30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2101 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2101  putative AtsE  100 
 
 		 132 aa  266  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3343  putative AtsE  87.02 
 
 		 132 aa  231  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.578122  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  80.92 
 
 		 132 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3252  putative AtsE  82.93 
 
 		 132 aa  216  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03440  AtsE  47.66 
 
 		 132 aa  123  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2176  hypothetical protein  45.11 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  32.62 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0764  AtsE  34.56 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550753  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1980  AtsE  36.15 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  31.91 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  32.85 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2253  AtsE  33.59 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.797018  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  28.87 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  30.28 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  30.88 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  30.15 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3884  hypothetical protein  30.88 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985147  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  28.57 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2873  hypothetical protein  28.37 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  25.18 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0390  hypothetical protein  30.59 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  25.18 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0125  hypothetical protein  31.25 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3521  AtsE protein  29.36 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  26.42 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  31.01 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  27.78 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5481  hypothetical protein  26.55 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222259  normal  0.850056 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2693  hypothetical protein  32.5 
 
 		 164 aa  40  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7762  hypothetical protein  28.99 
 
 		 83 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.0323872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>