More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0621 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  100 
 
 		 68 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  67.19 
 
 		 64 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  65.62 
 
 		 64 aa  80.1  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  62.9 
 
 		 64 aa  79.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 66 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  66.13 
 
 		 66 aa  78.2  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  64.06 
 
 		 65 aa  78.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  60 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  72  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  58.73 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  59.38 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  61.29 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  54.84 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 64 aa  68.2  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  67  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18511  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.428259  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18701  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.951627  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  65.5  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  53.12 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1839  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 63 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  53.23 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2768  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2641  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2059  ribosomal protein L35  57.38 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617937  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1978  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378736  normal  0.0703875 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0114  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1969  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00375988  hitchhiker  0.00635162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000771602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1713  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.971881  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0493  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0346  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  51.61 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0154  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>