More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0432 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0432  fumarylacetoacetase  100 
 
 		 434 aa  887    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2044  fumarylacetoacetase  72.51 
 
 		 431 aa  604  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0798972 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0287  fumarylacetoacetase  66.03 
 
 		 424 aa  579  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1118  fumarylacetoacetase  67.3 
 
 		 424 aa  580  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2996  fumarylacetoacetate hydrolase  66.35 
 
 		 425 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0256  fumarylacetoacetate hydrolase  64.66 
 
 		 421 aa  543  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50190  fumarylacetoacetase  60.14 
 
 		 444 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2036  fumarylacetoacetase  59.68 
 
 		 438 aa  517  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94384  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4303  fumarylacetoacetase  61.28 
 
 		 445 aa  515  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2724  fumarylacetoacetate hydrolase  56.94 
 
 		 437 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801091  normal  0.0910704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0709  fumarylacetoacetase  55.73 
 
 		 438 aa  482  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.981478 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1123  fumarylacetoacetase  54.94 
 
 		 437 aa  481  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4887  fumarylacetoacetase  55.92 
 
 		 432 aa  474  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2735  fumarylacetoacetase  55.05 
 
 		 429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2380  fumarylacetoacetase  51.83 
 
 		 440 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4620  fumarylacetoacetase  54.76 
 
 		 430 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3863  fumarylacetoacetate hydrolase  55.53 
 
 		 426 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0818  fumarylacetoacetase  55.53 
 
 		 430 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3281  fumarylacetoacetase  55.76 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948022  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2007  fumarylacetoacetate hydrolase  50.58 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38530  fumarylacetoacetase  55.53 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000507003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4480  fumarylacetoacetase  54.76 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3325  fumarylacetoacetase  54.93 
 
 		 431 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.736043  normal  0.102364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0100  fumarylacetoacetase  50.69 
 
 		 441 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4604  fumarylacetoacetase  54.29 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00921508  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3550  fumarylacetoacetase  53.65 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.78252  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0995  fumarylacetoacetate hydrolase  48.39 
 
 		 462 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3332  fumarylacetoacetase  54.11 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0911  fumarylacetoacetate hydrolase  53.33 
 
 		 434 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1685  fumarylacetoacetase  53.4 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1192  fumarylacetoacetase  55.22 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500062  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2463  fumarylacetoacetate hydrolase  53.47 
 
 		 431 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1558  fumarylacetoacetase  54.36 
 
 		 431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1045  fumarylacetoacetase  51.15 
 
 		 436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2533  fumarylacetoacetase  53.33 
 
 		 436 aa  398  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5612  fumarylacetoacetase  46.31 
 
 		 440 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250904  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0412  fumarylacetoacetase  51.48 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5976  fumarylacetoacetase  46.31 
 
 		 440 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000358245  decreased coverage  0.000159634 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1794  fumarylacetoacetate hydrolase  46.54 
 
 		 436 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7461  fumarylacetoacetate hydrolase  45.18 
 
 		 440 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4375  fumarylacetoacetase  46.12 
 
 		 420 aa  359  5e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00028234  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5151  fumarylacetoacetase  47.56 
 
 		 422 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389186  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0719  fumarylacetoacetase  46.8 
 
 		 434 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2434  fumarylacetoacetase  45.09 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0470374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0702  fumarylacetoacetase  46.8 
 
 		 434 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1398  fumarylacetoacetase  46.56 
 
 		 435 aa  356  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312846  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0790  fumarylacetoacetase  45.76 
 
 		 434 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1020  fumarylacetoacetase  46.06 
 
 		 422 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.406627  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2562  fumarylacetoacetase  46.33 
 
 		 434 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3914  fumarylacetoacetate hydrolase  45.87 
 
 		 434 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2528  fumarylacetoacetate hydrolase  45.37 
 
 		 450 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.172477 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0821  fumarylacetoacetase  46.14 
 
 		 434 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.386558  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3924  fumarylacetoacetate hydrolase  45.81 
 
 		 422 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0338  fumarylacetoacetase  45.91 
 
 		 434 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3899  fumarylacetoacetate hydrolase  44.87 
 
 		 436 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0909  fumarylacetoacetase  46.76 
 
 		 422 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0781  fumarylacetoacetase  44.87 
 
 		 436 aa  349  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477109  normal  0.394734 
 
 
-
 
NC_003296  RS01759  fumarylacetoacetase  44.73 
 
 		 423 aa  344  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25081 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2055  fumarylacetoacetase  44.47 
 
 		 449 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1920  fumarylacetoacetase  44.47 
 
 		 435 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.882274  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3212  fumarylacetoacetase  44.47 
 
 		 435 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0857  fumarylacetoacetase  44.47 
 
 		 435 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3577  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2689  fumarylacetoacetase  44.47 
 
 		 435 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.705809  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4535  fumarylacetoacetase  44.63 
 
 		 423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113775  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0567  fumarylacetoacetate hydrolase  47.25 
 
 		 424 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3463  fumarylacetoacetase  44.63 
 
 		 423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.211156 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2622  fumarylacetoacetate hydrolase  45.2 
 
 		 418 aa  343  4e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.817563 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3173  fumarylacetoacetase  44.24 
 
 		 449 aa  343  5e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1038  fumarylacetoacetase  44.11 
 
 		 429 aa  342  9e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.318112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3227  fumarylacetoacetase  44.47 
 
 		 886 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0892  fumarylacetoacetase  47.1 
 
 		 421 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3411  fumarylacetoacetase  41.44 
 
 		 427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1558  fumarylacetoacetase  41.24 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0952524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0926  fumarylacetoacetase  43.65 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.523606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3806  fumarylacetoacetase  44.26 
 
 		 415 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.020804  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09238  Fumarylacetoacetase  39.59 
 
 		 427 aa  325  1e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0394103  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1081  fumarylacetoacetase  45.88 
 
 		 420 aa  318  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.075804  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10630  fumarylacetoacetate hydrolase  45.74 
 
 		 412 aa  318  2e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499579  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3811  fumarylacetoacetase  45.61 
 
 		 413 aa  316  4e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.685186  normal  0.278222 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01896  Fumarylacetoacetase (FAA)(EC 3.7.1.2)(Fumarylacetoacetate hydrolase)(Beta-diketonase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00770]  40.77 
 
 		 431 aa  315  9.999999999999999e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6317  fumarylacetoacetase  46.04 
 
 		 390 aa  315  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1436  fumarylacetoacetate hydrolase  43.46 
 
 		 416 aa  311  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3548  fumarylacetoacetase  43.47 
 
 		 401 aa  310  4e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.787467  normal  0.296952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1916  fumarylacetoacetase  44.89 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00439783  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1870  fumarylacetoacetase  41.71 
 
 		 405 aa  298  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1109  fumarylacetoacetase  44.89 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.242132 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2109  fumarylacetoacetase  41 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0101993  normal  0.602779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0706  fumarylacetoacetase  42.75 
 
 		 423 aa  289  6e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3789  fumarylacetoacetase  42.51 
 
 		 398 aa  288  9e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07020  fumarylacetoacetate hydrolase  42.39 
 
 		 394 aa  286  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.257366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6470  fumarylacetoacetase  38.63 
 
 		 404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0655  fumarylacetoacetate hydrolase  40.94 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1686  fumarylacetoacetase  40.19 
 
 		 413 aa  274  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4256  fumarylacetoacetase  40.33 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0938214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8847  Fumarylacetoacetase  40.35 
 
 		 378 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.768181 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50281  predicted protein  40.48 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0529  fumarylacetoacetase  41 
 
 		 401 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18890  fumarylacetoacetate hydrolase  38.39 
 
 		 412 aa  250  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0251227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4686  fumarylacetoacetase  40.43 
 
 		 398 aa  246  6e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.454046  normal  0.30172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0090  Fumarylacetoacetase  39.01 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>