222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1837 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1837  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  100 
 
 		 510 aa  1039    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.906856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  56.92 
 
 		 513 aa  556  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3731  phosphoglyceromutase  54.22 
 
 		 506 aa  557  1e-157  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  55.47 
 
 		 514 aa  554  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  55.1 
 
 		 512 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  54.79 
 
 		 511 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  55.47 
 
 		 512 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  55.66 
 
 		 512 aa  547  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  53.8 
 
 		 512 aa  541  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  55.23 
 
 		 505 aa  532  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  53.82 
 
 		 512 aa  531  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  53.66 
 
 		 514 aa  531  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4375  phosphoglyceromutase  52.05 
 
 		 510 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1702  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  54.21 
 
 		 511 aa  529  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  52.96 
 
 		 513 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0475  phosphoglyceromutase  53.24 
 
 		 507 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  53.95 
 
 		 516 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  52.25 
 
 		 512 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5029  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  51.81 
 
 		 525 aa  521  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1764  phosphoglyceromutase  52.26 
 
 		 505 aa  522  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  52.75 
 
 		 509 aa  520  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  51.66 
 
 		 512 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1757  phosphoglyceromutase  54.21 
 
 		 513 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000493891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  52.55 
 
 		 509 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  52.55 
 
 		 509 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  52.55 
 
 		 509 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  53.56 
 
 		 513 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  52.55 
 
 		 509 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  52.55 
 
 		 509 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  52.45 
 
 		 509 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1011  phosphoglyceromutase  51.65 
 
 		 532 aa  518  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  53.42 
 
 		 514 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  52.55 
 
 		 509 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  51.37 
 
 		 512 aa  514  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0445  phosphoglyceromutase  51.87 
 
 		 505 aa  513  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  52.25 
 
 		 509 aa  514  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12103  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  50.78 
 
 		 506 aa  514  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208635  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  53.23 
 
 		 510 aa  514  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  52.71 
 
 		 516 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  51.17 
 
 		 533 aa  510  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  51.88 
 
 		 508 aa  510  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  53.14 
 
 		 509 aa  509  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  53.41 
 
 		 509 aa  510  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  53.56 
 
 		 524 aa  511  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  51.98 
 
 		 516 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  51.66 
 
 		 512 aa  508  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  51.94 
 
 		 516 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  53.85 
 
 		 521 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1196  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 		 506 aa  506  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  52.53 
 
 		 514 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  51.66 
 
 		 511 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  50.19 
 
 		 514 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5702  phosphoglyceromutase  51.47 
 
 		 509 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000339151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  52.96 
 
 		 511 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  51.74 
 
 		 516 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  52.33 
 
 		 514 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  51.36 
 
 		 514 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  50.79 
 
 		 514 aa  506  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  53.16 
 
 		 513 aa  504  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  52.37 
 
 		 515 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  52.14 
 
 		 514 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4928  phosphoglyceromutase  51.47 
 
 		 509 aa  504  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.237588  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0816  phosphoglyceromutase  51.57 
 
 		 505 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  50.59 
 
 		 514 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0656  phosphoglyceromutase  53.61 
 
 		 524 aa  504  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  53.16 
 
 		 511 aa  502  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0800  phosphoglyceromutase  51.57 
 
 		 505 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.763349  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  51.95 
 
 		 514 aa  503  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  50.59 
 
 		 514 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  52.17 
 
 		 511 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2546  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  51.37 
 
 		 532 aa  499  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  50.59 
 
 		 514 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  50.59 
 
 		 514 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  50.58 
 
 		 514 aa  500  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  51.95 
 
 		 514 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  50.59 
 
 		 514 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0822  phosphoglyceromutase  53.41 
 
 		 523 aa  501  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  52.07 
 
 		 511 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  50.69 
 
 		 514 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  51.98 
 
 		 511 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  51.17 
 
 		 514 aa  496  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4040  phosphoglyceromutase  50.48 
 
 		 532 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.010334 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  51.94 
 
 		 516 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  51.07 
 
 		 518 aa  498  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  52.57 
 
 		 521 aa  496  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2315  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 		 532 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.619962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  52.37 
 
 		 515 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 		 513 aa  497  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 		 532 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  50.69 
 
 		 514 aa  495  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4391  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 		 520 aa  494  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  50.69 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  50.69 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  51.57 
 
 		 517 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  50.69 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  50.69 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  51.78 
 
 		 511 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  50.69 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  50.69 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>