More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1123 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1123  fumarylacetoacetase  100 
 
 		 437 aa  913    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2036  fumarylacetoacetase  61.89 
 
 		 438 aa  575  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94384  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2724  fumarylacetoacetate hydrolase  60.78 
 
 		 437 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801091  normal  0.0910704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50190  fumarylacetoacetase  58.76 
 
 		 444 aa  541  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0709  fumarylacetoacetase  57.67 
 
 		 438 aa  539  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.981478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2996  fumarylacetoacetate hydrolase  59.12 
 
 		 425 aa  536  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0287  fumarylacetoacetase  58.53 
 
 		 424 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4303  fumarylacetoacetase  57.57 
 
 		 445 aa  519  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1118  fumarylacetoacetase  56.55 
 
 		 424 aa  509  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0256  fumarylacetoacetate hydrolase  56.74 
 
 		 421 aa  499  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2380  fumarylacetoacetase  54.59 
 
 		 440 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2044  fumarylacetoacetase  56.19 
 
 		 431 aa  491  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0798972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4887  fumarylacetoacetase  55.3 
 
 		 432 aa  485  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2735  fumarylacetoacetase  55.08 
 
 		 429 aa  485  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0100  fumarylacetoacetase  54.25 
 
 		 441 aa  482  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0432  fumarylacetoacetase  54.94 
 
 		 434 aa  482  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3550  fumarylacetoacetase  53.9 
 
 		 431 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.78252  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2007  fumarylacetoacetate hydrolase  53.24 
 
 		 429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7461  fumarylacetoacetate hydrolase  50.81 
 
 		 440 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0995  fumarylacetoacetate hydrolase  51.04 
 
 		 462 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5612  fumarylacetoacetase  51.61 
 
 		 440 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250904  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5976  fumarylacetoacetase  51.61 
 
 		 440 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000358245  decreased coverage  0.000159634 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0911  fumarylacetoacetate hydrolase  51.76 
 
 		 434 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4620  fumarylacetoacetase  51.97 
 
 		 430 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4480  fumarylacetoacetase  51.74 
 
 		 430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4604  fumarylacetoacetase  51.28 
 
 		 430 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00921508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1794  fumarylacetoacetate hydrolase  48.73 
 
 		 436 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38530  fumarylacetoacetase  52.48 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000507003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0818  fumarylacetoacetase  50.71 
 
 		 430 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2533  fumarylacetoacetase  51.72 
 
 		 436 aa  430  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1192  fumarylacetoacetase  50.92 
 
 		 435 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500062  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3281  fumarylacetoacetase  52.25 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948022  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3863  fumarylacetoacetate hydrolase  49.08 
 
 		 426 aa  428  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3325  fumarylacetoacetase  51.18 
 
 		 431 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.736043  normal  0.102364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3332  fumarylacetoacetase  50.68 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1045  fumarylacetoacetase  49.77 
 
 		 436 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1558  fumarylacetoacetase  49.31 
 
 		 431 aa  413  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2463  fumarylacetoacetate hydrolase  48.73 
 
 		 431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1685  fumarylacetoacetase  48.61 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1020  fumarylacetoacetase  48.73 
 
 		 422 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.406627  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5151  fumarylacetoacetase  47.93 
 
 		 422 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0567  fumarylacetoacetate hydrolase  47.6 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3914  fumarylacetoacetate hydrolase  46.76 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3899  fumarylacetoacetate hydrolase  46.28 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2434  fumarylacetoacetase  46.38 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0470374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0719  fumarylacetoacetase  46.8 
 
 		 434 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1038  fumarylacetoacetase  45.6 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.318112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3411  fumarylacetoacetase  44.91 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0702  fumarylacetoacetase  46.82 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0790  fumarylacetoacetase  46.12 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3924  fumarylacetoacetate hydrolase  46.76 
 
 		 422 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0926  fumarylacetoacetase  46.4 
 
 		 433 aa  371  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.523606  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4375  fumarylacetoacetase  47.1 
 
 		 420 aa  372  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00028234  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0338  fumarylacetoacetase  45.64 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0821  fumarylacetoacetase  45.86 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.386558  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3806  fumarylacetoacetase  45.22 
 
 		 415 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.020804  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_003296  RS01759  fumarylacetoacetase  46.39 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25081 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2562  fumarylacetoacetase  46.31 
 
 		 434 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1398  fumarylacetoacetase  44.98 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0909  fumarylacetoacetase  47.81 
 
 		 422 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1558  fumarylacetoacetase  44.47 
 
 		 429 aa  368  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0952524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0412  fumarylacetoacetase  45.77 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0781  fumarylacetoacetase  44.92 
 
 		 436 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477109  normal  0.394734 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3173  fumarylacetoacetase  46.61 
 
 		 449 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3212  fumarylacetoacetase  46.38 
 
 		 435 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2055  fumarylacetoacetase  46.38 
 
 		 449 aa  362  6e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1920  fumarylacetoacetase  46.38 
 
 		 435 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.882274  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2689  fumarylacetoacetase  46.38 
 
 		 435 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.705809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0857  fumarylacetoacetase  46.38 
 
 		 435 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3577  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3227  fumarylacetoacetase  46.38 
 
 		 886 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3463  fumarylacetoacetase  45.79 
 
 		 423 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.211156 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4535  fumarylacetoacetase  45.79 
 
 		 423 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113775  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09238  Fumarylacetoacetase  44.11 
 
 		 427 aa  357  2.9999999999999997e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0394103  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2109  fumarylacetoacetase  44.26 
 
 		 413 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0101993  normal  0.602779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0892  fumarylacetoacetase  47.25 
 
 		 421 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2528  fumarylacetoacetate hydrolase  42.83 
 
 		 450 aa  349  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.172477 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2622  fumarylacetoacetate hydrolase  44.81 
 
 		 418 aa  333  4e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.817563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1870  fumarylacetoacetase  43.5 
 
 		 405 aa  333  5e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335153  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01896  Fumarylacetoacetase (FAA)(EC 3.7.1.2)(Fumarylacetoacetate hydrolase)(Beta-diketonase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00770]  41.51 
 
 		 431 aa  332  8e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10630  fumarylacetoacetate hydrolase  43.03 
 
 		 412 aa  324  1e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499579  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3789  fumarylacetoacetase  42.55 
 
 		 398 aa  320  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0706  fumarylacetoacetase  43.13 
 
 		 423 aa  319  6e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1686  fumarylacetoacetase  42.14 
 
 		 413 aa  318  9e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6317  fumarylacetoacetase  43.22 
 
 		 390 aa  313  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1081  fumarylacetoacetase  42.72 
 
 		 420 aa  309  8e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.075804  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1436  fumarylacetoacetate hydrolase  42.76 
 
 		 416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1916  fumarylacetoacetase  41.26 
 
 		 397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00439783  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6470  fumarylacetoacetase  41.75 
 
 		 404 aa  306  7e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4256  fumarylacetoacetase  40.38 
 
 		 398 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0938214 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3811  fumarylacetoacetase  43.19 
 
 		 413 aa  300  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.685186  normal  0.278222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07020  fumarylacetoacetate hydrolase  40.92 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.257366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1109  fumarylacetoacetase  41.75 
 
 		 394 aa  293  4e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.242132 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3548  fumarylacetoacetase  40.75 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.787467  normal  0.296952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0655  fumarylacetoacetate hydrolase  40.47 
 
 		 391 aa  291  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50281  predicted protein  40.57 
 
 		 417 aa  283  4.0000000000000003e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4686  fumarylacetoacetase  40.38 
 
 		 398 aa  281  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.454046  normal  0.30172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8847  Fumarylacetoacetase  40.73 
 
 		 378 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.768181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0529  fumarylacetoacetase  40.38 
 
 		 401 aa  276  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18890  fumarylacetoacetate hydrolase  38.78 
 
 		 412 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0251227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0090  Fumarylacetoacetase  40.76 
 
 		 394 aa  239  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>