More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4741 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
298 aa  610  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.344119  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1822  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  72.24 
 
 
300 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17856  normal  0.132838 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5321  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.62 
 
 
301 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4779  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.81 
 
 
299 aa  250  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862255  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5246  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.81 
 
 
299 aa  249  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0670  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.8 
 
 
300 aa  248  9e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1849  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.49 
 
 
300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933483  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4754  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.95 
 
 
302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.41 
 
 
350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.46 
 
 
282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0223  putative regulatory protein  32.49 
 
 
284 aa  106  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.2 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.19 
 
 
263 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  29.7 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.06 
 
 
263 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.32 
 
 
263 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  28.46 
 
 
265 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.31 
 
 
304 aa  92.4  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  29.06 
 
 
263 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.06 
 
 
263 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  28.02 
 
 
262 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  27.55 
 
 
262 aa  89.4  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.44 
 
 
277 aa  89.4  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  28.74 
 
 
262 aa  89  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  28.74 
 
 
262 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.41 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5943  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.99 
 
 
252 aa  86.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4349  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.68 
 
 
295 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.46 
 
 
265 aa  85.9  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.48 
 
 
258 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0855  ParA family protein  29.63 
 
 
365 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.72 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  29.23 
 
 
259 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.66 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.66 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3541  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.17 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555008  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1631  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.42 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423414  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  28.96 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.23 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.39 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1217  ParA family protein  27.57 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.71 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  31.28 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  31.9 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  28.79 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.96 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1442  chromosome partitioning ATPase  28.83 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.526471  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  33.49 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.82 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  30.1 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.77 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.77 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  30.77 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  30.77 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.77 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  30.77 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.77 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.41 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.69 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000176763 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.72 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  31.44 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.17 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  27.41 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.73 
 
 
263 aa  82  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  29.17 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0017  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.07 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.405459  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.73 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.52 
 
 
257 aa  82  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.85 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.95 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1423  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.26 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854251  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.96 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  32.98 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.88 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.79 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.9 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  30.85 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0040  ParaA family ATPase  31.46 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00514136  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0915  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.66 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412343  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.45 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.1 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  28.71 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0054  chromosome segregation ATPase  28.08 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0051  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.14 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0497583  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  29.43 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.98 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  29.65 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.85 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.43 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457165  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  28.24 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.71 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  31.63 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  26.54 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  29.62 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  30.77 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  29.34 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2474  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.29 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00522516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>