More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0446 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 240 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  32.84 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  33.8 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  35.47 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  35.47 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  35.47 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  35.47 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  35.47 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  34.58 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  34.58 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  34.98 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.98 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  34.98 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  34.98 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  34.58 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  33.49 
 
 		 228 aa  106  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  35.47 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  33.81 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  35.71 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  36.19 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  34.48 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  34.48 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  33.99 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5105  HAD superfamily hydrolase  30.99 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  34.16 
 
 		 225 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  34.76 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  33.82 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  32.09 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5088  HAD superfamily hydrolase  30.52 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  33.49 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  33.49 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5503  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.52 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  31.39 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  33.49 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  30.92 
 
 		 232 aa  99  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  35.24 
 
 		 234 aa  99.4  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  32.56 
 
 		 224 aa  99  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  35.05 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.58 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5260  HAD superfamily hydrolase  30.05 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5658  HAD superfamily hydrolase  30.05 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  25.98 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5202  HAD family hydrolase  29.52 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  25.98 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  31.53 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  31.13 
 
 		 233 aa  95.9  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  31.73 
 
 		 225 aa  95.5  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  31.73 
 
 		 225 aa  95.5  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  32.52 
 
 		 245 aa  95.1  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  33.82 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  33.01 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5588  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.19 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  31.78 
 
 		 224 aa  95.1  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  32.85 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.3 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  28.88 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  33.19 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  33.33 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  29.25 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3132  HAD superfamily hydrolase  30.92 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3039  HAD superfamily hydrolase  30.92 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0500536  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3072  HAD family hydrolase  30 
 
 		 236 aa  92  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3367  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.43 
 
 		 236 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0780  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.81 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  26.6 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.19 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3145  HAD superfamily hydrolase  30.43 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3392  HAD superfamily hydrolase  30.43 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1053  HAD family hydrolase  28.92 
 
 		 221 aa  90.9  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  29.27 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  34.78 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.27 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  29.27 
 
 		 224 aa  89  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3370  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.38 
 
 		 236 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.013018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3346  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.76 
 
 		 236 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3362  HAD superfamily hydrolase  29.95 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0552975  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  28.57 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1884  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.25 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.54 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.54 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.23 
 
 		 263 aa  86.3  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  30.73 
 
 		 220 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.83 
 
 		 227 aa  85.5  8e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.1 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.06 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  28.08 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  28.29 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  32 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.44 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  29.09 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1234  HAD family hydrolase  25.33 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.86 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  26.47 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1259  HAD family hydrolase  25.33 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.380734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  28.26 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  28.63 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  27.7 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  29.13 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.86 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  27.44 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>