 426 aa  360  3e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4303  fumarylacetoacetase  47.32 
 
 		 445 aa  359  4e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0432  fumarylacetoacetase  46.12 
 
 		 434 aa  359  5e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2533  fumarylacetoacetase  48.62 
 
 		 436 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3550  fumarylacetoacetase  46.62 
 
 		 431 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.78252  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0706  fumarylacetoacetase  47.51 
 
 		 423 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0906967  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1794  fumarylacetoacetate hydrolase  46.34 
 
 		 436 aa  352  7e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3325  fumarylacetoacetase  48.03 
 
 		 431 aa  352  8e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.736043  normal  0.102364 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7461  fumarylacetoacetate hydrolase  45.22 
 
 		 440 aa  351  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10630  fumarylacetoacetate hydrolase  46.7 
 
 		 412 aa  350  3e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499579  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07020  fumarylacetoacetate hydrolase  48.51 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.257366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1109  fumarylacetoacetase  48.76 
 
 		 394 aa  347  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.242132 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1045  fumarylacetoacetase  47.89 
 
 		 436 aa  347  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6470  fumarylacetoacetase  46.15 
 
 		 404 aa  346  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5612  fumarylacetoacetase  44.88 
 
 		 440 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250904  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8847  Fumarylacetoacetase  47.89 
 
 		 378 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.768181 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5976  fumarylacetoacetase  44.88 
 
 		 440 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000358245  decreased coverage  0.000159634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4256  fumarylacetoacetase  46.15 
 
 		 398 aa  332  5e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0938214 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0995  fumarylacetoacetate hydrolase  43.82 
 
 		 462 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2463  fumarylacetoacetate hydrolase  44.06 
 
 		 431 aa  322  9.999999999999999e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0655  fumarylacetoacetate hydrolase  45.78 
 
 		 391 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4686  fumarylacetoacetase  46.4 
 
 		 398 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.454046  normal  0.30172 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1558  fumarylacetoacetase  43.49 
 
 		 431 aa  312  5.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0529  fumarylacetoacetase  44.93 
 
 		 401 aa  302  7.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08108  fumarylacetoacetate hydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05160)  39.77 
 
 		 435 aa  299  8e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.54519  normal  0.879203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0412  fumarylacetoacetase  42.17 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2528  fumarylacetoacetate hydrolase  40.55 
 
 		 450 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.172477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0090  Fumarylacetoacetase  42.65 
 
 		 394 aa  283  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>