More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4604 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4620  fumarylacetoacetase  96.98 
 
 
430 aa  863    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0911  fumarylacetoacetate hydrolase  78.06 
 
 
434 aa  696    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4480  fumarylacetoacetase  97.21 
 
 
430 aa  863    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3281  fumarylacetoacetase  78.37 
 
 
432 aa  683    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948022  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0818  fumarylacetoacetase  87.21 
 
 
430 aa  766    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4604  fumarylacetoacetase  100 
 
 
430 aa  879    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00921508  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38530  fumarylacetoacetase  77.91 
 
 
432 aa  679    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000507003  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3550  fumarylacetoacetase  69 
 
 
431 aa  601  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.78252  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3325  fumarylacetoacetase  68.6 
 
 
431 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.736043  normal  0.102364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3332  fumarylacetoacetase  62.96 
 
 
438 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2533  fumarylacetoacetase  65.27 
 
 
436 aa  535  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3863  fumarylacetoacetate hydrolase  62 
 
 
426 aa  533  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1192  fumarylacetoacetase  64.32 
 
 
435 aa  528  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500062  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1045  fumarylacetoacetase  61.54 
 
 
436 aa  529  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2463  fumarylacetoacetate hydrolase  58.12 
 
 
431 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2036  fumarylacetoacetase  58.47 
 
 
438 aa  496  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94384  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2724  fumarylacetoacetate hydrolase  56.58 
 
 
437 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801091  normal  0.0910704 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0412  fumarylacetoacetase  56.94 
 
 
441 aa  473  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784977  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1685  fumarylacetoacetase  56.91 
 
 
429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1558  fumarylacetoacetase  55.35 
 
 
431 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0287  fumarylacetoacetase  55.92 
 
 
424 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2007  fumarylacetoacetate hydrolase  54.31 
 
 
429 aa  462  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79989  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50190  fumarylacetoacetase  55.22 
 
 
444 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4887  fumarylacetoacetase  53.26 
 
 
432 aa  457  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4303  fumarylacetoacetase  54.86 
 
 
445 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1118  fumarylacetoacetase  54.99 
 
 
424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2996  fumarylacetoacetate hydrolase  54.79 
 
 
425 aa  448  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0709  fumarylacetoacetase  53.15 
 
 
438 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.981478 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0256  fumarylacetoacetate hydrolase  55.84 
 
 
421 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2044  fumarylacetoacetase  55.4 
 
 
431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0798972 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0100  fumarylacetoacetase  51.95 
 
 
441 aa  438  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2735  fumarylacetoacetase  52.45 
 
 
429 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1123  fumarylacetoacetase  51.4 
 
 
437 aa  437  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0432  fumarylacetoacetase  54.29 
 
 
434 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7461  fumarylacetoacetate hydrolase  50 
 
 
440 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239921  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5612  fumarylacetoacetase  50.92 
 
 
440 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250904  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5976  fumarylacetoacetase  50.92 
 
 
440 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000358245  decreased coverage  0.000159634 
 
 
-
 
NC_003296  RS01759  fumarylacetoacetase  49.88 
 
 
423 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.25081 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1794  fumarylacetoacetate hydrolase  49.08 
 
 
436 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2380  fumarylacetoacetase  48.85 
 
 
440 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3924  fumarylacetoacetate hydrolase  49.88 
 
 
422 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3899  fumarylacetoacetate hydrolase  50.81 
 
 
436 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0995  fumarylacetoacetate hydrolase  47.33 
 
 
462 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2434  fumarylacetoacetase  50.58 
 
 
436 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0470374  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3914  fumarylacetoacetate hydrolase  51.39 
 
 
434 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0781  fumarylacetoacetase  50.35 
 
 
436 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477109  normal  0.394734 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4375  fumarylacetoacetase  48.84 
 
 
420 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00028234  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0790  fumarylacetoacetase  49.65 
 
 
434 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3806  fumarylacetoacetase  49.4 
 
 
415 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.020804  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1398  fumarylacetoacetase  49.3 
 
 
435 aa  378  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312846  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0338  fumarylacetoacetase  49.88 
 
 
434 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0821  fumarylacetoacetase  50.12 
 
 
434 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.386558  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0719  fumarylacetoacetase  50.7 
 
 
434 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118527  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2055  fumarylacetoacetase  50.47 
 
 
449 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3173  fumarylacetoacetase  50.93 
 
 
449 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0857  fumarylacetoacetase  50.47 
 
 
435 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3577  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1920  fumarylacetoacetase  50.47 
 
 
435 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.882274  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4535  fumarylacetoacetase  46.87 
 
 
423 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113775  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1558  fumarylacetoacetase  44.88 
 
 
429 aa  373  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0952524  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2689  fumarylacetoacetase  50.47 
 
 
435 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.705809  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3463  fumarylacetoacetase  46.87 
 
 
423 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.211156 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0702  fumarylacetoacetase  50.23 
 
 
434 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3212  fumarylacetoacetase  50.23 
 
 
435 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3227  fumarylacetoacetase  50.35 
 
 
886 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2562  fumarylacetoacetase  50.58 
 
 
434 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2528  fumarylacetoacetate hydrolase  47.71 
 
 
450 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.172477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3411  fumarylacetoacetase  44.94 
 
 
427 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5151  fumarylacetoacetase  47.1 
 
 
422 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389186  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2622  fumarylacetoacetate hydrolase  47.88 
 
 
418 aa  363  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.817563 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1038  fumarylacetoacetase  45.45 
 
 
429 aa  362  7.0000000000000005e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.318112  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1020  fumarylacetoacetase  46.5 
 
 
422 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.406627  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0909  fumarylacetoacetase  47.79 
 
 
422 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0926  fumarylacetoacetase  46.65 
 
 
433 aa  356  5.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.523606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0567  fumarylacetoacetate hydrolase  47.49 
 
 
424 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09238  Fumarylacetoacetase  42.01 
 
 
427 aa  352  5.9999999999999994e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0394103  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1081  fumarylacetoacetase  47.75 
 
 
420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.075804  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01896  Fumarylacetoacetase (FAA)(EC 3.7.1.2)(Fumarylacetoacetate hydrolase)(Beta-diketonase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00770]  44.57 
 
 
431 aa  338  9.999999999999999e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2109  fumarylacetoacetase  45.82 
 
 
413 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0101993  normal  0.602779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6317  fumarylacetoacetase  46.29 
 
 
390 aa  337  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3811  fumarylacetoacetase  47.52 
 
 
413 aa  331  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.685186  normal  0.278222 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1109  fumarylacetoacetase  46.27 
 
 
394 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.242132 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0892  fumarylacetoacetase  45.92 
 
 
421 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3548  fumarylacetoacetase  46.23 
 
 
401 aa  325  8.000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.787467  normal  0.296952 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0706  fumarylacetoacetase  46.17 
 
 
423 aa  324  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1916  fumarylacetoacetase  44.39 
 
 
397 aa  324  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00439783  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07020  fumarylacetoacetate hydrolase  45.17 
 
 
394 aa  322  9.000000000000001e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.257366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3789  fumarylacetoacetase  45.41 
 
 
398 aa  319  5e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1870  fumarylacetoacetase  44.1 
 
 
405 aa  317  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335153  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1686  fumarylacetoacetase  43.1 
 
 
413 aa  316  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4256  fumarylacetoacetase  45.26 
 
 
398 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0938214 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50281  predicted protein  40.72 
 
 
417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1436  fumarylacetoacetate hydrolase  43.43 
 
 
416 aa  305  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619546  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6470  fumarylacetoacetase  42.02 
 
 
404 aa  298  8e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8847  Fumarylacetoacetase  43.73 
 
 
378 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.768181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0655  fumarylacetoacetate hydrolase  43.63 
 
 
391 aa  296  7e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10630  fumarylacetoacetate hydrolase  43.51 
 
 
412 aa  292  7e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499579  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18890  fumarylacetoacetate hydrolase  43.34 
 
 
412 aa  290  5.0000000000000004e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0251227  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4686  fumarylacetoacetase  43.84 
 
 
398 aa  277  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.454046  normal  0.30172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0529  fumarylacetoacetase  41.53 
 
 
401 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08108  fumarylacetoacetate hydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05160)  34.72 
 
 
435 aa  243  5e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.54519  normal  0.879203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>