250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1420 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1420  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 561 aa  1140    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2578  response regulator receiver protein  50.56 
 
 		 577 aa  535  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000176794 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3634  response regulator receiver  53.17 
 
 		 587 aa  530  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1169  two component transcriptional regulator, AraC family  29.94 
 
 		 549 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4101  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  28.48 
 
 		 572 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2318  response regulator receiver protein  27.99 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0477  response regulator receiver domain-containing protein  29.79 
 
 		 537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0359  putative PAS/PAC sensor protein  28.73 
 
 		 560 aa  126  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0897  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 546 aa  126  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1854  response regulator receiver domain-containing protein  28.33 
 
 		 549 aa  124  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.274781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2074  response regulator receiver domain-containing protein  28.83 
 
 		 551 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2920  response regulator receiver protein  26.99 
 
 		 538 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0284416  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1458  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.893415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0145  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  30.14 
 
 		 449 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1457  response regulator receiver protein  29.33 
 
 		 421 aa  113  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3496  TPR repeat-containing response regulator  28.34 
 
 		 533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1911  response regulator/TPR domain protein  28.34 
 
 		 533 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.014975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4261  response regulator receiver domain-containing protein  26.73 
 
 		 534 aa  107  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1176  response regulator receiver protein  29.06 
 
 		 540 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01935  Response regulator with TPR repeat  24.15 
 
 		 546 aa  104  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0768  response regulator/TPR domain-containing protein  28.05 
 
 		 535 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0809  response regulator receiver protein  28.05 
 
 		 535 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0795  response regulator receiver protein  28.05 
 
 		 535 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184844 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02197  response regulator receiver protein  26.39 
 
 		 540 aa  99.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00179351  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4421  response regulator receiver protein  27.2 
 
 		 535 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06171  hypothetical protein  28.45 
 
 		 555 aa  95.5  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2579  response regulator receiver protein  22.93 
 
 		 547 aa  95.5  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0041  response regulator  22.41 
 
 		 535 aa  83.6  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1257  response regulator VieB  25 
 
 		 553 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00784807  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01769  response regulator receiver protein  22.65 
 
 		 561 aa  77.8  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.4688  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1268  response regulator receiver protein  23.46 
 
 		 513 aa  65.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 129 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  33.91 
 
 		 128 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 129 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  34.19 
 
 		 148 aa  62  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  31.85 
 
 		 126 aa  61.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 127 aa  61.2  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  33.91 
 
 		 130 aa  61.2  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 126 aa  60.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 139 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 129 aa  60.5  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 132 aa  60.1  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  34.19 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  34.19 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  33.91 
 
 		 126 aa  59.3  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  34.19 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  33.91 
 
 		 130 aa  58.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 123 aa  58.9  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 127 aa  58.9  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  34.78 
 
 		 131 aa  58.9  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  34.19 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  31.09 
 
 		 124 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 127 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  30.08 
 
 		 137 aa  58.5  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 127 aa  58.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 878 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01904  CheY-like receiver protein  19.44 
 
 		 533 aa  58.2  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.466885  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  33.04 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  33.91 
 
 		 122 aa  58.2  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  32.48 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  32.48 
 
 		 124 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 126 aa  57.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  33.91 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  32.5 
 
 		 131 aa  57.4  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 123 aa  57.4  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  33.04 
 
 		 129 aa  57.4  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 129 aa  57.8  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  33.91 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 127 aa  57.4  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4001  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain-containing protein  33.06 
 
 		 229 aa  57  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 128 aa  57  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  31.58 
 
 		 535 aa  57  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.55 
 
 		 810 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 128 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 124 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  31.2 
 
 		 134 aa  56.6  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 		 127 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 133 aa  56.2  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  33.91 
 
 		 130 aa  55.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  30 
 
 		 127 aa  55.5  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  31.62 
 
 		 127 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 133 aa  56.2  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  32.17 
 
 		 128 aa  55.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  31.67 
 
 		 132 aa  55.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  33.91 
 
 		 130 aa  55.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 207 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  30.77 
 
 		 129 aa  55.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.64 
 
 		 256 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  30.77 
 
 		 129 aa  55.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  30.77 
 
 		 129 aa  55.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  30.77 
 
 		 129 aa  55.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>