40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4143 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4143  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 234 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.444862  normal  0.0250371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  88.89 
 
 		 234 aa  395  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  57.21 
 
 		 237 aa  261  6e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3830  phosphatidate cytidylyltransferase  32.39 
 
 		 232 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  31.33 
 
 		 235 aa  98.6  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  31.76 
 
 		 236 aa  94  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  29.18 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2266  protein of unknown function DUF92 transmembrane  33.62 
 
 		 516 aa  86.7  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  28.45 
 
 		 225 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  28.21 
 
 		 225 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21791  dolichol kinase  28.9 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1306  hypothetical protein  28.44 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2294  hypothetical protein  32.65 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2359  phosphatidate cytidylyltransferase  32.39 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29961  dolichol kinase  30.15 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  32.57 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18321  dolichol kinase  27.14 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0030  phosphatidate cytidylyltransferase  27.91 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0036147  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18891  dolichol kinase  26.03 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2171  phosphatidate cytidylyltransferase  30 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2665  hypothetical protein  30.73 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.643893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2225  phosphatidate cytidylyltransferase  30.7 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0743  protein of unknown function DUF92 transmembrane  31.22 
 
 		 525 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0893181  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0746  protein of unknown function DUF92 transmembrane  29.41 
 
 		 521 aa  64.7  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.213381 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  31.13 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19081  dolichol kinase  23.85 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0239  hypothetical protein  28.37 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.978297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1791  hypothetical protein  23.68 
 
 		 213 aa  62  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18891  hypothetical protein  25.97 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1951  phosphatidate cytidylyltransferase  24.77 
 
 		 444 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1715  protein of unknown function DUF92 transmembrane  27.45 
 
 		 509 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1936  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  36.05 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0524  phosphatidate cytidylyltransferase  28.86 
 
 		 183 aa  45.8  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0610  membrane protein  31.06 
 
 		 526 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0855  hypothetical protein  29.2 
 
 		 526 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  36.51 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2165  protein of unknown function DUF92 transmembrane  27.85 
 
 		 526 aa  42  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.937448  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  32.59 
 
 		 197 aa  42.4  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0625007  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1186  phosphatidate cytidylyltransferase  39.42 
 
 		 204 aa  42  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>