190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1822 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1822  DNA adenine methylase  100 
 
 		 273 aa  566  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1093  DNA adenine methylase  42.37 
 
 		 286 aa  206  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  hitchhiker  0.000226621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3351  DNA adenine methylase  37.17 
 
 		 274 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3991  DNA adenine methylase  35.06 
 
 		 280 aa  172  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1737  DNA adenine methylase  35.32 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00929025  normal  0.808648 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  33.33 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3347  DNA adenine methylase  33.46 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.758382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0179  DNA adenine methylase  31.99 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000431718  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3363  DNA adenine methylase  32.6 
 
 		 279 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.757208  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2739  DNA adenine methylase  32.6 
 
 		 279 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1368  DNA adenine methylase  34.73 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544834  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04430  DNA adenine methylase  32.41 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  37.72 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  32.71 
 
 		 279 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3140  DNA adenine methylase  32.69 
 
 		 638 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  33.21 
 
 		 279 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1281  DNA adenine methylase  32.09 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329872  normal  0.126066 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1835  DNA adenine methylase  37.18 
 
 		 302 aa  148  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  34.56 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  34.31 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1499  DNA adenine methylase  31.64 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.142483 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3313  DNA adenine methylase  33.58 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0821  DNA adenine methylase  36.59 
 
 		 251 aa  142  8e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0828  DNA adenine methylase  30.04 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.90544  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3321  DNA adenine methylase  31.18 
 
 		 289 aa  139  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2087  DNA adenine methylase  37.04 
 
 		 292 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.674044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0884  DNA adenine methylase  32.03 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1929  DNA adenine methylase  34.59 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0233  DNA adenine methylase  31.65 
 
 		 293 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793505 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1588  DNA adenine methylase  32.01 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1110  retron adenine methylase  32.08 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.588496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0241  DNA adenine methylase  32.7 
 
 		 279 aa  122  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.808773  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1945  DNA adenine methylase  28.62 
 
 		 324 aa  122  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0663  DNA adenine methylase  30.68 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2282  retron adenine methylase  32.45 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.619879  hitchhiker  2.98029e-22 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2656  DNA adenine methylase  33.83 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0703  DNA adenine methylase  29.87 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0202559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0216  DNA adenine methylase  31.44 
 
 		 279 aa  116  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213822 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1003  DNA adenine methylase  28.99 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0410349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  33.07 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1401  DNA adenine methylase  35.91 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.990942  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1513  DNA adenine methylase  28.48 
 
 		 313 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971855  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1068  DNA adenine methylase  29.53 
 
 		 262 aa  112  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.859034  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0177  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.65 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.044334 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1697  hypothetical protein  29.53 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00507  DNA adenine methylase  29.17 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0264  DNA adenine methylase  30.53 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0659762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4081  DNA adenine methylase  29.55 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0343  DNA adenine methylase  29.89 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4110  DNA adenine methylase  29.55 
 
 		 279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.395819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4000  DNA adenine methylase  29.55 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0308  DNA adenine methylase  28.67 
 
 		 310 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0432416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4199  DNA adenine methylase  29.55 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2682  DNA adenine methylase  33.33 
 
 		 263 aa  108  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0463  putative N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  33.65 
 
 		 263 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0917  retron adenine methylase  30.34 
 
 		 285 aa  108  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000765231  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4262  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.26 
 
 		 279 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349455 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5483  DNA adenine methylase  30.65 
 
 		 265 aa  108  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0181  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.37 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3839  DNA adenine methylase  29.06 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.236937  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3695  DNA adenine methylase  29.92 
 
 		 279 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3058  retron adenine methylase  29.96 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.99248 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1923  DNA adenine methylase  29.53 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595545  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3728  DNA adenine methylase  32.64 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4602  DNA adenine methylase  33.66 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0997785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20420  DNA adenine methylase Dam  33.65 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.180762 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0344  DNA adenine methylase  29.7 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1756  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.64 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.663014  normal  0.0339487 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1638  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.21 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.355798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0263  DNA adenine methylase  32.68 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.262484  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3891  DNA adenine methylase  29.55 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.728671 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1090  DNA adenine methylase  33.77 
 
 		 264 aa  105  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0690  DNA adenine methylase  28.68 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0517  DNA adenine methylase  28.76 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13128  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0151  DNA adenine methylase  27.85 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.851887  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0228  DNA adenine methylase  33.17 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0459983  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0250  DNA adenine methylase  29.66 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1850  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.04 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000906575  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3365  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.55 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0847  DNA adenine methylase  27.96 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3963  DNA adenine methylase  33.17 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102575  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00025  DNA adenine methylase  27.76 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3724  DNA adenine methylase  33.17 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00179541  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0289  DNA adenine methylase  29.66 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0378  DNA adenine methylase  28.41 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3800  DNA adenine methylase  28.41 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0708  DNA adenine methylase  28.29 
 
 		 272 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4057  DNA adenine methylase  33.17 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000515222  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3703  DNA adenine methylase  28.79 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0458  DNA adenine methylase  28.34 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0922232  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03239  DNA adenine methylase  27.86 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0326  DNA adenine methylase  27.86 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4691  DNA adenine methylase  27.86 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.368907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03191  hypothetical protein  27.86 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277924  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2786  DNA adenine methylase  28.3 
 
 		 284 aa  102  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0697189  normal  0.0136814 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0326  DNA adenine methylase  27.86 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.168189  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3764  DNA adenine methylase  27.86 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0637881  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3583  DNA adenine methylase  27.86 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0033886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3857  DNA adenine methylase  27.86 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00206502  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3905  DNA adenine methylase  28.02 
 
 		 235 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>