263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0186 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0186  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  100 
 
 
213 aa  427  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626116  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0423  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  63.16 
 
 
211 aa  270  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190408  normal  0.079885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0332  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  64.11 
 
 
211 aa  267  8e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.207205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1067  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  63.64 
 
 
211 aa  266  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2893  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.69 
 
 
213 aa  262  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.15 
 
 
212 aa  262  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.410968  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.71 
 
 
217 aa  261  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85169  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.88 
 
 
214 aa  260  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0557  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.94 
 
 
214 aa  259  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.365319  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2372  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  63.81 
 
 
229 aa  256  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.41 
 
 
214 aa  255  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.01004e-05 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.07 
 
 
215 aa  253  1e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.14 
 
 
215 aa  253  2e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0728  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.85 
 
 
214 aa  249  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.07 
 
 
215 aa  249  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225533  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2568  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.91 
 
 
214 aa  248  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.91 
 
 
214 aa  248  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1243  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.81 
 
 
213 aa  248  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0527508 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2592  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.91 
 
 
214 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984906 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0787  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60 
 
 
212 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.222265 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.57 
 
 
212 aa  245  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.439872  normal  0.298122 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.96 
 
 
214 aa  244  7e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495337 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0107  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.96 
 
 
214 aa  244  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  2.3808e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2494  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.96 
 
 
214 aa  244  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00659427  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2487  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.43 
 
 
214 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0659  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.96 
 
 
214 aa  244  9e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0194138  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0359  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.96 
 
 
214 aa  244  9e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0016328  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0901  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.96 
 
 
214 aa  243  1e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.901665  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.96 
 
 
265 aa  243  1e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  9.6585e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1061  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.96 
 
 
214 aa  243  1e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.040983  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.52 
 
 
212 aa  244  1e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0904  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.96 
 
 
214 aa  243  1e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0158513  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1436  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.81 
 
 
215 aa  243  2e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.35 
 
 
213 aa  243  2e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2616  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.96 
 
 
214 aa  241  4e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0767  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.52 
 
 
212 aa  241  6e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1006  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  58.77 
 
 
217 aa  240  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2922  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60 
 
 
211 aa  240  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.969034 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0521  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.25 
 
 
214 aa  238  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.745375  hitchhiker  0.00802215 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0155  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.71 
 
 
211 aa  238  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.923059  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.92 
 
 
212 aa  238  7e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554957  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2931  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.41 
 
 
224 aa  237  8e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.87 
 
 
213 aa  237  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.88 
 
 
215 aa  236  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.225541  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3713  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.85 
 
 
226 aa  235  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0663  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.55 
 
 
211 aa  234  5e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4286  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.88 
 
 
215 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1165  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.95 
 
 
215 aa  233  2e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0848  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.19 
 
 
217 aa  232  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1129  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.95 
 
 
215 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3853  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.42 
 
 
215 aa  232  4e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0541085  normal  0.804089 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2058  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.4 
 
 
217 aa  231  8e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.183278  normal  0.448099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1229  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.49 
 
 
215 aa  230  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2888  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.97 
 
 
210 aa  230  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877962  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1881  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.4 
 
 
217 aa  229  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3489  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.77 
 
 
214 aa  230  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.481543  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2564  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.4 
 
 
212 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.252364  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4533  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.1 
 
 
202 aa  228  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0424  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.35 
 
 
261 aa  227  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.97035 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.45 
 
 
239 aa  227  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.41957 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.35 
 
 
215 aa  227  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187849  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2989  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.92 
 
 
215 aa  226  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274237  normal  0.310077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1150  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.02 
 
 
215 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.343525  normal  0.105039 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.25 
 
 
224 aa  226  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3944  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.99 
 
 
215 aa  225  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000793587  normal  0.125259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8786  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.93 
 
 
231 aa  224  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2642  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.5 
 
 
212 aa  224  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1693  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.9 
 
 
233 aa  223  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0861149  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1992  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.42 
 
 
213 aa  223  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2378  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.9 
 
 
227 aa  223  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0601  hypothetical protein  49.28 
 
 
215 aa  222  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2059  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.75 
 
 
258 aa  222  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0352298  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0582  hypothetical protein  49.28 
 
 
215 aa  221  5e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0886  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.7 
 
 
214 aa  221  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.45 
 
 
221 aa  221  9e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32246  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1262  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.29 
 
 
212 aa  220  1e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2803  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.67 
 
 
225 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00595972  normal  0.551671 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0394  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.49 
 
 
215 aa  218  5e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.17512  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1311  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.67 
 
 
233 aa  217  9e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279184  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2662  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.48 
 
 
227 aa  217  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0604494  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0417  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.94 
 
 
213 aa  217  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1991  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50 
 
 
218 aa  216  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0105907 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01608  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50 
 
 
218 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3586  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.81 
 
 
215 aa  216  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.63325  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2002  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50 
 
 
218 aa  216  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000269962  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01598  hypothetical protein  50 
 
 
218 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1068  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.2 
 
 
210 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326405  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1714  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50 
 
 
218 aa  216  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2817  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.5 
 
 
211 aa  216  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1561  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50 
 
 
218 aa  216  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.52 
 
 
218 aa  215  3e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0623202  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.24 
 
 
212 aa  215  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0930  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.24 
 
 
212 aa  215  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0829  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.29 
 
 
212 aa  215  5e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1726  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.05 
 
 
232 aa  214  8e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.230905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1830  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.52 
 
 
218 aa  214  8e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2463  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.2 
 
 
216 aa  214  1e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1848  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.05 
 
 
218 aa  214  1e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.20957e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0835  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.79 
 
 
200 aa  213  2e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0443  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.4 
 
 
218 aa  212  3e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.732477  normal  0.141335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>